Rodina HrpZ - HrpZ Family

The Pseudomonas syringae Rodina HrpZ Cation Channel (HrpZ) (TC # 1.C.56 ) je členem RTX-toxinová nadrodina. Harpin-PSS (HrpZ; TC # 1.C.56.1.1 ) protein je vylučován Pseudomonas syringae prostřednictvím sekrečního systému Hrp (IIISP; TC # 3.A.6 ) a vyvolává a hypersenzitivní reakce (HR) v nehostitelských rostlinách po infekci a patogenitě u hostitelů.[1] Obsahuje několik opakujících se oblastí a vykazuje dvě prodloužené (20 zbytkových) oblastí se střední hydrofobicitou, které by mohly sloužit jako α-helikální TMS. Předpokládá se, že kationtový kanál HrpZ je převážně α-struktury. HrpZ - harpin - je vysoce termostabilní protein, který vykazuje multifunkční schopnosti, například vyvolává hypersenzitivní reakci (HR), zvyšuje růst rostlin, působí jako faktor virulence a tvoří póry v plazmatických membránách rostlin i v umělých membránách.[2] Homology se nenacházejí v jiných organismech než P. syringae.[3][4]

Funkce

Když je vložen do liposomů a syntetických dvojvrstev při nízkých koncentracích (2 nM), vyvolává kationtově selektivní iontový proud s velkou jednotkovou vodivostí. Chlorid se nepřenáší. Předpokládá se, že takové kanály by mohly umožnit uvolňování živin a / nebo dodávku faktorů virulence během bakteriální kolonizace hostitelských rostlin. Motivy podobné leucinovým zipům se mohou podílet na tvorbě oligomerních agregátů a oligomerizace může souviset s elicitací HR.[3]

Transportní reakce

Zobecněná transportní reakce, o které se předpokládá, že je katalyzována HrpZ, je:[4]

Malé molekuly (dovnitř) → Malé molekuly (ven)

Reference

  1. ^ Haapalainen, Minna; Engelhardt, Stefan; Küfner, Isabell; Li, Chun-Mei; Nürnberger, Thorsten; Lee, Justin; Romantschuk, Martin; Taira, Suvi (01.02.2011). „Funkční mapování harpinu HrpZ z Pseudomonas syringae odhaluje místa odpovědná za oligomerizaci proteinů, lipidové interakce a indukci obrany rostlin“. Molekulární rostlinná patologie. 12 (2): 151–166. doi:10.1111 / j.1364-3703.2010.00655.x. ISSN  1364-3703. PMC  6640321. PMID  21199565.
  2. ^ Choi, Min-Seon; Kim, Wooki; Lee, Chanhui; Ach, Chang-Sik (01.10.2013). „Harpiny, multifunkční proteiny vylučované gramnegativními rostlinnými patogenními bakteriemi“. Molekulární interakce rostlin a mikrobů. 26 (10): 1115–1122. doi:10.1094 / MPMI-02-13-0050-CR. ISSN  0894-0282. PMID  23745678.
  3. ^ A b Lee, J .; Klusener, B .; Tsiamis, G .; Stevens, C .; Neyt, C .; Tampakaki, A. P .; Panopoulos, N.J .; Nöller, J .; Weiler, E. W. (01.01.2001). „HrpZ (Psph) z rostlinného patogenu Pseudomonas syringae pv. Phaseolicola se váže na lipidové dvojvrstvy a vytváří iontově vodivý pór in vitro“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (1): 289–294. doi:10.1073 / pnas.011265298. ISSN  0027-8424. PMC  14583. PMID  11134504.
  4. ^ A b Saier, MH ml. „1.C.56 Rodina Pseudomonas syringae HrpZ Target Host Cell Membrane Cation Channel (HrpZ)“. Databáze klasifikace transportérů. Saier Lab Bioinformatics Group / SDSC.

Další čtení