Listeria Hfq vazba LhrC - Listeria Hfq binding LhrC

Listeria LhrC
RF00616.jpg
Identifikátory
SymbolLhrC
RfamRF00616
Další údaje
RNA typGen; sRNA
DoményBakterie
TAKSO: 0000655
PDB strukturPDBe

Listeria LhrC ncRNA byl identifikován skríninkem na molekuly RNA, které koimunoprecipitované s RNA chaperon Hfq.[1] Zdá se však, že stabilita ani aktivita LhrC nezávisí na přítomnosti Hfq.[2][3] Tato RNA je transkribována z intergenní oblasti mezi protein kódující geny cysK, domnělý cystein syntáza a sul, domnělý dihydropteroát syntáza. v Listeria monocytogenes v genomu byly identifikovány další čtyři kopie lhrC, z nichž tři jsou umístěny v tandemové repetici před původně charakterizovanou lhrC. Tato molekula RNA se zdá být mezi sebou konzervovaná Listeria druh, ale u jiných nebyl identifikován bakteriální druh. Je zapojen do virulence.[2] Přímé mRNA cíle LhrC jsou virulentní adheze LapB a oligopeptid vázající protein OppA.[2][3] 3 konzervované UCCC motivy společné pro všechny kopie LhrC se podílejí na vazbě mRNA a post-transkripční represi cílových genů. Další dva Listerina monocytogenes sRNA Rli22 a Rli33 obsahují 2 motivy UCCC a používají je k represi oppA exprese mRNA.[4]

Viz také

Reference

  1. ^ Christiansen JK, Nielsen JS, Ebersbach T, Valentin-Hansen P, Søgaard-Andersen L, Kallipolitis BH (2006). "Identifikace malých Hfq-vázajících RNA v Listeria monocytogenes". RNA. 12 (7): 1383–1396. doi:10,1261 / rna.49706. PMC  1484441. PMID  16682563.
  2. ^ A b C Sievers, S; Lillebaek, EM; Jacobsen, K; Lund, A; Mollerup, MS; Nielsen, PK; Kallipolitis, BH (17. července 2014). „Multikopická sRNA Listeria monocytogenes reguluje expresi virulence adhesinu LapB“. Výzkum nukleových kyselin. 42 (14): 9383–9398. doi:10.1093 / nar / gku630. PMC  4132741. PMID  25034691.
  3. ^ A b Sievers, Susanne; Lund, Anja; Menendez-Gil, Pilar; Nielsen, Aaraby; Storm Mollerup, Maria; Lambert Nielsen, Stine; Buch Larsson, Pernille; Borch-Jensen, Jonas; Johansson, Jörgen (2015). „Multikopická sRNA LhrC řídí expresi proteinu vázajícího oligopeptid OppA v Listeria monocytogenes“. RNA Biology. 12 (9): 985–997. doi:10.1080/15476286.2015.1071011. ISSN  1555-8584. PMC  4615310. PMID  26176322.
  4. ^ Mollerup, Maria Storm; Ross, Joseph Andrew; Helfer, Anne-Catherine; Meistrup, Kristine; Romby, Pascale; Kallipolitis, Birgitte Haahr (září 2016). „Dva noví členové rodiny LhrC malých RNA v Listeria monocytogenes s překrývajícími se regulačními funkcemi, ale charakteristickými expresními profily“. RNA Biology. 13 (9): 895–915. doi:10.1080/15476286.2016.1208332. ISSN  1555-8584. PMC  5013991. PMID  27400116.

externí odkazy