Qrr RNA - Qrr RNA
| Regulační RNA kvora | |
|---|---|
 | |
| Identifikátory | |
| Symbol | Qrr |
| Alt. Symboly | Qrr1–5 |
| Rfam | RF00378 |
| Další údaje | |
| RNA typ | sRNA |
| Domény | Vibrio |
| PDB struktur | PDBe |
Qrr (Regulační RNA kvora)[1] je nekódující RNA o kterém se předpokládá, že je zapojen do regulace snímání kvora v Vibrio druh. Předpokládá se, že tyto RNA, vedené a protein, Hfq, může zprostředkovat destabilizaci hlavních regulátorů snímání kvora LuxR / HapR / VanT mRNA.[2][3]
Qrr funguje jako součást a negativní zpětná vazba smyčka, která reguluje posun buněčného stavu z populací s nízkou hustotou k populaci s vysokou hustotou.[4] v Vibrio harveyi, Qrr váže a potlačuje výraz luxR přepis mRNA, hlavní regulátor genů snímajících kvorum.[5] Při vyšší hustotě populace vzrostla autoinduktor koncentrace vede k ukončení qrr transkripce tedy derepresi luxR.[4]
Existuje 5 různých qrr geny (Qrr1–5) v V. harveyi; z nich jsou qrr2, 3 a 4 aktivovány LuxR.[6]
Reference
- ^ Lenz, DH; Mok KC; Lilley BN; Kulkarni RV; Wingreen NS; Bassler BL (2004). „Malý RNA chaperon Hfq a vícenásobné malé RNA kontrolují snímání kvora u Vibrio harveyi a Vibrio cholerae“. Buňka. 118 (1): 69–82. doi:10.1016 / j.cell.2004.06.009. PMID 15242645.
- ^ Svenningsen SL, Tu KC, Bassler BL (2009). „Kompenzace dávky genu kalibruje čtyři regulační RNA pro kontrolu snímání kvora Vibrio cholerae“. EMBO J.. 28 (4): 429–439. doi:10.1038 / emboj.2008.300. PMC 2632942. PMID 19165149.
- ^ Tu, K .; Waters, C .; Svenningsen, S .; Bassler, B. (listopad 2008). „Smyčka negativní zpětné vazby zprostředkovaná RNA řídí dynamiku snímání kvora ve Vibrio harveyi“. Molekulární mikrobiologie. 70 (4): 896–907. doi:10.1111 / j.1365-2958.2008.06452.x. ISSN 0950-382X. PMC 2680268. PMID 18808382.
- ^ A b Tu KC, Long T, Svenningsen SL, Wingreen NS, Bassler BL (2010). „Negativní zpětnovazební smyčky zahrnující malé regulační RNA přesně řídí reakci Vibrio harveyi kvora“. Mol Cell. 37 (4): 567–579. doi:10.1016 / j.molcel.2010.01.022. PMC 2844700. PMID 20188674.
- ^ Miyamoto, CM; Smith, EE; Swartzman, E; Cao, JG; Graham, AF; Meighen, EA (říjen 1994). "Proximální a distální místa vážou LuxR nezávisle a aktivují expresi operátoru Vibrio harveyi lux". Molekulární mikrobiologie. 14 (2): 255–262. doi:10.1111 / j.1365-2958.1994.tb01286.x. PMID 7830570.
- ^ Tu, KC; Waters, CM; Svenningsen, SL; Bassler, BL (listopad 2008). „Smyčka negativní zpětné vazby zprostředkovaná RNA řídí dynamiku snímání kvora ve Vibrio harveyi“. Molekulární mikrobiologie. 70 (4): 896–907. doi:10.1111 / j.1365-2958.2008.06452.x. PMC 2680268. PMID 18808382.
Další čtení
- Shao, Y; Bassler, BL (3. dubna 2014). „Regulační malé RNA kvora potlačují sekreci typu VI u Vibrio cholerae“. Molekulární mikrobiologie. 92 (5): 921–930. doi:10,1111 / mmi.12599. PMC 4038675. PMID 24698180.