Ila Fiete - Ila Fiete

Ila Fiete
Národnostamerický
Alma materB.A. Michiganská univerzita, M.Sc. a Ph.D. Harvardská Univerzita
Známý jakoModelování neurálních výpočtů, které jsou základem krátkodobé paměti, integrace a závěru
Ocenění2018 CIFAR Senior Fellow, 2016 Howard Hughes Faculty Scholar, 2013 CNS Excellence Award for Teaching - College of Natural Sciences University of Texas at Austin, 2011-2013 McKnight Scholar, 2013 Office of Naval Research Young Investigator, 2010 Searle Scholar, 2009 Alfred P. Člen nadace Sloan v oboru neurovědy
Vědecká kariéra
PoleFyzika a výpočetní neurovědy
InstituceMcGovern Institute na Massachusetts Institute of Technology

Ila Fiete je indicko-americký fyzik a výpočetní neuro vědec stejně jako profesor na katedře mozkových a kognitivních věd v rámci EU McGovern Institute for Brain Research na Massachusetts Institute of Technology. Fiete staví teoretické modely a analyzuje neurální data a odhaluje, jak neurální obvody provádějí výpočty a jak mozek reprezentuje a manipuluje s informacemi zapojenými do paměti a uvažování.

Raný život a vzdělávání

Fiete se narodil v Bombaji v Indii. Pokračovala v postgraduálním studiu na Michiganská univerzita, obor matematika a fyzika.[1] Fiete se poté přesunul do Boston pokračovat v magisterském a postgraduálním studiu na Harvardská Univerzita na katedře fyziky.[1] Fiete byl mentorován ve výpočetní neurovědě Sebastian Seung na MIT[2] a ve fyzice Daniel Fisher na Harvard.[3] Ve svém postgraduálním studiu zkoumala Fiete principy učení a kódování v biologických neuronových sítích.[4]

Fiete ukončila postgraduální studium v ​​roce 2003 a přestěhovala se po celé zemi, aby se jmenovala postdoktorandkou na Kavli Institute for Theoretical Physics at the University of California, Santa Barbara od roku 2004 do roku 2006.[1] Během této doby byla Fiete také hostujícím členem Centra pro teoretickou biofyziku na Univerzitě Karlově University of California, San Diego.[1] Od roku 2006 do roku 2008 působil Fiete jako široký pracovník v mozkových obvodech v Caltech pod vedením mentora Christof Koch.[5]

Diplomová práce - kódování v biologických neurálních obvodech

Během postgraduálního studia Fiete a její kolegové pomocí lineárních sítí učení ukázali, že řídké časové neurální kódy minimalizují synaptické interference a usnadňují učení u zpěvných ptáků.[6] Fiete pak začal zkoumat výpočetní principy, které jsou základem synaptické plasticity.[4] Navrhla pravidlo synaptického zesílení k provádění cíleného učení v opakujících se sítích neuronů založených na rychlosti a rychlosti. Pravidlo provádí stochastický gradientní výstup na odměnu.[4] Konkrétně, pokud signál odměny kvantifikuje výkon sítě, pak je pravidlo plasticity schopné řídit cílené učení v síti.[4] Fiete použila svůj model na neurofyziologická data zpěvných ptáků a zjistila, že pravidlo učení založené na pokusu a omylu bylo dostatečně rychlé, aby vysvětlilo učení u zpěvných ptáků.[7]

Mřížkové buňky

Když Fiete zahájila postdoktorský výzkum, začala studovat principy kódování buněk v mozku, které kódují polohu. V roce 2006 popsali Fiete a její kolegové rámec pro porozumění výpočtům buněk mřížky v entorhinální kůře a jak kódují polohy krys.[8] Ukázali, že reprezentace je analogická systému čísel reziduí, který umožňuje malému počtu buněk reprezentovat a aktualizovat polohu krysy na velké vzdálenosti nebo ve více prostředích.[8] Tato hypotéza se velmi liší od ostatních ohledně toho, jak se kódování provádí v mozku, a tento číselný systém „vhodný pro aritmetiku“ zdůrazňuje vynalézavost neurálních kódů.[8]

Kariéra a výzkum

V roce 2008 se Fiete připojila k fakultě University of Texas v Austinu.[1] Zatímco v UT Austin, Fiete významně ovlivnil komunitu jako výzkumný pracovník i pedagog, obdržel cenu CNS Excellence Award 2013 for Teaching od College of Natural Sciences University of Texas, Austin.[9] Poté, co sloužil na fakultě 10 let a založil Centrum pro teoretické a výpočetní neurovědy [10] tam v roce 2018 Fiete přijala nabídku od Massachusetts Institute of Technology a stal se docentem s funkcí na katedře mozkových a kognitivních věd.[1] Na začátku roku 2019 se Fiete připojil k McGovern Institute na MIT jako spolupracovník vyšetřovatele.[8] V květnu 2020 byl Fiete povýšen na profesora na katedře mozkových a kognitivních věd na MIT. Výzkumný program Fiete je zaměřen na pochopení toho, proč mozek obsahuje konkrétní vlastnosti kódování a jak základem těchto principů kódování je konektivita a dynamika neurálních obvodů a synaptická plasticita.[11] Její laboratoř využívá numerické a teoretické modelování i surová neurální data, pomocí nichž testuje své modely mozkových výpočtů.[11]

Výpočty buněk v mřížce

Fiete a její kolegové v UT Austin zajímali se o prozkoumání neurálních výpočtů pod buňkami mřížky v entorhinální kůře.[12] Je známo, že mřížkové buňky kódují prostorové umístění u savců při jejich putování světem. Fiete a její kolegové zjistili, že výpočty buněk mřížky mohou vycházet z procesu formování vzorů a lze je modelovat kontinuálními atraktorovými sítěmi.[13] Se vstupy označujícími rychlost a směr kurzu zvířete mohou modely kontinuálního atraktoru generovat trojúhelníkové odezvy mřížky, které kódují aktualizované odhady polohy ve dvojrozměrných prostorech.[12] Dále dokazují, s důkazem koncepce, že kontinuální dynamika atraktorů je základem integrace rychlosti v buňkách mřížky.[12] V roce 2013 Fiete a její kolegové použili neurální záznamy in vivo jako základ pro své výpočetní vyšetřování mechanismů, které jsou základem aktivity buněk mřížky.[14] Jejich model, spoléhající se na nízkodimenzionální dynamiku kontinuálního atraktoru, spolehlivě charakterizoval reakce buněk mřížky v krátkém trvání, známé skříně.[14] V průběhu času a za měnících se podmínek se jednotlivé reakce buněk mřížky mění, ale poměry parametrů mřížky a relativní fáze mezi současně zaznamenanými buňkami zůstávají v podstatě konstantní, což ukazuje, že reakce na úrovni populace jsou neměnné.[14] Jejich zjištění argumentují proti hypotéze buněčného prostředí, protože zjišťují, že stabilita odpovědí buňka-buňka je robustnější než reakce buňka-prostředí.[14]

Následující rok Fiete popsal model vysvětlující vývoj buněk mřížky, od okamžiku otevření oka až po plně vyvinuté výpočty buněk mřížky.[15] Na začátku jejich model zobrazuje zpočátku nestrukturované sítě neuronů stoupajících k vstupům rychlosti a polohy.[15] Navrhují prostřednictvím výpočetního modelování, aby mřížkové neurony vyvinuly organizovanou rekurentní architekturu založenou na podobnosti jejich vstupů, působících prostřednictvím inhibičních neuronů, a to položilo základ pro vyspělou síťovou buňku mřížky, která dokáže vypočítat rychlost a umístění koordinovaně a integrovaně móda.[15]

Fiete se poté zajímal o vývoj robustního systému, pomocí kterého by bylo možné určit mechanismy nervového obvodu, které jsou základem funkce mozku a které se nespoléhají pouze na pozorování nervové aktivity.[16] Pomocí systému buněk mřížky, který Fiete rozsáhle zkoumal a slouží jako dobrý systém pro testování výpočetních modelů, Fiete ukázal, že model „distribuce relativních fázových posunů“ má potenciál odhalit vysoce detailní kortikální obvodové mechanismy z řídkých neurálních záznamů.[16] Pomocí perturbativních experimentů zjistili, že jejich metoda je schopna rozlišovat mezi dopřednou a opakující se neuronovou sítí a odhalit, který model nejpřesněji popisuje neurální výpočty.[16]

V roce 2019, jakmile Fiete dorazila na MIT, vydala článek pomocí topologického modelování k transformaci nervové aktivity velkých populací neuronů do datového mraku představujícího tvar prstence.[17] Toto prstencové prostorové znázornění nervové aktivity bylo ukázáno u much, které jsou základem směru hlavy, a nyní, podle Fiete, bylo prokázáno, že představuje směr hlavy u myší - jako vnitřní kompas.[17] Kruhový tvar, který vytváří neurální aktivita, je ve výpočtových analýzách znám jako potrubí, což je tvar reprezentovaný ve více dimenzích, který zobrazuje multidimenzionální data.[18] Jeho tvar a rozměrnost představují data interpretovatelnějším způsobem.[18] Přístup, který Fiete popisuje, pomocí potrubí k zobrazení nervové aktivity, umožňuje slepý (bez dohledu) objev a dekódování konkrétních proměnných pomocí pouze neurální aktivity jako vstupu.[18]

Ceny a vyznamenání

  • 2018 CIFAR Senior Fellow[11]
  • 2016 Howard Hughes Faculty Scholar[19]
  • Cena CNS Excellence 2013 for Teaching - College of Natural Sciences University of Texas at Austin[9]
  • McKnight Scholar 2011-2013[20]
  • 2013 Office of Naval Research Young Investigator[21]
  • 2010 Searle Scholar[22]
  • 2009 Člen nadace Alfreda P. Sloana v oboru neurovědy[23]

Reference

  1. ^ A b C d E F „Škola vědy vítá 10 profesorů“. Zprávy MIT. Citováno 2020-04-26.
  2. ^ „Ila Fiete“. Simonsova nadace. 2014-10-13. Citováno 2020-04-26.
  3. ^ „Fyzikální strom - Ila R. Fiete“. academictree.org. Citováno 2020-04-26.
  4. ^ A b C d Ila, Fiete. „Učení a kódování v biologických neuronových sítích“ (PDF). Katedra fyziky - Harvard. Citováno 25. dubna 2020.
  5. ^ „Fyzikální strom - rodokmen Ily R. Fiete“. academictree.org. Citováno 2020-04-26.
  6. ^ Fiete, Ila R .; Hahnloser, Richard H. R .; Poplatek, Michale S .; Seung, H. Sebastian (říjen 2004). „Časová řídkost předmotorového pohonu je důležitá pro rychlé učení v modelu neuronové sítě ptačího zpěvu“. Journal of Neurophysiology. 92 (4): 2274–2282. doi:10.1152 / jn.01133.2003. ISSN  0022-3077. PMID  15071087.
  7. ^ Fiete, Ila R .; Poplatek, Michale S .; Seung, H. Sebastian (říjen 2007). "Model učení ptačího zpěvu založený na odhadu gradientu dynamickým rušením nervových vodivosti". Journal of Neurophysiology. 98 (4): 2038–2057. doi:10.1152 / jn.01311.2006. ISSN  0022-3077. PMID  17652414.
  8. ^ A b C d Burak, Yoram; Brookings, Ted; Fiete, Ila (06.06.2006). „Trojúhelníkové mřížkové neurony mohou implementovat pokročilý numerický systém pro přesné kódování polohy krysy ve velkých rozsazích“. arXiv:q-bio / 0606005.
  9. ^ A b „Dr. Ila Fiete získala cenu CNS Teaching Excellence Award - Centrum pro učení a paměť“. Citováno 2020-04-26.
  10. ^ "Centrum pro teoretické a výpočetní neurovědy".
  11. ^ A b C „The Fiete Lab @ MIT“. Fiete Lab @ MIT. Citováno 2020-04-26.
  12. ^ A b C Burak, Yoram; Fiete, Ila R. (únor 2009). „Přesná integrace cesty v sítových modelech kontinuálních atraktorů buněk mřížky“. PLOS výpočetní biologie. 5 (2): e1000291. arXiv:0811.1826. Bibcode:2009PLSCB ... 5E0291B. doi:10.1371 / journal.pcbi.1000291. ISSN  1553-7358. PMC  2632741. PMID  19229307.
  13. ^ "Nepřetržitý model atraktoru pro aktivitu buněk mřížky". CiteSeerX  10.1.1.508.1448. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  14. ^ A b C d Yoon, KiJung; Buice, Michael A .; Barry, Caswell; Hayman, Robin; Burgess, Neil; Fiete, Ila R. (srpen 2013). „Specifický důkaz nízkodimenzionální dynamiky kontinuálního atraktoru v buňkách mřížky“. Přírodní neurovědy. 16 (8): 1077–1084. doi:10.1038 / č. 3450. ISSN  1546-1726. PMC  3797513. PMID  23852111.
  15. ^ A b C Widloski, John; Fiete, Ila R. (2014-07-16). „Model vývoje buněk mřížky prostřednictvím prostorového průzkumu a špičkové časově závislé plasticity“. Neuron. 83 (2): 481–495. doi:10.1016 / j.neuron.2014.06.018. ISSN  1097-4199. PMID  25033187.
  16. ^ A b C Widloski, John; Marder, Michael P; Fiete, Ila R (07.07.2018). Derdikman, Dori; Frank, Michael J (eds.). „Odvození obvodových mechanismů od řídkého nervového záznamu a globálního rušení v buňkách mřížky“. eLife. 7: e33503. doi:10,7554 / eLife.33503. ISSN  2050-084X. PMC  6078497. PMID  29985132.
  17. ^ A b „Nalezení mozkového kompasu“. Institut MIT McGovern. 2019-08-12. Citováno 2020-04-26.
  18. ^ A b C Chaudhuri, Rishidev; Gerçek, Berk; Pandey, Biraj; Peyrache, Adrien; Fiete, Ila (září 2019). „Rozdělovač vnitřního atraktoru a populační dynamika kanonického kognitivního okruhu přes bdění a spánek“. Přírodní neurovědy. 22 (9): 1512–1520. doi:10.1038 / s41593-019-0460-x. ISSN  1546-1726. PMID  31406365.
  19. ^ „2016 Scholars Scholars“. 2016 fakultní učenci. Citováno 2020-04-26.
  20. ^ „Ocenění“. McKnight Foundation. Citováno 2020-04-26.
  21. ^ „Dr. Ila Fiete získává cenu Young Investigator Award od Office of Naval Research - Centrum pro učení a paměť“. Citováno 2020-04-26.
  22. ^ „Ila R. Fiete“. Program Searle Scholars. Citováno 2020-04-26.
  23. ^ „Past Fellows“. sloan.org. Citováno 2020-04-26.