Mezinárodní laboratoř mozku - International Brain Laboratory

The Mezinárodní laboratoř mozku (IBL) je společná výzkumná skupina, jejímž cílem je vyvinout první globální model rozhodování u myší.[1][2] V jeho první fázi členové IBL zaznamenávají 100 000 neuronů napříč všemi mozkovými strukturami u myší a provádějí totéž rozhodnutí. IBL byl oficiálně spuštěn v září 2017[3][4] díky grantu 10 milionů dolarů od Simonsova nadace a grant 10 milionů liber z Wellcome Trust.
První hlavní vědecké milníky projektu jsou vývoj datové architektury open source pro rozsáhlou spolupráci v neurovědě[5] a replikace chování ve všech experimentálních laboratořích.[6] Na konci roku 2019 zveřejnil IBL údaje o chování obsahující téměř 3 miliony možností myši.[6] Následující milník zahrnuje sestavení mozkové mapy činnosti. Tato mapa aktivity je získána pomocí Neuropixely sondy, které umožňují záznam až 300 - 1 000 neuronů současně.[7] Ve druhé fázi budou použity další záznamové technologie, jako je zobrazování vápníku. Tato data budou poté analyzována a integrována za účelem vytvoření mozkového modelu rozhodování.
Původ
IBL byla založena v roce 2016 společností Zachary Mainen (Champalimaud Center of the Unknown), Michael Hausser (University College v Londýně ), a Alexandre Pouget (University of Geneva ). Tito vědci argumentovali v článku publikovaném ve stejném roce[8] že vzhledem ke složitosti otázek v neurovědě a rozsahu technických výzev se zdá nepravděpodobné, že by výzkum prováděný jednotlivými laboratořemi stačil k pochopení toho, jak mozek funguje. Inspirováni pozoruhodným úspěchem rozsáhlých spolupráce ve fyzice, jako je CERN nebo LIGO, navrhli vytvoření podobných zaměřených spoluprácí v neurovědě založených na několika základních principech:
- Společný ambiciózní, ale realistický cíl (např. Celorepublikový model rozhodování u jednoho druhu),
- Úzká koordinace mezi teoretiky a experimentátory.
- Standardizace úkolů v oblasti chování, hardware a analýza dat k zajištění reprodukovatelnost a umožnění sdružování dat,
- Otevřený přístup k datům a zdrojům v rámci spolupráce i mimo ni a
- Relativně plochá hierarchie a společný rozhodovací proces.
Tyto principy jsou jádrem spolupráce IBL.[1]
Členství
K Mainenovi, Hausserovi a Pougetovi se v roce 2016 připojili
- Larry Abbott (Columbia University)
- Dora Angelaki (New York University)
- Matteo Carandini (University College v Londýně )
- Anne Churchland (University of California Los Angeles)
- Yang Dan (University of California Berkeley)
- Peter Dayan (Max Planck Institute Tuebingen)
- Sophie Deneve (Ecole Normale Superieure )
- Ila Fiete (Massachusetts Institute of Technology)
- Surya Ganguli (Stanfordská Univerzita)
- Kenneth Harris (University College v Londýně )
- Peter Latham (University College v Londýně )
- Sonja Hofer (University College v Londýně )
- Tom Mrsic-Flogel (University College v Londýně )
- Liam Paninski (Columbia University)
- Jonathan Pillow (Princeton University)
- Ilana Witten (Univerzita Princeton)
- Tony Zador (Cold Spring Harbor Laboratory)
David Tank a Carlos Brody (oba na Princetonské univerzitě) se připojili v roce 2016, ale v roce 2017 kvůli střetu zájmů ustoupili. Nick Steinmetz (University of Washington ) se připojil v roce 2019 a Tatiana Engel (Cold Spring Harbor Laboratory ) v roce 2020.
Reference
- ^ A b Abbott, Larry F .; Angelaki, Dora E .; Carandini, Matteo; Churchland, Anne K .; Dan, Yang; Dayan, Peter; Deneve, Sophie; Fiete, Ila; Ganguli, Surya; Harris, Kenneth D .; Häusser, Michael (2017). „Mezinárodní laboratoř pro systémy a výpočetní neurovědy“. Neuron. 96 (6): 1213–1218. doi:10.1016 / j.neuron.2017.12.013. PMC 5752703. PMID 29268092.
- ^ Vogt, Nina (06.01.2020). „Kolaborativní neurověda“. Přírodní metody. 17 (1): 22–22. doi:10.1038 / s41592-019-0706-2. ISSN 1548-7105.
- ^ Ukázka, Ian (2017-09-19). „Ambiciózní neurovědecký projekt, jehož cílem je zjistit, jak mozek rozhoduje“. Opatrovník. ISSN 0261-3077. Citováno 2020-01-31.
- ^ Abbott, Alison (2017-09-21). „Vědci se spojili při hledání„ standardního modelu “mozku“. Zprávy o přírodě. 549 (7672): 319–320. Bibcode:2017Natur.549..319A. doi:10.1038 / 549319a. PMID 28933448.
- ^ Bonacchi, Niccolò; Chapuis, Gaelle; Churchland, Anne; Harris, Kenneth D .; Hunter, Max; Rossant, Cyrille; Sasaki, Maho; Shen, Shan; Steinmetz, Nicholas A .; Walker, Edgar Y .; Winter, Olivier; Wells, Miles (2020). „Datová architektura a vizualizace pro rozsáhlou spolupráci v neurovědě“. bioRxiv: 827873. doi:10.1101/827873.
- ^ A b International Brain Laboratory (2020). „Standardizovaná a reprodukovatelná metoda měření rozhodování u myší“. bioRxiv. doi:10.1101/2020.01.17.909838.
- ^ "Domov". Neuropixely. Citováno 2020-04-26.
- ^ Mainen, Zachary F .; Häusser, Michael; Pouget, Alexandre (2016). „Lepší způsob, jak prolomit mozek“. Příroda. 539 (7628): 159–161. Bibcode:2016Natur.539..159M. doi:10.1038 / 539159a. ISSN 0028-0836. PMID 27830818.