Orthohepevirus - Orthohepevirus

Orthohepevirus
Mikrograf TEM virionů „Orthohepevirus A“
TEM mikrograf z Orthohepevirus A viriony
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Kitrinoviricota
Třída:Alsuviricetes
Objednat:Hepelivirales
Rodina:Hepeviridae
Rod:Orthohepevirus
Zadejte druh
Orthohepevirus A
Druh
Synonyma
  • Hepevirus[1]
  • Viry podobné hepatitidě E.[2]

Orthohepevirus je rod z viry přidělen rodině Hepeviridae.[3] Orthohepevirus je poměrně izolovaný virový rod, ve kterém jsou viriony charakterizovány kulatými, neobalenými a izometrické kapsidy o průměru 27–34 nm. Typový typ je Orthohepevirus A, běžněji známý jako Virus hepatitidy E..[3]

Genom

Orthohepevirus má RNA genomy 7176 nukleotidy na délku a infikovat obratlovce. Navíc je genom monopartitní, lineární a jednovláknový. Genom je 5 'zakončen poly A ocasem na 3' konci. Genom má tři hlavní otevřené čtecí rámce. První kóduje nestrukturní proteiny, druhý kóduje kapsidové proteiny a třetí kóduje malý multifunkční protein.[3]

Taxonomie

Viry z tohoto rodu byly izolovány z různých savců (včetně hlodavců, mušlí a netopýrů) i ptáků.[3][4][5] Z ptáků byly izolovány nejméně tři varianty viru ptačí hepatitidy E.[6]

Virus podobný hepatitidě E byl izolován od švédského losa.[7] Tento virus je zcela odlišný od ostatních známých virů hepatitidy E.[3]

Celkově má ​​rod čtyři uznávané druhy: Orthohepevirus A, Orthohepevirus B, který byl dříve znám jako ptačí virus hepatitidy E, Orthohepevirus C., a Orthohepevirus D.[3]

Členové druhu Piscihepevirus A byly izolovány od pstruhů (Oncorhynchus clarkii ).[8] Tento druh byl zařazen do jiného rodu -Piscihepevirus.[3]

Dějiny

Hepatitida E byla poprvé izolována v roce 1990. Předpokládalo se, že je omezena na člověka až do roku 1997, kdy byla izolována z prasat.[9] První izolace od ptáků byla v roce 2001.[10]

Vývoj

Jedna studie naznačuje, že tento druh mohl pocházet z ptáků a poté se rozšířit na netopýry a jiné druhy savců.[4]

Reference

  1. ^ Purdy, Michael A .; et al. (Červen 2014). "Nové klasifikační schéma pro Hepeviridae" (PDF). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Citováno 1. května 2019. Změna oproti současnému použití Hepevirus na Orthohepevirus pro ptačí a savčí HEV a Piscihepevirus pro pstruhy se používají HEV.
  2. ^ Chang, Sandra (17. července 2002). „Taxonomické návrhy z studijní skupiny pro viry podobné virům typu ICTV“ (PDF). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Citováno 1. května 2019.
  3. ^ A b C d E F G „Zpráva o ICTV online (10.)“.
  4. ^ A b Drexler JF, Seelen A, Corman VM, Fumie Tateno A, Cottontail V, Melim Zerbinati R, Gloza-Rausch F, Klose SM, Adu-Sarkodie Y, Oppong SK, Kalko EK, Osterman A, Rasche A, Adam A, Müller MA , Ulrich RG, Leroy EM, Lukashev AN, Drosten C (2012). „Netopýři na celém světě přenášejí viry související s virem hepatitidy E, které tvoří domnělý nový rod v rodině Hepeviridae“. J. Virol. 86 (17): 9134–47. doi:10.1128 / JVI.00800-12. PMC  3416139. PMID  22696648.
  5. ^ Marek A, Bilic I, Prokofieva I, Hess M (2010). „Fylogenetická analýza vzorků viru ptačí hepatitidy E z evropských a australských kuřecích stád podporuje existenci odlišného rodu v rámci Hepeviridae zahrnujícího alespoň tři různé genotypy.“ Veterinář Microbiol. 145 (1–2): 54–61. doi:10.1016 / j.vetmic.2010.03.014. PMID  20399575.
  6. ^ Zhao Q, Sun Y, Zhou E (2012). "[Detekce a popis viru ptačí hepatitidy E izolovaného v Číně - recenze]". Wei Sheng Wu Xue Bao (v čínštině). 52 (3): 279–85. PMID  22712397.
  7. ^ Lin J, Norder H, Uhlhorn H, Belák S, Widén F (2014). "Nový virus podobný hepatitidě E nalezený ve švédském losovi". J. Gen. Virol. 95 (Pt 3): 557–70. doi:10.1099 / vir.0.059238-0. PMC  3929172. PMID  24296469.
  8. ^ Batts W, Yun S, Hedrick R, Winton J (2011). „Nový člen čeledi Hepeviridae ze pstruha bezohledného (Oncorhynchus clarkii)". Virus Res. 158 (1–2): 116–23. doi:10.1016 / j.virusres.2011.03.019. PMID  21458509.
  9. ^ Meng XJ, Purcell RH, Halbur PG, Lehman JR, Webb DM, Tsareva TS, Haynes JS, Thacker BJ, Emerson SU (1997). „Nový virus u prasat úzce souvisí s lidským virem hepatitidy E“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (18): 9860–5. Bibcode:1997PNAS ... 94.9860M. doi:10.1073 / pnas.94.18.9860. PMC  23282. PMID  9275216.
  10. ^ Haqshenas G, Shivaprasad HL, Woolcock PR, Read DH, Meng XJ (2001). „Genetická identifikace a charakterizace nového viru souvisejícího s lidským virem hepatitidy E u kuřat se syndromem hepatitidy-splenomegalie ve Spojených státech“. J. Gen. Virol. 82 (10): 2449–62. doi:10.1099/0022-1317-82-10-2449. PMID  11562538.

externí odkazy