Marilyn Kozak - Marilyn Kozak
Marilyn S. Kozak | |
---|---|
narozený | |
Národnost | americký |
Alma mater | Univerzita Johna Hopkinse |
Známý jako | Kozakova konsenzuální sekvence |
Vědecká kariéra | |
Pole | Mikrobiologie |
Instituce | Lékařská fakulta Roberta Wooda Johnsona |
Doktorský poradce | Daniel Nathans |
Ostatní akademičtí poradci | Aaron Shatkin |
Marilyn S. Kozak Ph.D. je Profesor z Biochemie na Lékařská fakulta Roberta Wooda Johnsona. Dříve byla na University of Medicine and Dentistry of New Jersey před sloučením školy. Získala a Ph.D v mikrobiologie podle Univerzita Johna Hopkinse studium syntézy Bakteriofág MS2, doporučeno Daniel Nathans.[1][2] Ve svém původním návrhu fakulty se snažila prostudovat mechanismus eukaryotický překlad zasvěcení, problém, o kterém se dlouho myslelo, že jej již vyřešil Joan Steitz. [3] Zatímco na katedře biologických věd v University of Pittsburgh, publikovala řadu studií, které zavedly skenovací model překlad zahájení a Kozakova konsenzuální sekvence.[4][5][6] Její aktuální výzkumné zájmy nejsou známy, protože její poslední publikace byla v roce 2008.[7]
Uznání
Marilyn Kozak byla uvedena v článku publikovaném jako jedna z 10 nejlepších vědkyň 80. let Vědec. To bylo uděleno na základě počtu citací za jejich publikovanou práci v letech 1981-1988. Během této doby měl Kozak 3 107 citací.[4] Její nejcitovanější práce byla z roku 1984 s názvem „Kompilace a analýza sekvencí proti směru od počátečního místa translace v eukaryotice mRNA ".[8] Tento článek zdůraznil výzkum, který přinesl známé buněčné mRNA z 32 na 166.
Kontroverze
V březnu 2001 zveřejnil Kozak mini-recenzi ve Journal of Molekulární a buněčná biologie s názvem „Nové způsoby zahájení překladu v eukaryotech?“ což vyústilo v návrat vědecké komunity.[9] Ve své publikaci Kozak diskutovala o svém váhání ohledně role interní místa vstupu ribozomu (IRES). Toto nejvíce vyvrátil Robert Schneider, který v prosinci 2001 publikoval ve stejném časopise stejný článek s odpovědí.[10] V této odpovědi Schneider tvrdila, že při zveřejnění své minirecenze Kozak doufala, že zvýší platnost svých vlastních zjištění. Dále uvedl, že Kozakova publikace neodpovídá vědeckým standardům a neměla být přijata do Journal of Molecular and Cellular Biology.[10] Pozdější dopady této diskuse, včetně tvrzení, že Kozak byl defundován ze strany Národní institut zdraví (NIH), byl prozkoumán v příspěvku na blogu „First Human Bioinformatician Criticizes Bad Science Of NIH-Funded Bigshots Disappears“, napsaném v roce 2015.[11]
Příspěvky
Spolu se svou publikovanou prací přispěla Kozak do vědecké komunity svou rolí v redakční radě časopisu Journal of Molecular and Cellular Biology. V letech 1983-1991 byla občas uvedena jako redaktorka.[12][13][14]
Vybraná díla
Toto je výběr Kozakovy práce, ale ne úplný seznam.
- Kozak, M (říjen 1987). „Analýza 5'-nekódujících sekvencí z 699 poselských RNA obratlovců“. Nucleic Acids Res. 15 (20): 8125–48. doi:10.1093 / nar / 15.20.8125. PMC 306349. PMID 3313277.[5]
- Kozak, M (listopad 1991). „Analýza sekvencí mRNA obratlovců: náznaky translační kontroly“. J. Cell Biol. 115 (4): 887–903. doi:10.1083 / jcb.115.4.887. PMC 2289952. PMID 1955461.[15]
- Kozak, M (1986). „Vlivy sekundární struktury mRNA na iniciaci eukaryotickými ribozomy“. Proc Natl Acad Sci U S A. 83 (9): 2850–4. Bibcode:1986PNAS ... 83,2850K. doi:10.1073 / pnas.83.9.2850. PMC 323404. PMID 3458245.[16]
- Kozak, M. (1989). „Model skenování pro překlad: aktualizace“. The Journal of Cell Biology. 108 (2): 229–241. doi:10.1083 / jcb.108.2.229. PMC 2115416. PMID 2645293..
- Kozak, M (1987). „Alespoň šest nukleotidů předcházejících kodon iniciátoru AUG zvyšuje translaci v savčích buňkách“. J Mol Biol. 196 (4): 947–50. doi:10.1016/0022-2836(87)90418-9. PMID 3681984.[17]
- Kozak, M (leden 1986). "Bodové mutace definují sekvenci lemující kodon AUG iniciátoru, který moduluje translaci eukaryotickými ribozomy". Buňka. 44 (2): 283–92. doi:10.1016/0092-8674(86)90762-2. PMID 3943125.[18]
- Kozak, M (1981). „Možná role lemujících nukleotidů při rozpoznávání kodonu AUG iniciátoru eukaryotickými ribozomy“. Nucleic Acids Res. 9 (20): 5233–52. doi:10.1093 / nar / 9.20.5233. PMC 327517. PMID 7301588.[19]
- Kozak, M (2008). „Chybné staré myšlenky o translační regulaci připravily půdu pro současné nejasnosti ohledně fungování mikroRNA“. Gen. 423 (2): 108–15. doi:10.1016 / j.gene.2008.07.013. PMID 18692553.[7]
Reference
- ^ Kozak, M; Nathans, D (březen 1972). „Překlad genomu bakteriofága ribonukleové kyseliny“. Bakteriologické recenze. 36 (1): 109–34. doi:10.1128 / MMBR.36.1.109-134.1972. PMC 378432. PMID 4555183.
- ^ Kozak, M; Nathans, D (14. září 1972). „Diferenciální inhibice syntézy proteinu MS2 kolifága antibiotiky zaměřenými na ribozomy“. Journal of Molecular Biology. 70 (1): 41–55. doi:10.1016/0022-2836(72)90162-3. PMID 4561347.
- ^ Kozak, Marilyn (4. října 1993). „Identifikace kodonů iniciátorů AUG“ (PDF). Citace Klasické komentáře. 36 (40). Citováno 4. července 2015.
- ^ A b Grissom, Abigail (15. října 1990). „Výzkum: 10 nejlepších vědkyň z 80. let: Rozdíl“. Vědec. Citováno 4. července 2015.
- ^ A b Kozak, M (26. října 1987). "Analýza 5'-nekódujících sekvencí z 699 obratlovců messenger RNA". Výzkum nukleových kyselin. 15 (20): 8125–48. doi:10.1093 / nar / 15.20.8125. PMC 306349. PMID 3313277.
- ^ Kozak, M (31. ledna 1986). "Bodové mutace definují sekvenci lemující kodon AUG iniciátoru, který moduluje translaci eukaryotickými ribozomy". Buňka. 44 (2): 283–92. doi:10.1016/0092-8674(86)90762-2. PMID 3943125.
- ^ A b Kozak, Marilyn (2008-11-01). „Chybné staré myšlenky o translační regulaci připravily půdu pro současné nejasnosti ohledně fungování mikroRNA.“ Gen. 423 (2): 108–115. doi:10.1016 / j.gene.2008.07.013. ISSN 0378-1119. PMID 18692553.
- ^ Kozak, Marilyn (1984-01-25). "Kompilace a analýza sekvencí upstream od počátečního místa translace v eukaryotických mRNA". Výzkum nukleových kyselin. 12 (2): 857–872. doi:10.1093 / nar / 12.2.857. ISSN 0305-1048. PMC 318541. PMID 6694911.
- ^ Kozak, Marilyn (2001-03-15). „Nové způsoby zahájení překladu v eukaryotech?“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (6): 1899–1907. doi:10.1128 / MCB.21.6.1899-1907.2001. ISSN 0270-7306. PMC 86772. PMID 11238926.
- ^ A b Schneider, Robert (2001). „Nové způsoby zahájení překladu v eukaryotech?“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (23): 8238–8246. doi:10.1128 / MCB.21.23.8238-8246.2001. ISSN 0270-7306. PMC 99989. PMID 11710333.
- ^ „První lidský bioinformatik kritizuje špatnou vědu o bigshotech financovaných NIH, zmizí“. Homolog.us. Citováno 2019-02-05.
- ^ „Redakční rada molekulární a buněčné biologie“ (PDF). Journal of Molecular and Cellular Biology. 1983. PMC 368623.
- ^ „Redakční rada molekulární a buněčné biologie“ (PDF). Journal of Molecular and Cellular Biology. 1988.
- ^ „Redakční rada molekulární a buněčné biologie“ (PDF). Journal of Molecular and Cellular Biology. 1991.
- ^ Kozak, M. (1991-11-15). „Analýza sekvencí mRNA obratlovců: náznaky translační kontroly“. The Journal of Cell Biology. 115 (4): 887–903. doi:10.1083 / jcb.115.4.887. ISSN 0021-9525. PMC 2289952. PMID 1955461.
- ^ Kozak, M. (01.05.186). "Vlivy sekundární struktury mRNA na iniciaci eukaryotickými ribozomy". Sborník Národní akademie věd. 83 (9): 2850–2854. Bibcode:1986PNAS ... 83,2850K. doi:10.1073 / pnas.83.9.2850. ISSN 0027-8424. PMC 323404. PMID 3458245.
- ^ Kozak, Marilyn (1987-08-20). „Alespoň šest nukleotidů předcházejících kodon iniciátoru AUG zvyšuje translaci v savčích buňkách“. Journal of Molecular Biology. 196 (4): 947–950. doi:10.1016/0022-2836(87)90418-9. ISSN 0022-2836. PMID 3681984.
- ^ Kozak, Marilyn (leden 1986). "Bodové mutace definují sekvenci lemující kodon AUG iniciátoru, který moduluje translaci eukaryotickými ribozomy". Buňka. 44 (2): 283–292. doi:10.1016/0092-8674(86)90762-2. ISSN 0092-8674. PMID 3943125.
- ^ Kozak, Marilyn (1981-10-24). „Možná role lemujících nukleotidů při rozpoznávání kodonu AUG iniciátoru eukaryotickými ribozomy“. Výzkum nukleových kyselin. 9 (20): 5233–5252. doi:10.1093 / nar / 9.20.5233. ISSN 0305-1048. PMC 327517. PMID 7301588.