ShelXle - ShelXle - Wikipedia

ShelXle
hlavní okno ShelXle se strukturou C60F18
hlavní okno ShelXle se strukturou C60F18
VývojářiChristian B. Hübschle
První vydání2011
Stabilní uvolnění
1. 8. 825 / 28. ledna 2017 (2017-01-28)
NapsánoC ++
Operační systémOkna, Linux, Operační Systém Mac
TypMolekulární modelování
LicenceGNU Lesser General Public License
webová stránkahttp://www.shelxle.org/index.php

Program ShelXle [1] je grafické uživatelské rozhraní pro program zdokonalování struktury SHELXL.[2] ShelXle kombinuje editor se zvýrazněním syntaxe pro soubory INS (vstupní) a .RES (výstupní) spojené s SHELXL s interaktivním grafickým displejem pro vizualizaci trojrozměrné struktury včetně elektronové hustoty (Fo) a rozdílové hustoty (Fo- Fc) mapy.

Přehled

ShelXle může zobrazovat mapy elektronové hustoty jako makromolekulární program Lyska (program) ale je více určen pro menší molekuly. Existuje řada vynikajících grafických uživatelských rozhraní (GUI) pro zdokonalování krystalové struktury malých molekul pomocí SHELX (např. WINGX,[3] Olex2,[4] XSEED,[5] PLATON a SYSTEM-S,[6] a Bruker programy XP a XSHELL)

ShelXle je svobodný software, distribuováno pod GNU LGPL. Je k dispozici na webu ShelXle webové stránky nebo z SourceForge http://sourceforge.net/projects/shelxle/ . Binární soubory jsou k dispozici pro distribuce Windows, macOS a Linux SuSE, Debian a Ubuntu. Windows binární je distribuován s Instalační program NSIS.

Funkce

  • Editor představovat Zvýraznění syntaxe a Vyplňování kódu pro pokyny SHELX.
  • Kliknutím na atom v zobrazení struktury nastavíte textový kurzor na řádek, který obsahuje tento atom.
  • Umístění atomů ve strukturním pohledu z editoru.
  • Přejmenovat režim s podporou zbytky a neuspořádaný části a volné proměnné.

Architektura programu

ShelXle používá Qt (rámec). Je napsán celý v jazyce C ++ a žádné nepoužívá Skriptovací jazyk. Pro upřesnění volá externí binární soubor SHELXL, který může být také SHELXH, SHELXLMP z George M. Sheldrick nebo XL z Bruker.

SHELX

SHELX[2] je vyvinut společností George M. Sheldrick od konce 60. let. Důležité verze jsou SHELX76 a SHELX97. Je stále vyvíjen, ale vydání jsou obvykle po deseti letech testování. Akademičtí uživatelé si po registraci mohou programy SHELX volně stáhnout.[7]

externí odkazy

Reference

  1. ^ Hübschle, Christian B .; Sheldrick, George M .; Dittrich, Birger (12. listopadu 2011). „ShelXle: grafické uživatelské rozhraní Qt pro SHELXL“. Journal of Applied Crystallography. 44 (6): 1281–1284. doi:10.1107 / S0021889811043202. PMC  3246833. PMID  22477785.
  2. ^ A b Sheldrick, George M. (21. prosince 2007). „Krátká historie SHELXU“. Acta Crystallographica oddíl A. 64 (1): 112–122. Bibcode:2008AcCrA..64..112S. doi:10.1107 / S0108767307043930. PMID  18156677.
  3. ^ Farrugia, Louis J. (1. srpna 1999). "Sada WinGX pro monokrystalickou krystalografii s malou molekulou". Journal of Applied Crystallography. 32 (4): 837–838. doi:10.1107 / S0021889899006020.
  4. ^ Dolomanov, Oleg V .; Bourhis, Luc J .; Gildea, Richard J .; Howard, Judith A. K .; Puschmann, Horst (24. ledna 2009). "OLEX2: kompletní řešení struktury, program zdokonalení a analýzy". Journal of Applied Crystallography. 42 (2): 339–341. doi:10.1107 / S0021889808042726.
  5. ^ Barbour, Leonard J. (2001). „X-Seed - softwarový nástroj pro supramolekulární krystalografii“. J. Supramol. Chem. 1 (4–6): 189–19. doi:10.1016 / S1472-7862 (02) 00030-8.
  6. ^ Spek, Anthony L. (20. ledna 2009). "Validace struktury v chemické krystalografii". Acta Crystallographica oddíl D. 65 (2): 148–155. doi:10.1107 / S090744490804362X. PMC  2631630. PMID  19171970.
  7. ^ „Domovská stránka SHELX“. shelx.uni-goettingen.de. Citováno 2016-09-06.