MAVID - MAVID
 | Tento článek má několik problémů. Prosím pomozte vylepši to nebo diskutovat o těchto otázkách na internetu diskusní stránka. (Zjistěte, jak a kdy tyto zprávy ze šablony odebrat) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony)
|
| Vývojáři | Nicolas Bray (UC Berkeley ), Lior Pachter (UC Berkeley ) |
|---|---|
| Stabilní uvolnění | 2.0.4 |
| Operační systém | UNIX, Linux, Mac |
| Typ | Bioinformatický nástroj |
| Licence | Otevřený zdroj |
| webová stránka | Stažení MAVID |
MAVID je vícenásobné zarovnání sekvence program vhodný pro seřazení velkého počtu sekvencí DNA.[1][2] Sekvence mohou být malé mitochondriální genomy nebo velké genomové oblasti až do délky megabází. Nejnovější verze je 2.0.4.
Program lze použít prostřednictvím Webový server MAVID nebo jako samostatný program, který lze nainstalovat pomocí zdrojový kód.
Vstup výstup
Tento program přijímá sekvence v Formát FASTA.
Výstupní formát zahrnuje: Formát FASTA, Clustal, PHYLIP.
Reference
- ^ Dewey, Colin N. (2007), „Aligning Multiple Whole Genomes with Mercator and MAVID“, Bergman, Nicholas H. (ed.), Srovnávací genomikaMetody v molekulární biologii, 395, Humana Press, s. 221–235, doi:10.1007/978-1-59745-514-5_14, ISBN 978-1-58829-693-1, PMID 17993677
- ^ Bray, Nicolas; Pachter, Lior (01.07.2003). "MAVID server pro vícenásobné zarovnání". Výzkum nukleových kyselin. 31 (13): 3525–3526. doi:10.1093 / nar / gkg623. ISSN 0305-1048. PMC 169029. PMID 12824358.
- Bray, N .; Pachter, L. (2004), "MAVID: Omezené zarovnání předků více sekvencí", Výzkum genomu, 14 (4): 693–699, arXiv:q-bio / 0311018, doi:10,1101 / gr. 1960404, PMC 383315, PMID 15060012.
externí odkazy
  | Tento článek týkající se bioinformatiky je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |