Holinova nadčeleď IV - Holin superfamily IV - Wikipedia
The Holinova nadčeleď IV je nadčeleď integrální membránové transportní proteiny. Je to jeden ze sedmi různých holinské superrodiny celkem.
Holin superrodina IV zahrnuje rodiny TC:[1]
- 1.E.10 - The Bacillus subtilis Rodina φ29 Holin (φ29 Holin)
- 1.E.16 - Rodina Cph1 Holin (Cph1 Holin)
- 1.E.19 - The Clostridium difficile Rodina TcdE Holin (TcdE Holin)
- 1.E.40 - Rodina Mycobacterial 4 TMS Phage Holin (MP4 Holin)
Superrodina IV zahrnuje čtyři rodiny TC, které zahrnují členy z Firmicutes, Aktinobakterie a Fusobakterie. Jejich průměrné velikosti jsou (v aminoacylových zbytcích (aas)):
TC # 1.E.10 - 138 ± 6 aas
TC # 1.E.16 - 149 ± 15 aas
TC # 1.E.19 - 141 ± 12 aas
TC # 1.E.40 - 173 ± 149 aas
Mezi členy rodiny tedy existuje velmi malá variace velikosti, s výjimkou rodiny 40, která má členy větší než ostatní proteiny v této nadčeledi. Zdá se, že všichni členové rodin 10 a 19 a mnoho členů rodiny 16 mají 3 transmembránové segmenty (TMS), ale u některých členů této poslední rodiny se předpokládá, že budou mít 4 TMS. Extra TMS v těchto proteinech je na jejich N-koncích.[2]
Viz také
Reference
- ^ „Holin Superfamily IV“. Databáze klasifikace transportérů. Citováno 2016-03-20.
- ^ Reddy, Bhaskara L .; Saier Jr., Milton H. (01.11.2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. PMC 3788059. PMID 23856191.
 | Tento membránový protein –Vztahující se článek je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |