Malá nukleolární RNA TBR12 - Small nucleolar RNA TBR12
| snoTBR12 | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence malé nukleolární RNA TBR12 | |
| Identifikátory | |
| Rfam | RF02789 |
| Další údaje | |
| Domény | Eukaryota |
| JÍT | GO termín musí začínat GO:,GO termín musí začínat GO: |
| TAK | SO: 0000593 |
| PDB struktur | PDBe |
Malá nukleolární RNA TBR12 je nekódující RNA (ncRNA) molekula identifikovaná v Trypanosoma brucei který funguje při modifikaci jiných malé jaderné RNA (snRNA). Tento typ modifikující RNA se obvykle nachází v jádro z eukaryotická buňka což je hlavní místo biogeneze snRNA. Je znám jako malá nukleolární RNA (snoRNA) a také se často označuje jako vodicí RNA.
snoRNA TBR12 patří do C / D box třída snoRNA, které obsahují konzervované sekvenční motivy známé jako C box (UGAUGA) a D box (CUGA). Většina členů rodiny boxů C / D přímá 2'-O- specifická pro daný webmethylace substrátových RNA.[1]
TBR12 byla jednou ze sedmnácti snoRNA identifikovaných v Trypanosoma brucei podle imunoprecipitace s anti-fibrillarinovými protilátkami.[2] Dohromady s TBR4, TBR6 a TBR2 je to část shluku genů snoRNA, která se tandemově opakuje. Tyto 4 geny pro snoRNA jsou transkribovány jako transkript polycistronové RNA.[3]
Další snoRNA
Reference
- ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (říjen 2002). „Purifikovaný box C / D snoRNP je schopen reprodukovat místně specifickou 2'-O-methylaci cílové RNA in vitro“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
- ^ A b Dunbar DA, Wormsley S, Lowe TM, Baserga SJ (květen 2000). „Fibrillarinem spojená box / C malá nukleolární RNA v Trypanosoma brucei. Zachování sekvence a důsledky pro methylaci rRNA 2'-O-ribózou“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (19): 14767–76. doi:10.1074 / jbc.m001180200. PMID 10747997.
- ^ Dunbar DA, Chen AA, Wormsley S, Baserga SJ (srpen 2000). „Geny pro malé nukleolární RNA v Trypanosoma brucei jsou uspořádány do shluků a jsou přepisovány jako polycistronová RNA.“. Výzkum nukleových kyselin. 28 (15): 2855–61. doi:10.1093 / nar / 28.15.2855. PMC 102681. PMID 10908346.