PCMT1 - PCMT1

PCMT1
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1I1N, 1KR5
Identifikátory
Aliasy	PCMT1, PIMT, O-methyltransferáza protein-L-isoaspartát (D-aspartát)
Externí ID	OMIM: 176851 HomoloGene: 55895 Genové karty: PCMT1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	149,811,420 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita methyltransferázy; • aktivita transferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita protein-L-isoaspartátu (D-aspartátu) O-methyltransferázy; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• extracelulární vezikul; • extracelulární exosom; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• methylace; • proces modifikace buněčného proteinu; • oprava bílkovin; • methylace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5110
	n / a
	ENSG00000120265
	n / a
	P22061
	n / a
NM_001252049; NM_001252050; NM_001252051; NM_001252052; NM_001252053;
	NM_005389; NM_001360452; NM_001360456
	n / a
NP_001238978; NP_001238979; NP_001238980; NP_001238981; NP_001238982;
	NP_005380; NP_001347381; NP_001347385
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Protein-L-isoaspartát (D-aspartát) O-methyltransferáza je enzym že u lidí je kódován PCMT1 gen.^[3]^[4]^[5]

Tři třídy bílkovin karboxyl methyltransferázy, které se vyznačují svou specificitou substrátu akceptoru methylu, byly nalezeny v prokaryotický a eukaryotický buňky. Enzym typu II katalyzuje přenos methylové skupiny z S-adenosyl-L-methioninu na volné karboxylové skupiny zbytků D-aspartyl a L-isoaspartyl. Tyto zbytky přijímající methyl jsou výsledkem spontánní deamidace, izomerizace a racemizace normálních zbytků L-aspartyl a L-asparaginyl a představují místa kovalentního poškození stárnoucích proteinů PCMT1 (EC 2.1.1.77) je enzym opravující proteiny, který iniciuje přeměnu abnormálních zbytků D-aspartyl a L-isoaspartyl do normální formy L-aspartyl. [dodává OMIM]^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000120265 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ MacLaren DC, O'Connor CM, Xia YR, Mehrabian M, Klisak I, Sparkes RS, Clarke S, Lusis AJ (únor 1993). „Gen L-isoaspartyl / D-aspartyl protein methyltransferázy (PCMT1) se mapuje na lidský chromozom 6q22.3-6q24 a syntenickou oblast myšího chromozomu 10“. Genomika. 14 (4): 852–6. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80104-1. PMID 1478665.
^ DeVry CG, Clarke S (červen 1999). „Přiřazení genu proteinu L-isoaspartátu (D-aspartátu) O-methyltransferázy (PCMT1) k lidským chromozomovým pásmům 6q24 → q25 s radiačním hybridním mapováním“. Cytogenet Cell Genet. 84 (1–2): 130–1. doi:10.1159/000015239. PMID 10343128. S2CID 38976877.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PCMT1 protein-L-isoaspartát (D-aspartát) O-methyltransferáza".

Další čtení

MacLaren DC, Kagan RM, Clarke S (1992). „Alternativní sestřih humánního izoaspartylproteinového karboxylmethyltransferázového RNA vede ke generování C-terminální -RDEL sekvence v isozymu II“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 185 (1): 277–83. doi:10.1016 / S0006-291X (05) 80987-8. PMID 1339271.
Ingrosso D, Kagan RM, Clarke S (1991). „Zřetelné C-koncové sekvence isozymů I a II lidské erytrocytové L-isoaspartyl / D-aspartylproteinové methyltransferázy“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 175 (1): 351–8. doi:10.1016 / S0006-291X (05) 81242-2. PMID 1998518.
Ingrosso D, Fowler AV, Bleibaum J, Clarke S (1989). "Sekvence D-aspartyl / L-isoaspartylproteinu methyltransferázy z lidských erytrocytů. Běžné sekvenční motivy pro protein, DNA, RNA a methyltransferázy závislé na S-adenosylmethioninu s malou molekulou". J. Biol. Chem. 264 (33): 20131–9. PMID 2684970.
Gilbert JM, Fowler A, Bleibaum J, Clarke S (1988). „Čištění homologních proteinových karboxylmethyltransferázových isozymů z lidských a bovinních erytrocytů“. Biochemie. 27 (14): 5227–33. doi:10.1021 / bi00414a042. PMID 3167043.
Ota IM, Gilbert JM, Clarke S (1988). „Dva hlavní izoenzymy proteinu D-aspartyl / L-isoaspartylmethyltransferázy z lidských erytrocytů“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 151 (3): 1136–43. doi:10.1016 / S0006-291X (88) 80484-4. PMID 3355545.
Takeda R, Mizobuchi M, Murao K a kol. (1995). „Charakterizace tří cDNA kódujících dva izoenzymy izoaspartylproteinkarboxylmethyltransferázy z buněk lidské erytroidní leukémie“. J. Biochem. 117 (4): 683–5. doi:10.1093 / jb / 117.2.267. PMID 7592526.
Tsai W, Clarke S (1994). „Aminokyselinové polymorfismy lidské L-isoaspartyl / D-aspartylmethyltransferázy zapojené do opravy proteinu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203 (1): 491–7. doi:10.1006 / bbrc.1994.2209. PMID 8074695.
DeVry CG, Tsai W, Clarke S (1997). "Struktura lidského genu kódujícího proteinovou opravu L-isoaspartyl (D-aspartyl) O-methyltransferázy". Oblouk. Biochem. Biophys. 335 (2): 321–32. CiteSeerX 10.1.1.630.8527. doi:10.1006 / abbi.1996.0513. PMID 8914929.
DeVry CG, Clarke S (1999). „Polymorfní formy proteinu L-isoaspartát (D-aspartát) O-methyltransferáza podílející se na opravě proteinů poškozených věkem“. J. Hum. Genet. 44 (5): 275–88. doi:10,1007 / s100380050161. PMID 10496068.
Ryttersgaard C, Griffith SC, Sawaya MR a kol. (2002). "Krystalová struktura lidské L-isoaspartylmethyltransferázy". J. Biol. Chem. 277 (12): 10642–6. doi:10,1074 / jbc.M200229200. PMID 11792715.
Smith CD, Carson M, Friedman AM a kol. (2002). "Krystalová struktura lidské L-isoaspartyl-O-methyl-transferázy s S-adenosyl homocysteinem při rozlišení 1,6-A a modelování peptidu obsahujícího isoaspartyl na aktivním místě". Protein Sci. 11 (3): 625–35. doi:10.1110 / ps.37802. PMC 2373461. PMID 11847284.
Misra P, Qi C, Yu S a kol. (2002). „Interakce PIMT s transkripčními koaktivátory CBP, p300 a PBP diferenciální role v regulaci transkripce“. J. Biol. Chem. 277 (22): 20011–9. doi:10,1074 / jbc.M201739200. PMID 11912212.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Enünlü I, Pápai G, Cserpán I a kol. (2003). „Různé izoformy proteinu interagujícího s PRIP s doménou methyltransferázy / trimethylguanosin syntázou se lokalizují do cytoplazmy a jádra“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309 (1): 44–51. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01514-6. PMID 12943661.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Zhu H, Yang W, Lu W a kol. (2006). „Známý funkční polymorfismus (Ile120Val) lidského genu PCMT1 a riziko spina bifida“. Mol. Genet. Metab. 87 (1): 66–70. doi:10.1016 / j.ymgme.2005.09.008. PMC 2947858. PMID 16256389.
Lanthier J, Desrosiers RR (2007). „Regulace proteinové L-isoaspartylmethyltransferázy interakcemi buněčné matrice: zapojení integrinu alphavbeta3, PI 3-kinázy a proteazomu“. Biochem. Cell Biol. 84 (5): 684–94. doi:10.1139 / o06-055. PMID 17167531.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000120265 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1478665-3] MacLaren DC, O'Connor CM, Xia YR, Mehrabian M, Klisak I, Sparkes RS, Clarke S, Lusis AJ (únor 1993). „Gen L-isoaspartyl / D-aspartyl protein methyltransferázy (PCMT1) se mapuje na lidský chromozom 6q22.3-6q24 a syntenickou oblast myšího chromozomu 10“. Genomika. 14 (4): 852–6. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80104-1. PMID 1478665.

[pmid10343128-4] DeVry CG, Clarke S (červen 1999). „Přiřazení genu proteinu L-isoaspartátu (D-aspartátu) O-methyltransferázy (PCMT1) k lidským chromozomovým pásmům 6q24 → q25 s radiačním hybridním mapováním“. Cytogenet Cell Genet. 84 (1–2): 130–1. doi:10.1159/000015239. PMID 10343128. S2CID 38976877.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: PCMT1 protein-L-isoaspartát (D-aspartát) O-methyltransferáza".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]