Nukleolární protein, člen A1 - Nucleolar protein, member A1

GAR1
Identifikátory
Aliasy	GAR1, NOLA1, Nukleolární protein, člen Al, GAR1 ribonukleoprotein
Externí ID	OMIM: 606468 HomoloGene: 137420 Genové karty: GAR1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	109,824,740 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba telomerázy RNA; • box H / ACA snoRNA vazba; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• komplex H / ACA snoRNP; • Cajal tělo; • box RNP komplex telomerázy H / ACA; • komplex H / ACA scaRNP; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • buněčné jádro; • komplex telomerázy a holoenzymu; • nukleoplazma; • fibrilární centrum; • jádro;
Biologický proces	• zpracování rRNA; • syntéza pseudouridinu; • údržba telomer prostřednictvím telomerázy; • ribozomální biogeneze; • Syntéza rRNA pseudouridinu; • snoRNA řízená syntéza roura pseudouridinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54433
	n / a
	ENSG00000109534
	n / a
	Q9NY12
	n / a
	NM_032993; NM_018983
	n / a
	NP_061856; NP_127460
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Podjednotka komplexu H / ACA ribonukleoproteinů 1 je protein že u lidí je kódován GAR1 gen.^[3]^[4]

Funkce

Tento gen je členem rodiny genů H / ACA snoRNP (malé nukleolární ribonukleoproteiny). snoRNP jsou zapojeny do různých aspektů zpracování a modifikace rRNA a byly rozděleny do dvou rodin: C / D a H / ACA. H / ACA snoRNP také zahrnují proteiny DKC1, NOLA2 a NOLA3. Tyto čtyři proteiny H / ACA snoRNP se lokalizují do hustých fibrilárních složek nukleol a do stočených (Cajal) těl v jádře. Produkce rSNA 18S i pseudouridylace rRNA jsou narušeny, pokud je některý ze čtyř proteinů vyčerpán. Tyto čtyři proteiny H / ACA snoRNP jsou také složkami komplexu telomerázy. Kódovaný protein tohoto genu obsahuje dvě domény bohaté na glycin a arginin a souvisí s Saccharomyces cerevisiae Garlp. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty sestřihu.^[4]

Interakce

Bylo prokázáno, že nukleolární protein, člen A1 komunikovat s SMN1.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000109534 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Dragon F, Pogacić V, Filipowicz W (květen 2000). „In vitro shromáždění lidských H / ACA malých nukleolárních RNP odhaluje jedinečné vlastnosti U17 a telomerasových RNA“. Mol Cell Biol. 20 (9): 3037–48. doi:10.1128 / MCB.20.30.3037-3048.2000. PMC 85579. PMID 10757788.
^ ^A ^b "Entrez Gene: NOLA1 rodina nukleolárních proteinů A, člen 1 (H / ACA malé nukleolární RNP)" ".
^ Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (červenec 2001). „Přežití proteinu motorických neuronů (SMN) interaguje s proteiny snoRNP fibrillarinem a GAR1“. Curr. Biol. 11 (14): 1079–88. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00316-5. PMID 11509230. S2CID 12392702.

Další čtení

Fujii Y, Zhao FX, Fu SC, Nakai N, Lai CY (1992). "Stabilní příprava izoenzymů aldózreduktázy z lidské placenty". Protein Expr. Purif. 2 (5–6): 420–5. doi:10.1016 / 1046-5928 (91) 90103-P. PMID 1821816.
Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (1995). „Počáteční hodnocení rozmanitosti lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
Ardell MD, Aragon I, Oliveira L, Porche GE, Burke E, Pittler SJ (1996). „Beta podjednotka lidského tyčového fotoreceptorového cGMP-kationového kationtového kanálu je generována z komplexní transkripční jednotky“. FEBS Lett. 389 (2): 213–8. doi:10.1016/0014-5793(96)00588-1. PMID 8766832. S2CID 37174534.
Pogacić V, Dragon F, Filipowicz W (2000). „Lidské H / ACA malé nukleolární RNP a telomeráza sdílejí evolučně konzervované proteiny NHP2 a NOP10“. Mol. Buňka. Biol. 20 (23): 9028–40. doi:10.1128 / MCB.20.23.9028-9040.2000. PMC 86556. PMID 11074001.
Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (2001). „Přežití proteinu motorických neuronů (SMN) interaguje s proteiny snoRNP fibrillarinem a GAR1“. Curr. Biol. 11 (14): 1079–88. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00316-5. PMID 11509230. S2CID 12392702.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Whitehead SE, Jones KW, Zhang X, Cheng X, Terns RM, Terns MP (2003). „Determinanty interakce proteinu SMN s spinální svalovou atrofií s dimethylargininem modifikovaným boxem H / ACA s malým nukleolárním ribonukleoproteinem GAR1“. J. Biol. Chem. 277 (50): 48087–93. doi:10,1074 / jbc.M204551200. PMID 12244096.
Wang C, Meier UT (2005). "Architektura a montáž savčích H / ACA malých nukleolárních a telomerázových ribonukleoproteinů". EMBO J.. 23 (8): 1857–67. doi:10.1038 / sj.emboj.7600181. PMC 394235. PMID 15044956.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000109534 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10757788-3] Dragon F, Pogacić V, Filipowicz W (květen 2000). „In vitro shromáždění lidských H / ACA malých nukleolárních RNP odhaluje jedinečné vlastnosti U17 a telomerasových RNA“. Mol Cell Biol. 20 (9): 3037–48. doi:10.1128 / MCB.20.30.3037-3048.2000. PMC 85579. PMID 10757788.

[entrez-4] A ^b "Entrez Gene: NOLA1 rodina nukleolárních proteinů A, člen 1 (H / ACA malé nukleolární RNP)" ".

[pmid11509230-5] Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (červenec 2001). „Přežití proteinu motorických neuronů (SMN) interaguje s proteiny snoRNP fibrillarinem a GAR1“. Curr. Biol. 11 (14): 1079–88. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00316-5. PMID 11509230. S2CID 12392702.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]