Nudix hydroláza - Nudix hydrolase - Wikipedia
| NUDIX | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura MT-ADPRázy, Nudix hydrolázy z Mycobacterium tuberculosis | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | NUDIX | ||||||||
| Pfam | PF00293 | ||||||||
| Pfam klan | CL0261 | ||||||||
| InterPro | IPR000086 | ||||||||
| |||||||||
| NUDIX | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Krystalová struktura NADH pyrofosfatázy (1790429) z Escherichia coli k12 v rozlišení 2,20 | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | NUDIX | ||||||||
| Pfam | PF09296 | ||||||||
| Pfam klan | CL0261 | ||||||||
| InterPro | IPR015375 | ||||||||
| SCOP2 | 1vk6 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Nudix hydrolázy plocha nadčeleď hydrolytické enzymy schopné štěpení nukleosid difosfáty spojené s X (jakákoli skupina), proto jejich jméno.[1][2][3] Reakcí se získá nukleosidmonofosfát (NMP) plus X-P. Substráty hydrolyzované enzymy nudix obsahují širokou škálu organických pyrofosforečnanů, včetně nukleosidových di- a trifosfátů, dinukleosidových a difosfoinositolpolyfosfátů, nukleotidových cukrů a víček RNA, s různým stupněm specificity substrátu.[3] Enzymy nadrodiny Nudix se nacházejí ve všech typech organismů, včetně eukaryot, bakterií a archea.[3]
Rodina Nudix má dvě složky: takzvaný Nudixův záhyb beta listu s alfa helixy na každé straně a motiv Nudix, který obsahuje katalytické a kovové vazby aminokyseliny. Motiv Nudix je GXXXXXEXXXXXXXREUXEEXGU, kde U je isoleucin, leucin nebo valin a X je jakákoli aminokyselina. Tím se vytvoří krátká spirála, která (obvykle) obsahuje katalytické aminokyseliny. Nudix hydrolázy zahrnují Dcp2 z dekapírovací komplex, ADP-ribóza difosfatáza, MutT, ADPRase, Ap4A hydrolases, RppH a mnoho dalších.[4]
Reference
- ^ Bessman MJ, Frick DN, O'Handley SF (říjen 1996). „MutT proteiny nebo„ Nudix “hydrolázy, rodina všestranných, široce distribuovaných„ enzymů pro čištění “. J. Biol. Chem. 271 (41): 25059–62. doi:10.1074 / jbc.271.41.25059. PMID 8810257.
- ^ Mildvan AS, Xia Z, Azurmendi HF a kol. (Leden 2005). "Struktury a mechanismy Nudix hydrolases". Oblouk. Biochem. Biophys. 433 (1): 129–43. doi:10.1016 / j.abb.2004.08.017. PMID 15581572.
- ^ A b C McLennan AG (leden 2006). "Nadrodina hydrolázy Nudix". Buňka. Mol. Life Sci. 63 (2): 123–43. doi:10.1007 / s00018-005-5386-7. PMID 16378245.
- ^ Mildvan, A.S .; Xia, Z .; Azurmendi, H.F .; Saraswat, V .; Legler, P.M .; Massiah, M. A.; Gabelli, S.B .; Bianchet, M. A.; et al. (2005). "Struktury a mechanismy Nudix hydrolases". Archivy biochemie a biofyziky. 433 (1): 129–143. doi:10.1016 / j.abb.2004.08.017. PMID 15581572.