Viroid bramborových vřeten - Potato spindle tuber viroid

Viroid bramborových vřeten
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:incertae sedis
Království:incertae sedis
Kmen:incertae sedis
Třída:incertae sedis
Objednat:incertae sedis
Rodina:Pospiviroidae
Rod:Pospiviroid
Druh:
Viroid bramborových vřeten

The Viroid bramborových vřeten ("PSTVd„) byl první viroid být identifikován.[1][2][3][4] PSTVd ​​je malý, jednovláknový kruhová RNA molekula[5] úzce souvisí s chryzantéma senzace viroid. Ve viroidální RNA je přítomna Pospiviroid RY s motivem stonkové smyčky. Přirozenými hostiteli jsou brambory (Solanum tuberosum) a rajčata (Solanum lycopersicum). Všechny brambory a rajčata jsou citlivé na PSTVd ​​a neexistuje žádná forma přirozené rezistence. Přirozené infekce byly také pozorovány u avokádo a v laboratořích byly vyvolány infekce u jiných plodin z čeledi lilkovitých. Do roku 2017 se předpokládalo, že PSTVd ​​není schopen infikovat Solanum sisymbriifolium.[6] Pak v květnu semena vyvážená a holandský společnost byla infikována.[6] Tato semena byla odeslána ze společnosti, ale původně byla vyšlechtěna podle jejich specifikací ve dvou asijský zemí.[6]

Kmeny a jejich příznaky

Existují různé kmeny PSTVd ​​a příznaky se pohybují od mírných po těžké. Mírné kmeny nevyvolávají žádné zjevné příznaky. Příznaky u těžkých kmenů závisí na podmínkách prostředí a jsou nejzávažnější v horkých podmínkách. Příznaky mohou být mírné u počátečních infekcí, ale v následujících generacích se postupně zhoršují. Mezi běžné příznaky závažných infekcí patří barevné změny v listí, menší listy a prodloužení podobné vřetenu. Klíčení také nastává pomaleji než u neovlivněných brambor. Infikovaná rajčata vykazují pomaleji příznaky, které zahrnují zakrnělý růst s „hrudkovitým vrcholem“ způsobeným zkrácenými meziuzly. Listy jsou žluté nebo fialové a často se stočí a zkroutí. Nekróza se nakonec vyskytuje v žilách spodního a středního listu a horní listy se zmenšují. Je také ovlivněno zrání ovoce, což vede k tvrdým, malým, tmavě zeleným rajčatům.

Šíření PSTVd ​​na velké vzdálenosti se obvykle vyskytuje prostřednictvím infikovaných semen, ale k přenosu prostřednictvím mšice (Myzus persicae ) také se vyskytuje, ale pouze v přítomnosti PLRV (virus bramborových listů ). K mechanickému přenosu dochází také po zavedení do oblasti.

Primární a sekundární struktura PSTVd

PSTVd ​​zahrnuje 359 nukleotidy.

Primární struktura
  1 CGGAACUAAA CUCGUGGUUC CUGUGGUUCA CACCUGACCU CCUGAGCAGA AAAGAAAAAAA 61 GAAGGCCGGCU CGGAGGAGCG CUUCAGGGAU CCCCGGGGAA ACCUGGAGCG AACUGGCAAA121 AAAGGACGGU GGGGAGUGCC CAGCGGCCGA CAGGAGUAAU UCCCGCCGAA ACAGGGUUUU181 CACCCUUCCU UUCUUCGGGU GUCCUUCCUC GCGCCCGCAG GACCACCCCU CGCCCCCUUU241 GCGCUGUCGC UUCGGCUACU ACCCGGUGGA AACAACUGAA GCUCCCGAGA ACCGCUUUUU301 CUCUAUCUUA CUUGCUUCGG GGCGAGGGUG UUUAGCCCUU GGAACCGCAG UUGGUUCCU
Sekundární struktura
Předpokládaná sekundární struktura viroidu PSTVd. Zvýrazněné nukleotidy se nacházejí ve většině ostatních viroidů.

Reference

  1. ^ Diener TO (srpen 1971). „Virus" hlízy bramborových vřeten. IV. Replikující se nízkomolekulární RNA ". Virologie. 45 (2): 411–28. doi:10.1016/0042-6822(71)90342-4. PMID  5095900.
  2. ^ „Časová osa výzkumu ARS - sledování nepolapitelného Viroidu“. 2006-03-02. Citováno 2007-07-18.
  3. ^ Objev viroidů Archivováno 03.03.2016 na Wayback Machine
  4. ^ Zimmer, Carle (25. září 2014). „Drobný vyslanec z dávné minulosti“. New York Times. Citováno 26. září 2014.
  5. ^ Sanger, HL (1982). Nukleové kyseliny a proteiny v rostlinách II: Struktura, biochemie a fyziologie nukleových kyselin (PDF). Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg. str. 383. doi:10.1007/978-3-642-68347-3_12. ISBN  978-3-642-68349-7. Citováno 13. března 2019.
  6. ^ A b C „První nález viroidu hlízy bramborových vřeten (PSTVd) v semenech Solanum sisymbriifolium pocházejících z Asie - červen 2017“. Nizozemský úřad pro bezpečnost potravin a spotřebního zboží. 2017-06-28. Citováno 2020-11-30.

Bibliografie