Segregační web - Segregating site

Oddělovací weby jsou pozice, které ukazují rozdíly (polymorfismy ) mezi příbuznými geny v a zarovnání sekvence (nejsou konzervovaný ).[1] Segregační weby zahrnují konzervativní, semikonzervativní a nekonzervativní mutace.

Podíl segregujících míst v genu je důležitou statistikou populační genetika protože to lze použít k odhadu rychlost mutace za předpokladu, že ne výběr. Například se používá k výpočtu Tajima's D statistika neutrálního vývoje.

A zarovnání sekvence, produkovaný ClustalO, ze savců histon bílkoviny.
Sekvence jsou aminokyseliny pro zbytky 120 - 180 proteinů. Zbytky, které jsou konzervovány ve všech sekvencích, jsou zvýrazněny šedě. Pod proteinovými sekvencemi je klíč označující konzervovaná sekvence (*), konzervativní mutace (:), semikonzervativní mutace (.) a nekonzervativní mutace ().[2]

Viz také

Reference

  1. ^ Fu, YX (říjen 1995). Msgstr "Statistické vlastnosti segregujících lokalit". Teoretická populační biologie. 48 (2): 172–97. doi:10.1006 / tpbi.1995.1025. PMID  7482370.
  2. ^ „Clustal FAQ #Symbols“. Clustal. Citováno 8. prosince 2014.