Interolog - Interolog - Wikipedia
An interolog je konzervativní interakce mezi dvojicí bílkoviny které interagují homology v jiném organismu. Termín byl představen v článku z roku 2000 Walhoutem a kol.[1][2]
Příklad
Předpokládejme, že A a B jsou dva různé interagující lidské proteiny a A 'a B' jsou dva různé interagující psí proteiny. Interakce mezi A a B je pak interologem interakce mezi A 'a B', pokud platí všechny následující podmínky:
- A je homolog A '. (Proteinové homology mají podobné aminokyselina sekvence a jsou odvozeny ze společné rodové sekvence).
- B je homolog B '.
- A a B interagují.
- A 'a B' interagují.
Interology jsou tedy homologní páry proteinových interakcí mezi různými organismy.
Viz také
Reference
- ^ Walhout, A. J .; Sordella, R .; Lu, X .; Hartley, J.L .; Temple, G. F .; Brasch, M. A .; Thierry-Mieg, N .; Vidal, M. (2000). "Mapování proteinových interakcí u C. Elegans s využitím proteinů podílejících se na vývoji vulvalů". Věda. 287 (5450): 116–122. Bibcode:2000 sci ... 287..116 W.. doi:10.1126 / science.287.5450.116. PMID 10615043.
- ^ Yu, H .; Luscombe, N. M .; Lu, H. X .; Zhu, X .; Xia, Y .; Han, J. D .; Bertin, N .; Chung, S .; Vidal, M .; Gerstein, M. (2004). „Přenos anotací mezi geny: Interlogy protein-protein a regulogy protein-DNA“. Výzkum genomu. 14 (6): 1107–1118. doi:10,1101 / gr. 1774904. PMC 419789. PMID 15173116.
- Yu, H .; Luscombe, N. M .; Lu, H. X .; Zhu, X .; Xia, Y .; Han, J. D .; Bertin, N .; Chung, S .; Vidal, M .; Gerstein, M. (2004). „Přenos anotací mezi geny: Interlogy protein-protein a regulogy protein-DNA“. Výzkum genomu. 14 (6): 1107–1118. doi:10,1101 / gr. 1774904. PMC 419789. PMID 15173116.
- Kemmer, D .; Huang, Y .; Shah, S. P .; Lim, J .; Brumm, J .; Yuen, M. M .; Ling, J .; Xu, T .; Wasserman, W. W .; Ouellette, B. F. (2005). „Ulysses - aplikace pro projekci molekulárních interakcí mezi druhy“. Genome Biology. 6 (12): R106. doi:10.1186 / gb-2005-6-12-r106. PMC 1414088. PMID 16356269.
- Wiles, A. M .; Doderer, M .; Ruan, J .; Gu, T. T .; Ravi, D .; Blackman, B .; Bishop, A. J. (2010). „Budování a analýza proteinových interaktivních sítí pomocí mezidruhových srovnání“. Biologie systémů BMC. 4: 36. doi:10.1186/1752-0509-4-36. PMC 2859380. PMID 20353594.
externí odkazy
- Interactome.org: Portálový web Interactome.
- Interactomics.org: Webový portál Interactomics.
- [1]: Místo predikce mezidruhové interakce.
  | Tento článek týkající se bioinformatiky je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |