Vedoucí ribozomální protein L19 - Ribosomal protein L19 leader - Wikipedia

L19_vedoucí
RF00556-rscape.svg
Shoda sekundární struktura a zachování sekvence vedoucího ribozomálního proteinu L19
Identifikátory
SymbolL19_vedoucí
RfamRF00556
Další údaje
RNA typ Cis-reg; vůdce
JÍTGO: 0010468
TAKSO: 0000233
PDB strukturPDBe
L19-Flavobakterie
RF03130.svg
Shoda sekundární struktura a zachování sekvence vůdce ribozomálního proteinu L19-Flavobacteria
Identifikátory
SymbolL19-Flavobakterie
RfamRF03130
Další údaje
RNA typ Cis-reg; vůdce
TAKSO: 0000837
PDB strukturPDBe

L19 Vedoucí ribozomálních proteinů jsou součástí ribozomální biogeneze. Byly použity jako autoregulační mechanismus pro kontrolu koncentrace ribozomální proteiny L19. Tato rodina je domnělá vůdce ribozomálního proteinu autoregulační struktura[1] nalezen v B. subtilis a další low-GC Grampozitivní bakterie. Nachází se v 5 'nepřeložených oblastech mRNA kódování ribozomální protein L19 (rplS). Další příklady byly předpovězeny v Flavobakterie[2] nebo Firmicutes[3] s bioinformatické přístupy. Struktury všech těchto predikovaných ribozomálních vůdců L19 jsou podobné.

Viz také

Reference

  1. ^ Zengel JM, Lindahl L (1994). Různé mechanismy pro regulaci syntézy ribozomálních proteinů v Escherichia coli. Pokrok ve výzkumu nukleových kyselin a molekulární biologie. 47. str.331–370. doi:10.1016 / S0079-6603 (08) 60256-1. ISBN  978-0-12-540047-3. PMID  7517053.
  2. ^ Eckert, I; Weinberg, Z (24. května 2020). „Objev 20 nových kandidátů na vůdce ribozomů v bakteriích a archaeách“. Mikrobiologie BMC. 20 (130): 130. doi:10.1186 / s12866-020-01823-6. PMC  7247131. PMID  32448158.
  3. ^ Yao, Z; Barrick, J; Weinberg, Z; Neph, S; Breaker, R; Tompa, M; Ruzzo, WL (2007). „Výpočtové potrubí pro vysokovýkonný objev cis-regulační nekódující RNA u prokaryot“. PLOS výpočetní biologie. 3 (7): e126. Bibcode:2007PLSCB ... 3..126R. doi:10.1371 / journal.pcbi.0030126. PMC  1913097. PMID  17616982.

externí odkazy