Liga KAHA - KAHA Ligation

The ligace vytvářející amidy α-ketokyseliny a hydroxylaminu (KAHA) je chemická reakce, která se používá ke spojení dvou nechráněných fragmentů syntéza peptidů.[1][2] Je to alternativa k Nativní chemická ligace (NCL).KAHA Ligation vyvinula skupina Jeffrey W. Bode ve společnosti ETH Curych (dříve University of Pennsylvania).

Přehled

An α-ketokyselina na C-konec jednoho peptidového fragmentu reaguje s a hydroxylamin na N-konec jiného k vytvoření a peptidová vazba (amidová vazba).

Reakce může probíhat v přítomnosti nechráněných postranních řetězců a nevyžaduje žádná spojovací činidla nebo katalyzátory. Jedinými vedlejšími produkty jsou voda a CO2.

Ligace KAHA typu I (nemodifikovaná hydroxyskupina)
Ligace KAHA typu II (O-substituovaný hydroxylamin)

První popsaný protein syntetizovaný ligací KAHA byl člověk GLP-1 (7-36). Od té doby byla syntetizována celá řada malých proteinů (až 200 zbytků) ubikvitin a další podobné modifikující proteiny, hormonální proteiny, nitrophorin 4, S100A4 a cyklické proteiny.

C-koncové monomery ketokyselin jsou předem naneseny na pryskyřici pomocí linkeru pro Fmoc-SPPS (na bázi Fmoc syntéza peptidů na pevné fázi ). Počáteční výzkum používal linkery na bázi ylidu síry, ale v poslední době skupina vyvinula kyselé a fotolabilní monomery ketokyselin, které lze vložit přímo na pryskyřici Rink Amide.

Nejběžněji používaným N-terminálním hydroxylaminem je 5-oxaprolin, jehož výsledkem je a homoserin zbytek po ligaci a přesmyku O-N.

Reference

  1. ^ Bode, Jeffrey W .; Fox, Ryan M .; Baucom, Kyle D. (2006). "Chemoselektivní amidové ligace dekarboxylativní kondenzací N-alkylhydroxylaminů a α-ketokyselin". Angewandte Chemie. 118 (8): 1270–1274. doi:10.1002 / ange.200503991. ISSN  0044-8249.
  2. ^ Pusterla, Ivano; Bode, Jeffrey W. (2012). „Mechanismus ligace tvořící amid α-ketokyseliny-hydroxylaminu“. Angewandte Chemie. 124 (2): 528–531. doi:10.1002 / ange.201107198. ISSN  0044-8249.