Saccharomyces bayanus - Saccharomyces bayanus

Saccharomyces bayanus
Vědecká klasifikace Upravit
Království:Houby
Divize:Ascomycota
Třída:Saccharomycetes
Objednat:Saccharomycetales
Rodina:Saccharomycetaceae
Rod:Saccharomyces
Druh:
S. bayanus
Binomické jméno
Saccharomyces bayanus
Saccardo, 1895

Saccharomyces bayanus je droždí z rod Saccharomyces, a používá se v dělání vína a jablečný mošt kvašení a výroba destilátů. Saccharomyces bayanus jako Saccharomyces pastorianus, je nyní přijímán jako výsledek mnohonásobných hybridizačních událostí mezi třemi čistými druhy, Saccharomyces uvarum, Saccharomyces cerevisiae a Saccharomyces eubayanus.[1][2] Zejména většina komerčních kvasinkových kultur se prodává jako čisté S. bayanus pro výrobu vína, např. Bylo zjištěno, že obsahuje kmen Lalvin EC-1118 S. cerevisiae kultury místo toho [3]

S. bayanus se intenzivně používá ve srovnávacích studiích genomiky.[4][5][6][7][8] Na základě experimentálního návrhového systému založeného na výpočtu[8] Caudy a kol.[5] generoval bohatý zdroj pro profily exprese pro S. bayanus, který byl použit v několika srovnávacích studiích v kvasinkových systémech, včetně vzorců exprese [6] a profily nukleosomů.[7]

Viz také

Reference

  1. ^ Libkind, Diego; et al. (2011). „Domestikace mikrobů a identifikace divokého genetického materiálu kvasinek pro ležák“. Sborník Národní akademie věd. 108 (35): 14539–14544. doi:10.1073 / pnas.1105430108. PMC  3167505. PMID  21873232.
  2. ^ Nguyen, H. V .; Legras, J.L .; Neuvéglise, C .; Gaillardin, C. (2011). „Dešifrování historie hybridizace vedoucí k ležácké linii na základě mozaikových genomů kmenů Saccharomyces bayanus NBRC1948 a CBS380T“. PLOS ONE. 6 (10): e25821. Bibcode:2011PLoSO ... 625821N. doi:10.1371 / journal.pone.0025821. PMC  3187814. PMID  21998701.
  3. ^ Hoff, Justin Wallace. Molekulární typizace vinných kvasinek: hodnocení technik typizace a vytvoření databáze. Diss. Stellenbosch: Stellenbosch University, 2012.
  4. ^ Kellis, M; Patterson, N; Endrizzi, M; Birren, B; Lander, ES (15. května 2003). "Sekvenování a srovnání druhů kvasinek za účelem identifikace genů a regulačních prvků". Příroda. 423 (6937): 241–54. Bibcode:2003 Natur.423..241K. doi:10.1038 / nature01644. PMID  12748633. S2CID  1530261.
  5. ^ A b Caudy AA, Guan Y, Jia Y, Hansen C, DeSevo C, Hayes AP, Agee J, Alvarez-Dominguez JR, Arellano H, Barrett D, Bauerle C, Bisaria N, Bradley PH, Breunig JS, Bush E, Cappel D, Capra E, Chen W, Clore J, Combs PA, Doucette C, Demuren O, Fellowes P, Freeman S, Frenkel E, Gadala-Maria D, Gawande R, Glass D, Grossberg S, Gupta A, Hammonds-Odie L, Hoisos A, Hsi J, Hsu YH, Inukai S, Karczewski KJ, Ke X, Kojima M, Leachman S, Lieber D, Liebowitz A, Liu J, Liu Y, Martin T, Mena J, Mendoza R, Myhrvold C, Millian C, Pfau S, Raj S, Rich M, Rokicki J, Rounds W, Salazar M, Salesi M, Sharma R, Silverman S, Singer C, Sinha S, Staller M, Stern P, Tang H, Weeks S, Weidmann M, Wolf A , Young C, Yuan J, Crutchfield C, McClean M, Murphy CT, Llinás M, Botstein D, Troyanskaya OG, Dunham MJ (září 2013). „Nový systém pro srovnávací funkční genomiku kvasinek Saccharomyces“. Genetika. 195 (1): 275–87. doi:10.1534 / genetika.113.152918. PMC  3761308. PMID  23852385.
  6. ^ A b Guan, Y; Dunham, MJ; Troyanskaya, OG; Caudy, AA (16. ledna 2013). "Srovnávací genová exprese mezi dvěma druhy kvasinek". BMC Genomics. 14: 33. doi:10.1186/1471-2164-14-33. PMC  3556494. PMID  23324262.
  7. ^ A b Guan, Y; Yao, V; Tsui, K; Gebbia, M; Dunham, MJ; Nislow, C; Troyanskaya, OG (26. září 2011). „Rozdíly v expresi spojené s nukleosomy u blízce příbuzných druhů“. BMC Genomics. 12: 466. doi:10.1186/1471-2164-12-466. PMC  3209474. PMID  21942931.
  8. ^ A b Guan, Y; Dunham, M; Caudy, A; Troyanskaya, O (5. března 2010). „Systematické plánování experimentů v měřítku genomu u špatně studovaných druhů“. PLOS výpočetní biologie. 6 (3): e1000698. Bibcode:2010PLSCB ... 6E0698G. doi:10.1371 / journal.pcbi.1000698. PMC  2832676. PMID  20221257.

externí odkazy