RnaG - RnaG
| RNAG sRNA | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence malé RNA RnaG | |
| Identifikátory | |
| Rfam | RF02550 |
| Další údaje | |
| Domény | Bakterie |
| TAK | SO: 0000077,SO: 0000370 |
| PDB struktur | PDBe |
RnaG je malý předpis nekódující RNA kódováno virulenčním plazmidem z Shigella flexneri, gramnegativní patogenní bakterie, která způsobuje člověka bacilární úplavice. Je to první regulační RNA charakterizováno v S. flexneri. The RNA je 450 nukleotidy long (což z něj činí jednu z největších regulačních sRNA) a obsahuje oblast se specifickou sekundární strukturou, se kterou interaguje icsA (virG ) mRNA a tvoří a terminátor transkripce. Jednat jako antisense, RnaG je transkribován z komplementárního řetězce svého cíle, icsA mRNA.[1]Aktivita proteinu incA je zásadní pro šíření bakteriálního patogenu v hostitelských buňkách.[2]
Reference
- ^ Giangrossi M, Prosseda G, Tran CN, Brandi A, Colonna B, Falconi M (červen 2010). "Nová antisense RNA reguluje na transkripční úrovni gen virulence icsA Shigella flexneri". Výzkum nukleových kyselin. 38 (10): 3362–3375. doi:10.1093 / nar / gkq025. PMC 2879508. PMID 20129941.
- ^ Bernardini ML, Mounier J, d'Hauteville H, Coquis-Rondon M, Sansonetti PJ (květen 1989). „Identifikace icsA, plazmidového lokusu Shigella flexneri, který reguluje bakteriální intra- a mezibuněčné šíření prostřednictvím interakce s F-aktinem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 86 (10): 3867–3871. doi:10.1073 / pnas.86.10.3867. PMC 287242. PMID 2542950.