Rodos byl založen v roce 1968 po sloučení společností Diagoras, Rodiakos a Dorieas. Její první účast na profesionálním šampionátu byla v roce 1969 na 2. National. Po devíti letech v roce 1978 se mu podařilo soutěžit v první národní divizi. V roce 1985, kdy se Rhodos rozešel s Diagorasem a veškerým jeho jádrem byl přesunut do národního týmu, tým soutěžil ve druhém národním týmu a do roku 1988 vklouzl do druhého národního. V roce 1994 se znovu spojila s Diagoras a vytvořila Enosis Rodos-Diagoras. Unie trvala jen čtyři roky a v roce 1998 byl tým Rhodos obnoven. Vrcholem této nové snahy bylo zapojení týmu do Second Nationals v sezóně 2009-10.