Pedobacter - Pedobacter
| Pedobacter | |
|---|---|
| Vědecká klasifikace | |
| Království: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | Pedobacter |
Pedobacter je rod z Gramnegativní spojené s půdou bakterie. Druhy včetně Pedobacter heparinus, dříve známý jako Flavobacterium heparinum, produkují heparinázu a jsou schopné použití heparin jako jediný zdroj uhlíku a dusíku.[1]
V molekulární biologii Pedobacter byl také identifikován jako kontaminant reagencií soupravy pro extrakci DNA a ultračistých vodních systémů, což může vést k jeho chybnému vzhledu v souborech mikrobioty nebo metagenomických dat.[2]
Druh
- Pedobacter africanus
- Pedobacter agri
- Pedobacter alluvionis
- Pedobacter arcticus
- Pedobacter borealis
- Pedobacter cryoconitis
- Pedobacter ginsengisoli
- Pedobacter heparinus
- Pedobacter insulae
- Pedobacter jejuensis
- Pedobacter lentus
- Pedobacter nyackensis
- Pedobacter rhizosphaerae
- Pedobacter saltans
- Pedobacter soli
- Pedobacter terricola
Reference
- ^ Shaya, D (2006). „Krystalová struktura heparinázy II z Pedobacter heparinus a její komplex s disacharidovým produktem“. J. Biol. Chem. 281 (22): 15525–35. doi:10.1074 / jbc.m512055200. PMID 16565082.
- ^ Salter, S; Cox, M; Turek, E; Calus, S; Cookson, W; Moffatt, M; Turner, P; Parkhill, J; Loman, N; Walker, A (2014). „Znečištění reagencií může kriticky ovlivnit sekvenční mikrobiální analýzy“. bioRxiv 10.1101/007187.
Další čtení
- Kook, MooChang; Park, YongJin; Yi, Tae-Hoo (2014). „Pedobacter jejuensis sp nov., Izolovaný z půdy borovicového háje a upravený popis rodu Pedobacter“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 64 (Část 5): 1789–1794. doi:10.1099 / ijs.0.058024-0. PMID 24573158. Archivovány od originál dne 12. 11. 2014. Citováno 12. listopadu 2014.