Joseph DeRisi - Joseph DeRisi - Wikipedia

Joseph DeRisi
Národnostamerický
Alma materStanfordská Univerzita, University of California, Santa Cruz
Známý jakoViroChip, pracujte na identifikaci SARS virus, genová exprese v Plasmodium falciparum
Vědecká kariéra
PoleBiologie
InstituceUniversity of California, San Francisco Howard Hughes Medical Institute
Doktorský poradcePatrick O. Brown

Joseph DeRisi je americký biochemik, specializující se v molekulární biologie, parazitologie, genomika, virologie, a výpočetní biologie.

Život

Získal titul B.A. v Biochemii a molekulární biologii (1992) z University of California, Santa Cruz a Ph.D. v Biochemii (1999) od Stanfordská Univerzita.

Joseph DeRisi je v současné době a Howard Hughes Medical Institute (HHMI) Vyšetřovatel a profesor a předseda katedry Biochemie a Biofyzika na University of California, San Francisco (UCSF) se společným jmenováním na Kalifornský institut pro kvantitativní biologické vědy (QB3).

Nejznámější úspěchy DeRisi tisknou první celek pole genomu exprese (DeRisi, JL; Iyer, VR; Brown, PO (1997). "Zkoumání metabolické a genetické kontroly genové exprese v genomovém měřítku". Věda. 278 (5338): 680–6. Bibcode:1997Sci ... 278..680D. CiteSeerX  10.1.1.335.7937. doi:10.1126 / science.278.5338.680. PMID  9381177.), provedením první široké analýzy diferenciální genové exprese v rakovinných buňkách (DeRisi, J; Penland, L; Brown, PO; Bittner, ML; Meltzer, PS; Ray, M; Chen, Y; Su, YA; Trent, JM (1996). "Použití cDNA microarray k analýze vzorů genové exprese u lidské rakoviny". Nat Genet. 14 (4): 457–60. doi:10.1038 / ng1296-457. PMID  8944026. S2CID  23091561.), profilování genové exprese během celého životního cyklu malárie - způsobující prvoky Plasmodium falciparum,[1] jeho objev SARS virus,[2] a průkopnický objev virů pomocí genové hybridizační řady a technologií sekvenování DNA (Wang, D; Coscoy, L; Zylberberg, M; Avila, PC; Boushey, HA; Ganem, D; DeRisi, JL (2002). „Detekce na základě mikročipů a genotypizace virových patogenů“. Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (24): 15687–92. Bibcode:2002PNAS ... 9915687W. doi:10.1073 / pnas.242579699. PMC  137777. PMID  12429852.). Joe je také známý tím, že řeší jakýkoli „skvělý problém“, který obvykle přichází ve formě biologických otázek komplikovaných překážkami, které nelze překonat bez vynálezu nových protokolů a technik.

DeRisi používá mikročipy ve své práci značně navrhl a postavil hardware i software pro mikropole. Je zastáncem otevřený přístup na technologii microarray,[Citace je zapotřebí ] a udržuje webové stránky se softwarem a protokoly pro operace microarray.[Citace je zapotřebí ] Je také zastáncem publikování s otevřeným přístupem,[Citace je zapotřebí ] a má publikace v Veřejná knihovna vědy deníky.[3]

DeRisi identifikovala domnělé viry způsobující onemocnění u lidí (rakovina, SARS, další infekce dýchacích cest atd.) a zvířata od papoušků a korely po včely medonosné a hroznýše. On a výzkumný partner, Don Ganem, identifikovali parazita, Nosema ceranae, který se zdá být zodpovědný za kolaps kolonií včel.[4] Rovněž zrušil vztah virů k určitým podmnožinám lidské rakoviny.

Snad nejdůležitější pro současné globální zdraví na základě rozsáhlé charakterizace malárie - způsobující patogen, Plasmodium falciparum „Skupina DeRisi vyvinula hluboce slibné kandidátské léky na léčbu malárie a model vakcíny k prevenci malárie.

V roce 2004 byl DeRisi jmenován a MacArthurův kolega (ocenění „Genius“), byl v roce 2008 oceněn 14. ročník Heinzova cena pro technologie, ekonomiku a zaměstnanost a v roce 2014 obdržel od Národní akademie věd Cenu Johna J. Cartyho za rozvoj vědy. V roce 2016 byl zvolen do Národní akademie věd.[5]

Podílel se na vývoji ViroChip, který se používá k rychlé identifikaci virů v tělesných tekutinách. Byl použit k identifikaci Vážný akutní syndrom dýchací soustavy virus v roce 2003. Podílel se také na vývoji online platformy s názvem IDseq,[6] opírající se o Iniciativa Chan Zuckerberg který se používá k identifikaci virů z metagenomické sekvenování data.[7]

Ocenění

Reference

  1. ^ Llinas, Manuel; Bozdech, Zbynek; Wong, Edith D .; Adai, Alex T .; Derisi, Joseph L. (2006), „Srovnávací transkriptomová analýza celého genomu tří kmenů Plasmodium falciparum“, Výzkum nukleových kyselin, 34 (4): 1166, doi:10.1093 / nar / gkj517, PMC  1380255, PMID  16493140
  2. ^ Rota, Paul A .; Oberste, M. Steven; Monroe, Stephan S .; Nix, W. Allan; Campagnoli, Ray; Icenogle, Joseph P .; Penaranda, Silvia; Bankamp, ​​Bettina; Maher, Kaija; Bellini, William J. (2003), „Charakterizace nového koronaviru spojeného s těžkým akutním respiračním syndromem“, Věda, 300 (5624): 1394, Bibcode:2003Sci ... 300.1394R, doi:10.1126 / science.1085952, PMID  12730500
  3. ^ Bozdech, Zbynek; Llinás, Manuel; Pulliam, Brian Lee; Wong, Edith D .; Zhu, Jingchun; Derisi, Joseph L. (2003), „Transkriptom intratrathrocytového vývojového cyklu Plasmodium falciparum“, PLOS Biology, 1 (1): e5, doi:10.1371 / journal.pbio.0000005, PMC  176545, PMID  12929205 otevřený přístup
  4. ^ „UCSF Sleuths identifikuje podezřelé z tajemství mizejících včel“.
  5. ^ Zvolen člen Národní akademie věd a zahraniční spolupracovníci Zprávy z Národní akademie věd, Národní akademie věd, 3. května 2016, archivovány od originál 6. května 2016, vyvoláno 2016-05-14.
  6. ^ Kalantar, Katrina L; Carvalho, Tiago; de Bourcy, Charles FA; Dimitrov, Boris; Dingle, Greg; Egger, Rebecca; Han, Julie; Holmes, Olivia B; Juan, Yun-Fang; King, Ryan; Kislyuk, Andrey (říjen 2020). „IDseq - otevřená cloudová cloudová služba pro analýzu a detekci a monitorování metagenomických patogenů“. GigaScience. 9 (10). doi:10.1093 / gigascience / giaa111. ISSN  2047-217X.
  7. ^ „Jednodušší způsob, jak se dostat na dno záhadných nemocí v chudých zemích“. Atlantik. 16. října 2018. Citováno 27. listopadu 2018.

externí odkazy