Informační systém o biologické rozmanitosti oceánů - Ocean Biodiversity Information System

Informační systém o biologické rozmanitosti oceánů
Typ webu
webový datový a informační systém
K dispozici vAngličtina
URLwww.obis.org
KomerčníNe
Registracenení požadováno
SpuštěnoBřezen 2002
Aktuální stavaktivní
Záznamy OBIS pro mořské mušle, Mola molak červenci 2018, vizualizováno mapovačem OBIS (www.obis.org)

The Informační systém o biologické rozmanitosti oceánů (OBIS), dříve Oceánský biogeografický informační systém, je webový přístupový bod k informacím o distribuci a množství života druh v oceán. Byl vyvinut jako součást správy informací v deseti letech Sčítání mořského života (CoML) (2001–2010), ale neomezuje se pouze na údaje odvozené z CoML, a jeho cílem je poskytnout integrovaný pohled na všechny údaje o mořské biologické rozmanitosti, které jí mohou příslušní správci údajů zpřístupnit na otevřeném základě. Podle svých webových stránek k červenci 2018 je OBIS „globálním otevřeným střediskem pro přístup k datům a informacím o mořské biologické rozmanitosti pro vědu, ochranu a udržitelný rozvoj.“ Na webu OBIS je uvedeno 8 konkrétních cílů, jejichž hlavní položkou je „Poskytnout [největší] vědeckou znalostní základnu na světě o rozmanitosti, distribuci a hojnosti všech mořských organismů v integrovaném a standardizovaném formátu“.[1]

Historie a současný stav

Počáteční myšlenky pro OBIS byly vyvinuty na setkání CoML o bentickém (mořském) oceánském životě v říjnu 1997. Doporučení z tohoto workshopu vedla na web (http://marine.rutgers.edu/OBIS ) ve společnosti Rutgers v roce 1998 k předvedení počáteční koncepce OBIS.[2] Ve dnech 3. – 4. Listopadu 1999 ve Washingtonu se konal zahajovací mezinárodní seminář OBIS, který vedl ke stanovení rozsahu projektu a oslovení potenciálních partnerů, přičemž vybrané příspěvky byly publikovány ve zvláštním čísle Oceánografie časopis,[3] v rámci kterého zakladatel OBIS Dr. J. F. Grassle vyjádřil vizi OBIS jako „online celosvětový atlas pro přístup, modelování a mapování mořských biologických dat ve vícerozměrném geografickém kontextu“.[4] V květnu 2000 americké vládní agentury v Národním oceánografickém partnerském programu spolu s Nadace Alfreda P. Sloana financovala osm výzkumných projektů na zahájení OBIS. V květnu 2001 USA Národní vědecká nadace financován Rutgersova univerzita vyvinout globální portál pro OBIS. Také v roce 2001 byl vytvořen mezinárodní výbor OBIS a jeho první zasedání se konalo v srpnu 2001.[5]

Produkční verze portálu OBIS byla spuštěna na Rutgers University v roce 2002 jako webová stránka http://www.iobis.org poskytující 430 000 druhů georeferencovaných datových záznamů z 8 partnerských databází, včetně záznamů o rybách z FishBase, hlavonožci z CephBase, korály z Biogeoinformatika hexakorálů, měkkýši z Databáze indicko-tichomořských měkkýšů a více.[6] Do května 2006 měl portál OBIS přístup k 9,5 milionům záznamů 59 000 druhů ze 112 databází, [7] a do prosince 2010 (na konci sčítání mořského života) poskytl přístup k 27,7 milionům záznamů představujících 167 000 názvů taxonů.[8] K červenci 2018 uvádí web OBIS, že systém poskytuje přístup k více než 45 milionům pozorování téměř 120 000 mořských druhů (snížený počet jmen, které jsou citovány, je výsledkem rozlišení synonym, tj. Snížení taxonů zaznamenaných pod více jmény na jedno přijatý název), na základě příspěvků 500 institucí z 56 zemí.[9]

V roce 2009 byl OBIS přijat jako projekt v rámci programu Mezinárodní oceánografické výměny dat a informací (IODE) Mezivládní oceánografická komise (MOV) ze dne UNESCO a v roce 2011, po ukončení financování Rutgersova sekretariátu a portálu Sloan Foundation, nabídka hostování Flanderský námořní institut (VLIZ) v Oostende, Belgie byl přijat, aby se stal dlouhodobým hostitelem systému, a také se sekretariát OBIS přesunul z Rutgers University do projektové kanceláře IOC pro IODE v Oostende, kde je v současné době udržován OBIS a probíhá další vývoj bez změny webové adresy. OBIS se tak nyní nachází v Oostende, ve stejné budově, kde sídlí také VLIZ. VLIZ udržuje dvě taxonomické databáze, Světový registr mořských druhů a IRMNG, Prozatímní registr mořských a podmořských rodů, z nichž oba přispívají k taxonomickým rozhodnutím používaným k řízení zobrazování druhů založených na informacích v OBIS a také poskytují taxonomickou hierarchii, pomocí které lze procházet obsah OBIS. OBIS je v současné době pod vedením IODE s doporučením řídící skupiny, řídící skupiny IODE pro OBIS (SG-OBIS); operační činnosti řídí výkonný výbor OBIS (OBIS-EC) s podporou 6 pracovních týmů OBIS. Sekretariát OBIS, který je hostitelem projektové kanceláře UNESCO / IOC pro IODE v Oostende (Belgie), zahrnuje projektového manažera a správce dat OBIS a kromě údržby systému OBIS poskytuje svým poskytovatelům dat také školení a technickou pomoc, vede nové údaje normy a technický rozvoj a podporuje mezinárodní spolupráci s cílem podpořit skupinové výhody sítě.[10]

Údaje dostupné prostřednictvím OBIS pokrývají všechny skupiny organismů, které mají jakoukoli souvislost s mořskými nebo ústí stanoviště, včetně břehových linií a atmosféry nad oceánem, například mořská obratlovců (ryby, mořští savci, želvy, mořští ptáci atd.); námořní bezobratlých (počítaje v to zooplankton ); námořní bakterie; a námořní rostliny (např. fytoplankton, mořské řasy, mangrovy).

Portál OBIS

Jak se vyvinuly dostupné webové technologie, Portál OBIS prošel od svého vzniku v roce 2002 řadou iterací. Zpočátku systém získával vzdálená data v reálném čase v reakci na dotaz uživatele a používal Mapovač KGS vizualizovat výsledky. V roce 2004 byla zavedena centralizovaná indexace metadat a ukládání do mezipaměti, což vedlo k rychlejším a spolehlivějším výsledkům, a mapovač c-čtverců byl přidán do možností pro vizualizaci dat.[11] V roce 2010 plno webový GIS Poprvé byl představen založený systém spolu s novou verzí webové stránky, která vyústila ve podstatně podrobnější a pružnější prezentaci výsledků vyhledávání spolu s řadou nových možností vyhledávání.[12] V dubnu 2018 bylo oznámeno financování vývoje nové „OBIS“ verze 2.0 se zlepšenými schopnostmi.[13]a je vydána 29. ledna 2019.[14]. URL webových stránek se změnilo z iobis.org na obis.org.

Regionální uzly OBIS

V období 2004 – současnost mezinárodní síť Regionální uzly OBIS také byly zřízeny, které usnadňují připojení zdrojů dat v jejich regionu k hlavní datové síti OBIS a také stále častěji poskytují specializované služby nebo pohledy na data OBIS uživatelům v jejich konkrétním regionu.

Hostitelem je belgická platforma pro biologickou rozmanitost, Brusel a Flanderský námořní institut, Oostende. Spravuje Bruno Danis
Hostitel Centro Nacional Patagonico - (CENPAT) - CONICET. Spravuje Mirtha Lewis
Hostitelem organizace Commonwealth pro vědecký a průmyslový výzkum - oceány a atmosféra. Spravuje Dave Watts
Moderuje Centrum mořské biologické rozmanitosti a Bedfordský institut oceánografie. Spravuje Bob Branton
Hostitelem Oceanology Institute. Spravováno společností Sun Xiaoxia
Hostila Vlaams Instituut voor de Zee. Spravováno Ward Appeltans
Hostitelem National Chemical Laboratory a National Institute of Oceanography. Spravuje Baba Ingole
Hostitelem Národního ústavu pro environmentální studia. Spravováno Junko Shimura
Hostitelem Národního institutu pro vodní a atmosférický výzkum. Spravuje Don Robertson
Hostitel jihoafrického datového centra pro oceánografii. Spravuje Marten Grundlingh
S hostitelem ASEAN Centrum pro biologickou rozmanitost. Spravuje Christian Elloran
Hostitelem University of Concepcion. Spravuje Ruben Escribando
Hostitelem je Univerzita v Sao Paulu (USP) a Referenční centrum pro informace o životním prostředí (CRIA). Spravuje Fabio Lang Da Silvera
Hostitelem geologické služby USA (USGS). Spravuje Mark Fornwall

Viz také

Vybrané publikace o OBIS

Reference

  1. ^ Web OBIS (navštíveno 18. července 2018)
  2. ^ Grassle, J.F. a Stocks, K.I., 1999. „Globální oceánský biogeografický informační systém (OBIS) pro sčítání mořského života.“ Oceánografie 12(3): 12-14.
  3. ^ Oceánografie Svazek 13, č. 3. listopadu 2000. Zvláštní vydání: Ocean Biogeographic Information System.
  4. ^ Grassle, J. F. 2000. „Oceánský biogeografický informační systém (OBIS): online celosvětový atlas pro přístup, modelování a mapování mořských biologických dat v multidimenzionálním geografickém kontextu.“ Oceánografie 13(3): 5-7.
  5. ^ Zhang, Y. a Grassle, J. F. 2003. „Portál pro oceánský biogeografický informační systém.“ Oceanologica Acta 25(5): 193-197.
  6. ^ „www.iobis.org: archivovaná verze, 20. března 2002“. Archivováno z původního dne 20. března 2002. Citováno 20. března 2002.
  7. ^ „www.iobis.org: archivovaná verze, 2. května 2006“. Archivováno z původního dne 2. května 2006. Citováno 2. května 2006.
  8. ^ www.obis.org: archivovaná verze, 13. prosince 2010
  9. ^ O OBIS: archivovaná verze, 5. července 2018
  10. ^ O OBIS: Správa
  11. ^ Tony Rees a Phoebe Zhang, 2007. „Vyvíjející se koncepty v architektuře a funkčnosti OBIS, oceánský biogeografický informační systém“. ve Vanden Berghe, E. a kol. (vyd.) Sborník z Informatiky o biologické rozmanitosti oceánů: mezinárodní konference o správě údajů o mořské biologické rozmanitosti, Hamburk, Německo, 29. listopadu - 1. prosince 2004. Zpráva IOC Workshop, 202, VLIZ Special Publication 37: str. 167-176.
  12. ^ Ei Fujioka et al., 2012. „Pokrok v globálním mořském biogeografickém výzkumu pomocí open-source GIS softwaru a cloud computingu.“ Transakce v GIS 16(2): 143–160.
  13. ^ „IOC investuje do OBIS2.0, významného přepracování platformy OBIS“,
  14. ^ „Vydán OBIS 2.0“,

externí odkazy

Mezinárodní portál OBIS

Regionální uzly OBIS

Tematické uzly

Mateřský projekt

Dějiny