Nitratiruptor - Nitratiruptor
Nitratiruptor | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Království: | |
Kmen: | |
Třída: | |
Objednat: | |
Rodina: | |
Rod: | Nitratiruptor[1] Nakagawa a kol. 2005[2] |
Zadejte druh | |
Nitratiruptor tergarcus[2] | |
Druh | |
Nitratiruptor sp. (kmen SB155-2) je rod hlubinného moře gramnegativní ε-proteobakterie izolován od hydrotermálního pole Iheya North v Okinawa Trough (Japonsko).[3] Tento mikroorganismus ve tvaru tyče (0,5 x 1,5 µm) roste chemolithoautotroficky v široké škále donorů a akceptorů elektronů (tj. síry, vodíku, kyslíku a dusičnanů) při nedostatku světla a kyslíku. Je to také termofilní skupina schopná růst v rozmezí 37–65 ° C s optimem při 55 ° C.
Genetické rysy

Nitratiruptor sp. genom je složen z jediného kruhového chromozomu 1 877 931 bp s obsahem GC 43,8% a 39,7%.[4] Kvůli geochemické variabilitě v hlubinných hydrotermálních průduchech Nitratiruptor sp. vykazuje metabolickou všestrannost přizpůsobit se tomuto nepřátelskému prostředí, které zahrnuje ostré přechody ve zdrojích energie, akceptory elektronů nebo zdroje uhlíku. Například kvůli tekutinám bohatým na kov charakterizujícím tyto oblasti bylo popsáno celkem 17 genů souvisejících s transportními systémy a detoxikačními mechanismy těžkých kovů (včetně As, Cd a Cu). Přestože nejde o patogenní bakterii, vlastní některé virulentní geny (včetně virulenčního faktoru mviN, hemolyzinu nebo N-vázaného klastru glykosylačního genu), které poskytují patogenním příbuzným pohled na původ virulence, Helicobacter a Campylobacter druh.[5]
Reference
- ^ A b C „Nitratiruptor tergarcus“. www.uniprot.org.
- ^ A b C "Nitratiruptor". LPSN.
- ^ Nakagawa, satoshi; Takai, Ken; Inagaki, Fumio; Horikoshi, Koki; Sako, Yoshihiko (2005). „Nitratiruptor tergarcus gen. Nov., Sp. Nov. A Nitratifractor salsuginis gen. Nov., Sp. Nov., Dusičnany snižující chemolithoautotrofy ε-proteobakterií izolované z hlubinného hydrotermálního systému ve středokokavském žlabu“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 55 (2): 925–933. doi:10.1099 / ijs.0.63480-0. PMID 15774687.
- ^ „PATRIC“. www.patricbrc.org. Citováno 2019-06-07.
- ^ Horikoshi, Koki; Takai, Ken; Reysenbach, Anna-Louise; Shimamura, Shigeru; Takaki, Yoshihiro; Nakagawa, Satoshi (2007-07-17). „Hlubinné ventilační ε-proteobakteriální genomy poskytují pohled na výskyt patogenů“. Sborník Národní akademie věd. 104 (29): 12146–12150. doi:10.1073 / pnas.0700687104. ISSN 0027-8424. PMC 1907315. PMID 17615243.