Peptidová knihovna - Peptide library

Tento článek obsahuje a seznam doporučení, související čtení nebo externí odkazy, ale jeho zdroje zůstávají nejasné, protože mu chybí vložené citace. Prosím pomozte zlepšit tento článek představuji přesnější citace. (Květen 2015) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony)

A peptid knihovna je nástroj pro protein související studie. Knihovna peptidů obsahuje velké množství peptidů, které mají systematickou kombinaci aminokyseliny. Obvykle je peptidová knihovna syntetizována na pevné fázi, většinou na pryskyřice, které mohou být vyrobeny jako plochý povrch nebo korálky. Knihovna peptidů poskytuje výkonný nástroj pro design léku, interakce protein-protein a další biochemické a farmaceutické aplikace.

V každém bodě sekvence můžete vytvořit směs požadovaných aminokyselin. Tímto způsobem byste mohli vytvořit knihovnu 20 různých polypeptidů s náhodným výběrem pouze jednoho aminokyselinového zbytku a zbytek by byl stejný.

Užitečnost této formy syntézy peptidů je omezená, protože nemůžete překročit délku 70 kyselin. To vám dá 20⁷⁰ možné kombinace, a to pouze v případě, že nezahrnete nepřeberné množství dostupných aminokyselin s předinstalovanými posttranslační úpravy. Většina vývoje léků nezahrnuje tak náhodný sortiment bílkovin, jak byste se toho moc nenaučili.

Důležitý příklad. Řekněme, že chcete peptidový řetězec o délce 10 zbytků, který se použije při nativní chemické ligaci s větším rekombinantně exprimovaným proteinem.

• Vybrali jste z úplné náhodnosti *, chcete sadu bílkovin s následujícími.

zbytek 1: pouze alanin, zbytek 2: glutamin, glycin, arginin, kyselina glutamová, serin nebo methionin, zbytek 3: kterýkoli ze všech 20 aminokyselin, zbytek 4: pouze acetyl-lysin, zbytek 5: alaniner, zbytek 6: isoleucin, zbytek 7: zbytek aspartové kyseliny 8: fenylalaniner, zbytek acetyl-lysineresidue 10: arginein s karboxyterminálním thioesterem.

ve zbytku by bylo 20 různých proteinů 3. každý z nich by měl 7 různých proteinů ve zbytku 2. konečným výsledkem by bylo 20 * 7 nebo 140 různých polypeptidů. tato peptidová knihovna by byla užitečná pro analýzu účinku post- translační modifikace acetylace na lysinu, která neutralizuje kladný náboj. mít knihovnu různých peptidů ve zbytku 2 a 3 vám umožní zjistit, zda nějaká změna chemických vlastností v N-koncovém konci ligovaného proteinu činí protein užitečnějším nebo užitečnějším jiným způsobem.

Jako obecný vzorec platí, že pokud jste vytvořili zcela náhodnou peptidovou knihovnu s n aminokyselinami pro každý článek v řetězci o délce x, celkový počet možných sekvencí je n ^ x.

Reference

• Peptidová knihovna na pbcpeptide.com^{[mrtvý odkaz ]}