Sobemovirus - Sobemovirus - Wikipedia
| Sobemovirus | |
|---|---|
 | |
| Genom viru mozaiky sesbania | |
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Riboviria |
| Království: | Orthornavirae |
| Kmen: | Pisuviricota |
| Třída: | Pisoniviricetes |
| Objednat: | Sobelivirales |
| Rodina: | Solemoviridae |
| Rod: | Sobemovirus |
Sobemovirus je rod viry. Rostliny slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje 14 druhů v tomto rodu, včetně druhů druhů Virus mozaiky jižní fazole. Mezi nemoci spojené s tímto rodem patří: mozaiky a skvrny.[1][2]
Struktura
Viry v Sobemoviru jsou neobalené, s ikosahedrální geometrií a T = 3 symetrií. Průměr je kolem 30 nm.[1]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Sobemovirus | Icosahedral | T = 3 | Neobalené | Lineární | Monopartitní |
Genom
The genom je jeden kus lineárního, pozitivního smyslu, jednovláknového RNA, 4100–5700 nukleotidy v délce.[3] Genom kóduje pět otevřených čtecích rámců: ORF1, ORF 2a a 2b, ORF3 a ORFx.[4]
ORF1 kóduje P1, který hraje roli při potlačení umlčování a pohybu viru.
ORF 2a a 2b kódují replikační polyproteiny P2a a P2ab. Překlad ORF2a z genomové RNA závisí na děravém skenovacím mechanismu.[Citace je zapotřebí ]
ORF3 kóduje obalový protein.[Citace je zapotřebí ]
ORFx je konzervován ve všech sobemovirech. Překrývá 5 'konec ORF2a ve čtecím rámci +2 a také prodlužuje určitou vzdálenost před ORF2a. Postrádá iniciační kodon AUG a předpokládá se, že jeho exprese bude záviset na iniciaci na nízké úrovni v blízce příbuzných kodonech jiných než AUG, jako je CUG, podílem ribozomů, které skenují oblast mezi iniciačními kodony ORF1 a ORF2a. Jeho funkce není známa, ale zdá se, že je nezbytná pro infekci.[Citace je zapotřebí ]
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky. Replikace sleduje model replikace pozitivního řetězce RNA viru. Transkripce pozitivního řetězce RNA viru je metoda transkripce. Překlad probíhá děravým skenováním a -1 posunem ribozomálních rámců. Virus opouští hostitelskou buňku virovým pohybem vedeným tubulem. Rostliny slouží jako přirozený hostitel. Virus se přenáší prostřednictvím vektoru (CFMV: hmyz). Přenosové cesty jsou vektorové a semenné.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sobemovirus | Rostliny | Žádný | Penetrace | Virové hnutí | Cytoplazma | Cytoplazma | Vektor, nesený osivem |
Taxonomie
Druhy zahrnuté do rodu jsou:
- Borůvkový šňůrový virus
- Virus skvrnité nohy
- Virus žluté skvrnitosti Imperata
- Přechodný virus lucerny
- Papaya smrtící žloutnutí virus
- Virus žluté skvrny rýže
- Virus skvrnité žížaly
- Virus mozaiky Sesbania
- Virus skvrnitosti Solanum nodiflorum
- Virus mozaiky jižní fazole
- Virus mozaiky jižní cowpea
- Virus mozaiky Sowbane
- Virus skvrnitosti jetele podzemního
- Virus růžice tuřínu
- Virus skvrnitého tabáku
Reference
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- ^ ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
- ^ Rejstřík virů - Sobemovirus (2006). In: ICTVdB — The Universal Virus Database, verze 4. Büchen-Osmond, C (Ed), Columbia University, New York, USA.[stránka potřebná ]
- ^ Ling, Roger; Pate, Adrienne E; Carr, John P; Firth, Andrew E (2013). „Nezbytný pátý kódující ORF v sobemovirech“. Virologie. 446 (1–2): 397–408. doi:10.1016 / j.virol.2013.05.033. PMC 3791421. PMID 23830075.