Osnat Penn - Osnat Penn - Wikipedia

Osnat Penn (hebrejština: אסנת פן) Je Izraelčan výpočetní biolog. Penn je třetí izraelský vědec za tři roky vyhrát Společenstvo UNESCO-L’Oréal, kterou získala v roce 2013 za svou práci na internetu genetický počátky autismus.[1] Penn je v současné době v University of Washington v Seattle.[2]

Penn byl zodpovědný za několik různých počítačové programy vyvinut v Tel Avivská univerzita s cílem pomoci v biologickém výzkumu.[3] GUIDANCE je a webový server slouží k odhadu skóre spolehlivosti zarovnání.[4][5] RASER, RAte Shift EstimatoR, se používá k testování konkrétního místa evoluční rychlostní posuny.[6] K mapování se používá server Pepitope epitopy pomocí vybrané afinity peptidy.[7] Její práce s genetickým sekvenováním autismu, které jí vyneslo cenu UNESCO-L’Oréal, se snažila zjistit, kde existují genetické variace spojené s jedinci vykazujícími autismus.[8] Její práce povede také k prenatálnímu screeningu a včasné diagnostice autismu.[8]

Penn byl publikován v Buňka,[9] Výzkum genomu,[10] Molekulární biologie a evoluce,[11] Výzkum nukleových kyselin,[5] Systematická biologie,[12] BMC Evoluční biologie,[13] PLoS výpočetní biologie,[14] Bioinformatika,[15] a Proteiny.[16]

Reference

  1. ^ „Výzkumník izraelského autismu získal stipendium UNESCO“. Algemeiner. 29. března 2013. Citováno 26. listopadu 2015.
  2. ^ „Osnat Penn“. Eichlerova laboratoř. University of Washington. Archivovány od originál dne 16. června 2016. Citováno 26. listopadu 2015.
  3. ^ „Osnat Penn“. Tel Avivská univerzita. Citováno 26. listopadu 2015.
  4. ^ „Server GUIDANCE“. Tel Avivská univerzita. Citováno 26. listopadu 2015.
  5. ^ A b Penn, Osnat; Privman, Eyal; Ashkenazy, Haim; Landan, Giddy; Graur, Dan; Pupko, Tal (01.07.2010). „GUIDANCE: webový server pro hodnocení skóre spolehlivosti zarovnání“. Výzkum nukleových kyselin. 38 (doplněk 2): W23 – W28. doi:10.1093 / nar / gkq443. ISSN  0305-1048. PMC  2896199. PMID  20497997.
  6. ^ "RASER". Tel Avivská univerzita. Citováno 26. listopadu 2015.
  7. ^ „Server Pepitope“. Tel Avivská univerzita. Citováno 26. listopadu 2015.
  8. ^ A b Kaplan, Michael (31. března 2013). „Autisme: Osnat Zomer-Penn gagne le prix l'OREAL-UNESCO 2013“. Údolí Izraele (francouzsky). Archivovány od originál dne 4. března 2016. Citováno 26. listopadu 2015.
  9. ^ Bernier, Raphael; Golzio, Christelle; Xiong, Bo; Stessman, Holly A .; Coe, Bradley P .; Penn, Osnat; Witherspoon, Kali; Gerdts, Jennifer; Baker, Carl (2014-07-17). „Rušivé mutace CHD8 definují podtyp autismu na počátku vývoje“. Buňka. 158 (2): 263–276. doi:10.1016 / j.cell.2014.06.017. ISSN  0092-8674. PMC  4136921. PMID  24998929.
  10. ^ Gelfman, Sahar; Burstein, David; Penn, Osnat; Savchenko, Anna; Amit, Maayan; Schwartz, Schraga; Pupko, Tal; Ast, Gil (01.01.2012). „Změny struktury exon – intron během evoluce obratlovců ovlivňují sestřih vzorů exonů“. Výzkum genomu. 22 (1): 35–50. doi:10.1101 / gr.119834.110. ISSN  1088-9051. PMC  3246205. PMID  21974994.
  11. ^ Privman, Eyal; Penn, Osnat; Pupko, Tal (01.01.2012). „Zlepšení výkonu odvození pozitivního výběru filtrováním nespolehlivých oblastí zarovnání“. Molekulární biologie a evoluce. 29 (1): 1–5. doi:10.1093 / molbev / msr177. ISSN  0737-4038. PMID  21772063.
  12. ^ Stern, Adi; Mayrose, Itay; Penn, Osnat; Shaul, Shaul; Gophna, Uri; Pupko, Tal (01.03.2010). „Evoluční analýza přenosu laterálního genu v enzymech thymidylátsyntázy“. Systematická biologie. 59 (2): 212–225. doi:10.1093 / sysbio / syp104. ISSN  1063-5157. PMC  2826268. PMID  20525631.
  13. ^ Blanga-Kanfi, Shani; Miranda, Hector; Penn, Osnat; Pupko, Tal; DeBry, Ronald W .; Huchon, Dorothée (02.04.2009). „Revidována fylogeneze hlodavců: analýza šesti jaderných genů ze všech hlavních subtypů hlodavců“. BMC Evoluční biologie. 9 (1): 71. doi:10.1186/1471-2148-9-71. ISSN  1471-2148. PMC  2674048. PMID  19341461.
  14. ^ Penn, Osnat; Stern, Adi; Rubinstein, Nimrod D .; Dutheil, Julien; Bacharach, Eran; Galtier, Nicolas; Pupko, Tal (2008-11-07). „Evoluční modelování rychlostních posunů odhaluje determinanty specificity u podtypů HIV-1“. PLoS Comput Biol. 4 (11): e1000214. doi:10.1371 / journal.pcbi.1000214. PMC  2566816. PMID  18989394.
  15. ^ Mayrose, Itay; Penn, Osnat; Erez, Elana; Rubinstein, Nimrod D .; Shlomi, Tomer; Freund, Natalia Tarnovitski; Bublil, Erez M .; Ruppin, Eytan; Sharan, Roded (01.12.2007). "Pepitope: mapování epitopu z afinitně vybraných peptidů". Bioinformatika. 23 (23): 3244–3246. doi:10.1093 / bioinformatika / btm493. ISSN  1367-4803. PMID  17977889.
  16. ^ Bublil, Erez M .; Freund, Natalia Tarnovitski; Mayrose, Itay; Penn, Osnat; Roitburd-Berman, Anna; Rubinstein, Nimrod D .; Pupko, Tal; Gershoni, Jonathan M. (01.07.2007). "Postupná předpověď konformačních diskontinuálních epitopů B-buněk pomocí algoritmu Mapitope". Proteiny: struktura, funkce a bioinformatika. 68 (1): 294–304. CiteSeerX  10.1.1.124.9174. doi:10,1002 / prot.21387. ISSN  1097-0134. PMID  17427229.

externí odkazy