MassTag-PCR - MassTag-PCR - Wikipedia
![]() | Tento článek má několik problémů. Prosím pomozte vylepši to nebo diskutovat o těchto otázkách na internetu diskusní stránka. (Zjistěte, jak a kdy tyto zprávy ze šablony odebrat) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony)
|
MassTag PCR je modifikace PCR na základě hmotnostní spektrometrie detekce konečného produktu. Tuto technologii propagoval vědec z Centra pro infekci a imunitu (CII) Mailman School of Public Health v Columbia University, USA.[Citace je zapotřebí ]
Zásady
Stejně jako konvenční PCR používá MassTag-PCR páry primerů. Rozdíl spočívá v tom, že primery použité pro MassTag PCR jsou označeny molekulami známých hmotností nebo MassCodes. Namísto jediného páru primerů používá tato technologie řadu primerů, což z ní dělá multiplexní systém. Na rozdíl od konvenčního systému Multiplex PCR lze v MassTag PCR použít více než 15 párů primerů. Li DNA z kteréhokoli z činidel panelu primerů bude přítomen, bude zesílen. Každý amplifikovaný produkt bude nést své specifické Masscodes. Produkt PCR se poté čistí, aby se odstranily nenavázané primery, dNTP, enzymy a další nečistoty. Nakonec jsou vyčištěné produkty PCR podrobeny UV světlo jako chemická vazba mezi nukleovými kyselinami a primery fotolab. Protože jsou Masscodes uvolňovány z produktů PCR, jsou detekovány pomocí hmotnostního spektrometru. Přítomnost specifického MassCode indikuje přítomnost specifického patogenu.[1]
Aplikace
Bylo zjištěno, že tato technika detekuje dříve necharakterizovaný clade rhinovirus.[2] MassTag PCR je komplexnější a citlivější diagnostická technika, CII dokázala určit příčinu tohoto onemocnění u 26 ze 79 dříve neznámých případů. MassTag PCR prokázala svou trojstrannou hodnotu jako nástroj pro sledování, detekci ohniska a epidemiologie.
Reference
- ^ Briese, T; et al. (Únor 2005). „Diagnostický systém pro rychlou a citlivou diferenciální detekci patogenů“. Emerg Infect Dis. 11 (2): 310–3. doi:10.3201 / eid1102.040492. PMC 3320438. PMID 15752453.
- ^ Dominguez, Samuel R .; et al. (Říjen 2008). „Multiplex MassTag-PCR pro respirační patogeny u pediatrických nazofaryngeálních výplachů negativní konvenčními diagnostickými testy ukazuje vysokou prevalenci virů patřících do nově rozpoznaného rhinovirového kladu“. Journal of Clinical Virology. 43 (2): 219–222. doi:10.1016 / j.jcv.2008.06.007. PMC 2603178. PMID 18674964.