Transpeptidáza na třídění proteinů - Protein-sorting transpeptidase - Wikipedia
A proteinová třídění transpeptidáza je enzym, tak jako třídit SrtA[1] z Zlatý stafylokok, který štěpí jeden nebo více cílových proteinů produkovaných stejnou buňkou jako součást specializované dráhy cílení na bílkoviny. Typická transpeptidáza pro třídění prokaryotických proteinů je charakterizována jako a proteáza, ale nehydrolyzuje pouze peptidovou vazbu. Místo toho je větší N-koncová část štěpeného polypeptidu přenesena na jinou molekulu, jako je prekurzor peptidoglykan buněčná stěna dovnitř Grampozitivní bakterie.
Termín třídit je řádně vyhrazeno pro sadu cysteinová proteáza enzymy sortase A, sortase B, a členové dalších tříd, které všechny sdílejí homologii. U prokaryot však byl popsán rostoucí počet dalších systémů třídění proteinů, které zahrnují třídění enzymů, které nemají žádnou homologii k třídění a které, jak se zdá, vznikly samostatně konvergentní evoluce. Ačkoli jsou sortázy nejlépe popsanými členy proteinových třídících pepteptidáz, pracujte na analogických enzymech archeosortáza[2], rhombosortáza[3]a enzym PorU typu IX sekreční systémy (T9SS)[4] se hromadí.
| třídicí enzym | mechanismus | příbuzný třídicí signál |
|---|---|---|
| sortase A | cysteinová proteáza | LPXTG |
| sortase B | cysteinová proteáza | NPQTN |
| archeosortáza A | cysteinová proteáza | PGF-CTERM |
| exosortáza A | cysteinová proteáza | PEP-CTERM |
| rhombosortáza | serinová proteáza | GlyGly-CTERM |
| PorU jako v Porphyromonas gingivalis | serinová proteáza | C-koncová beta-sendvičová doména T9SS |
Reference
- ^ Zong Y, Bice TW, Ton-That H, Schneewind O, Narayana SV (2004). "Krystalové struktury Staphylococcus aureus sortase A a jeho substrátového komplexu". J Biol Chem. 279 (30): 31383–9. doi:10,1074 / jbc.M401374200. PMID 15117963.
- ^ Abdul Halim MF, Rodriguez R, Stoltzfus JD, Duggin IG, Pohlschroder M (2018). „Konzervovaná rezidua jsou zásadní pro katalytickou aktivitu archeosortázy Haloferax volcanii: Důsledky pro konvergentní vývoj katalytických mechanismů nehomologních sortáz z archea a bakterií“. Mol Microbiol. 108 (3): 276–287. doi:10,1111 / mmi.13935. PMID 29465796.
- ^ Gadwal S, Johnson TL, Remmer H, Sandkvist M (2018). "C-terminální zpracování GlyGly-CTERM obsahujících proteiny rhombosortázou u Vibrio cholerae". PLoS Pathog. 14 (10): e1007341. doi:10.1371 / journal.ppat.1007341. PMC 6219818. PMID 30352106.
- ^ de Diego I, Ksiazek M, Mizgalska D, Koneru L, Golik P, Szmigielski B a kol. (2016). „Exportní signál vnější membrány sekrečního systému Porphyromonas gingivalis typu IX (T9SS) je konzervativní C-koncová β-sendvičová doména“. Sci Rep. 6: 23123. doi:10.1038 / srep23123. PMC 4804311. PMID 27005013.