Produkce semen a rozmanitost genů - Seed production and gene diversity

Genetická rozmanitost je často hlavním hlediskem např. Lesních plodin.

Skupinový společný původ populace

Zvažte genofond a semenný sad plodiny nebo jiného zdroje semen u rodičů. Genofond je velký, protože v semenných plodinách je mnoho semen, takže žádný není genetický drift. Pravděpodobnost, že první gen pochází z genotypu i v semenném sadu, je p_ia pravděpodobnost, že druhá pochází z genotypu j, je p_j. Pravděpodobnost, že tyto dva geny pocházejí z genotypů sadů i a j jsou shodné podle původu (IBD), je θ_ij. To je Malecotova metoda soužití ^[1] (nebo „koeficient příbuznosti“; „koeficient vztahu“ je podobné měřítko, které lze vypočítat) mezi genotypem i a j. Pravděpodobnost, že některý pár genů je IBD, can, lze zjistit sečtením všech možných párů genů od N rodičů. Vzorec pro společný původ (ze kterého lze získat genovou rozmanitost) semenných plodin.^[2]

Θ =${displaystyle sum _ {i = 1} ^ {N} součet _ {j = 1} ^ {N}}$ p_ip_jθ_ij.
Skupinový spoluvlastník plodiny semenného sadu lze rozdělit na dva výrazy, jeden pro sebeovládání a druhý pro křížové spoluvlastnictví.

Θ =${displaystyle sum _ {i = 1} ^ {N}}$ p_i²(1 + F.)_i)/2 + ${displaystyle sum _ {i = 1} ^ {N}}$ ${displaystyle sum _ {j = 1} ^ {N}}$ p_ip_jθ_ij, poslední součet kromě j = i.

Zvažme jednoduchý případ. Pokud genotypy semenného sadu nesouvisí, druhý termín je nulový, pokud neexistuje příbuzenská plemenitba, první termín se stává jednoduchým. Bez příbuznosti a příbuzenské plemenitby, stavové číslo (N_S, efektivní počet rodičů)

N_S = 1/${displaystyle sum _ {i = 1} ^ {N}}$ p_i²

Podobné, ale méně rozvinuté výrazy byly použity mnohokrát dříve, má podobnosti s konceptem efektivní velikosti populace, jak je definován.^[3]

Reference