KDM1B - KDM1B

KDM1B
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4FWE, 4FWF, 4FWJ, 4GU0, 4GU1, 4 GUR, 4GUS, 4GUT, 4GUU, 4HSU
Identifikátory
Aliasy	KDM1B, AOF1, C6orf193, LSD2, bA204B7.3, dJ298J15.2, lysin demethyláza 1B
Externí ID	OMIM: 613081 HomoloGene: 131158 Genové karty: KDM1B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	18,223,854 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • Vazba DNA; • aktivita oxidoreduktázy; • vazba flavinadenin dinukleotidů; • aktivita histon demethylázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba iontů zinku; • aktivita histon demetylázy (specifická pro H3-dimethyl-K4); • aktivita histon demetylázy (specifická pro H3-monomethyl-K4); • histonová vazba; • Vazba FAD;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • nukleosom;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • regulace genové exprese pomocí genetického otisku; • regulace methylace DNA; • transkripce, chráněná DNA; • Methylace DNA zapojená do tvorby gamet; • oxidačně-redukční proces; • deubikvitinace bílkovin; • demetylace histonu H3-K4; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	221656
	n / a
	ENSG00000165097
	n / a
	Q8NB78
	n / a
	NM_153042; NM_001364614
	n / a
	NP_694587; NP_001351543
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Demysláza specifická pro lysin (K) 1B je protein že u lidí je kódován KDM1B gen.^[3]

Funkce

Flavin -závislý histon demetylázy, například KDM1B, regulovat methylace histon-lysin, an epigenetický značka, která reguluje genovou expresi a chromatin funkce.^[3]^[4]

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165097 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: Lysin (K) - specifická demetyláza 1B“.
^ Karytinos A, Forneris F, Profumo A, Ciossani G, Battaglioli E, Binda C, Mattevi A (červen 2009). "Nová savčí flavin-dependentní histonová demethyláza". The Journal of Biological Chemistry. 284 (26): 17775–82. doi:10,1074 / jbc.M109,003087. PMC 2719416. PMID 19407342.

Yu H, Mashtalir N, Daou S, Hammond-Martel I, Ross J, Sui G, Hart GW, Rauscher FJ, Drobetsky E, Milot E, Shi Y, Affar el B (listopad 2010). „Ubikvitin karboxylhydroláza BAP1 tvoří ternární komplex s YY1 a HCF-1 a je kritickým regulátorem genové exprese.“. Molekulární a buněčná biologie. 30 (21): 5071–85. doi:10.1128 / MCB.00396-10. PMC 2953049. PMID 20805357.
Fang R, Barbera AJ, Xu Y, Rutenberg M, Leonor T, Bi Q, Lan F, Mei P, Yuan GC, Lian C, Peng J, Cheng D, Sui G, Kaiser UB, Shi Y, Shi YG (červenec 2010 ). „Lidská LSD2 / KDM1b / AOF1 reguluje genovou transkripci modulací intragenní methylace H3K4me2“. Molekulární buňka. 39 (2): 222–33. doi:10.1016 / j.molcel.2010.07.008. PMC 3518444. PMID 20670891.
Ciccone DN, Su H, Hevi S, Gay F, Lei H, Bajko J, Xu G, Li E, Chen T (září 2009). „KDM1B je histonová H3K4 demetyláza nezbytná pro vytvoření genomových otisků matek“. Příroda. 461 (7262): 415–8. Bibcode:2009Natur.461..415C. doi:10.1038 / nature08315. PMID 19727073. S2CID 1143128.
Machida YJ, Machida Y, Vashisht AA, Wohlschlegel JA, Dutta A (prosinec 2009). „Deubikvitinační enzym BAP1 reguluje růst buněk prostřednictvím interakce s HCF-1“. The Journal of Biological Chemistry. 284 (49): 34179–88. doi:10.1074 / jbc.M109.046755. PMC 2797188. PMID 19815555.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.