Histone 3 'UTR kmenová smyčka - Histone 3′ UTR stem-loop

Histone 3 'UTR kmenová smyčka
RF00032.jpg
Identifikátory
SymbolHistone3
RfamRF00032
Další údaje
RNA typCis-reg
DoményEukaryota
JÍTGO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000205
PDB strukturPDBe

The histonová 3 'UTR kmenová smyčka je RNA element podílí se na nukleocytoplazmatickém transportu histon mRNA a při regulaci stability a účinnosti translace v cytoplazma. The mRNA z metazoan histon geny chybí polyadenylace a a poly-A ocas, místo toho se 3 'konec zpracovává v místě mezi touto vysoce konzervovanou kmenovou smyčkou a a purin bohatý region kolem 20 nukleotidy downstream (histonový downstream prvek nebo HDE). The kmenová smyčka je vázán proteinem vázajícím kmenovou smyčku 31 kDa (SLBP - také nazývaný protein vázající se na histonovou vlásenku nebo HBP). Dohromady s U7 snRNA vazba HDE, SLBP vazebných jader definuje vznik zpracovatelského komplexu.

Reference

  • Williams AS, Marzluff WF (únor 1995). „Sekvence kmene a sousední sekvence na 3 'konci histonové mRNA jsou rozhodujícími faktory pro vazbu proteinu vázajícího kmen-smyčku“. Výzkum nukleových kyselin. 23 (4): 654–662. doi:10.1093 / nar / 23.4.654. PMC  306734. PMID  7899087.
  • Zanier K, Luyten I, Crombie C, Muller B, Schümperli D, Linge JP, Nilges M, Sattler M (leden 2002). "Struktura vlásenky histonové mRNA potřebné pro regulaci buněčného cyklu exprese histonového genu". RNA. 8 (1): 29–46. doi:10.1017 / s1355838202014061. PMC  1370228. PMID  11871659.
  • Zhang M, Lam TT, Tonelli M, Marzluff WF, Thapar R (duben 2012). „Interakce vlásenky histonové mRNA s proteinem vázajícím kmenovou smyčku (SLBP) a regulace komplexu SLBP-RNA fosforylací a izomerací prolinů“. Biochemie. 51 (15): 3215–3231. doi:10.1021 / bi2018255. PMC  3328597. PMID  22439849.

externí odkazy