Hiroki Ueda - Hiroki Ueda

doktor filozofie

Hiroki Ueda
narozený1975
Fukuoka, Japonsko
Alma materTokijská univerzita
Vědecká kariéra
PoleBiologie
InstituceTokijská univerzita
Centrum kvantitativní biologie RIKEN
Kjótská univerzita
Osaka University
Tohoku University

Hiroki R. Ueda (上 田 泰 己, Ueda Hiroki) je japonský profesor biologie na Tokijská univerzita a Centrum kvantitativní biologie RIKEN. On je známý pro jeho studia na cirkadiánní hodiny.

Kariéra

Hiroki R. Ueda se narodil v roce Fukuoka, Japonsko, v roce 1975. Vystudoval lékařskou fakultu Tokijská univerzita v roce 2000 a doktorát získal v roce 2004 na stejné univerzitě.[1] Byl jmenován vedoucím týmu v Centrum RIKEN pro Vývojová biologie (CDB) od roku 2003 a v roce 2009 byl povýšen na vedoucího projektu v RIKEN CDB,[2] a v roce 2011 se stane ředitelem skupiny v RIKEN Kvantitativní biologické centrum (QBiC). V roce 2013 se stal profesorem na Graduate School of Medicine na Tokijské univerzitě.[3] V současné době je jmenován vedoucím týmu v RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research (BDR), přidruženým profesorem na Graduate School of Information Science and Technology a vrchní vyšetřovatel v IRCN (International Research Center for Neurointelligence) na Tokijské univerzitě, pozvaný profesor v Osaka University a hostujícím profesorem v Tokushima univerzity.

Výzkum

Má odborné znalosti v systémové biologii a zaměřuje se na chronobiologii vyšetřováním cirkadiánních hodin savců a cyklů spánku / bdění. Stanovil základní strukturu transkripčního obvodu savčích cirkadiánních hodin a identifikoval několik motivů se zpožděnou negativní zpětnou vazbou.[4][5][6][7] Zaměřil se také na dlouhodobé a nevyřešené otázky v chronobiologii a zjistil, že chování singularity (tj. Časové zastavení cirkadiánních hodin) je způsobeno desynchronizací více buněčných cirkadiánních oscilátorů,[8] a že teplotně necitlivé biochemické reakce jsou základem teplotní kompenzace savčích cirkadiánních hodin.[9][10] Vynalezl také metody molekulárního rozvrhu pro detekci cirkadiánního času těla měřením momentových informací cirkadiánních hodin.[11][12][13][14] U cyklů spánku / bdění zjistil, že základem spánkové homeostázy jsou dráhy hyperpolarizace závislé na Ca2 + a CaMKII,[15][16][17][18][19] a že muskarinové receptory, M1 a M3, jako základní geny pro REM spánek.[20] Pro urychlení těchto studií také vynalezl metody čištění a zobrazování celého mozku a celého těla zvané CUBIC,[21][22][23][24][25][26][27][28][29] stejně jako genetika savců nové generace[30] jako je Triple-CRISPR,[16] ES-myši[31][32] a metody SSS[16] pro jednokrokovou produkci a analýzu KO a KI myší bez křížení.[24][26]

Ocenění

Získal ocenění, včetně Tokyo Techno Forum 21, zlatou medaili (Tokyo Techno Forum 21, 2005), Young Investigator Awards (DALŠÍ, 2006) a IBM Science Award (IBM, 2009), Young Investigator Promotion Awards (Japonská společnost pro chronobiologii, 2007). Získal také cenu Tsukahara (Brain Science Foundation, 2012), Japan Innovator Awards (Nikkei Business Publications Inc. 2004), Cena Teiichi Yamazaki (Foundation for Promotion of Material Science and Technology of Japan, 2015), Innovator of the Year (2017) and The Ichimura Prize for Science for Excellent Achievement (Ichimura Foundation for New Technology, 2018).

Reference

  1. ^ "Hiroki Ueda". Neuroinformatika. Citováno 2017-10-28.
  2. ^ "Hiroki Ueda". Uzel. Společnost biologů. Citováno 2017-10-28.
  3. ^ „Série seminářů CSCB:„ Směrem k systémům na úrovni organismů a syntetické biologii. “Dr. Hiroki Ueda“. Citováno 2017-10-28.
  4. ^ Ueda; et al. (01.08.2002). "Prvek odezvy na transkripční faktor pro genovou expresi během cirkadiánní noci". Příroda. 418 (6897): 534–539. doi:10.1038 / nature00906. ISSN  0028-0836. PMID  12152080. S2CID  4406987.
  5. ^ Ueda; et al. (Únor 2005). "Identifikace transkripčních obvodů na úrovni systému, které jsou základem pro cirkadiánní hodiny savců". Genetika přírody. 37 (2): 187–192. doi:10.1038 / ng1504. ISSN  1061-4036. PMID  15665827. S2CID  18112337.
  6. ^ Ukai-Tadenuma; et al. (Říjen 2008). "Důkaz syntézy transkripční logiky savčích cirkadiánních hodin". Přírodní buněčná biologie. 10 (10): 1154–1163. doi:10.1038 / ncb1775. ISSN  1476-4679. PMID  18806789. S2CID  9528397.
  7. ^ Ukai-Tadenuma; et al. (2011-01-21). „Pro funkci cirkadiánních hodin je vyžadováno zpoždění při potlačování zpětné vazby kryptochromem 1“ (PDF). Buňka. 144 (2): 268–281. doi:10.1016 / j.cell.2010.12.019. ISSN  1097-4172. PMID  21236481. S2CID  8159963.
  8. ^ Ukai; et al. (Listopad 2007). "Melanopsin-dependentní foto-rušení odhaluje desynchronizaci, která je základem singularity cirkadiánních hodin savců". Přírodní buněčná biologie. 9 (11): 1327–1334. doi:10.1038 / ncb1653. ISSN  1465-7392. PMID  17952058. S2CID  12385169.
  9. ^ Isojima; et al. (2009-09-15). „Fosforylace závislá na CKIepsilon / delta je teplotně necitlivý proces určující období v cirkadiánních hodinách savců“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (37): 15744–15749. doi:10.1073 / pnas.0908733106. ISSN  1091-6490. PMC  2736905. PMID  19805222.
  10. ^ Shinohara; et al. (07.09.2017). „Teplotně citlivý substrát a vazba produktu jsou základem teplotně kompenzované fosforylace v hodinách“. Molekulární buňka. 67 (5): 783–798.e20. doi:10.1016 / j.molcel.2017.08.009. ISSN  1097-4164. PMID  28886336.
  11. ^ Ueda; et al. (03.08.2004). „Metody molekulárního rozvrhu pro detekci poruch tělesného času a rytmu z profilů exprese v celém genomu v jednom časovém bodě“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (31): 11227–11232. doi:10.1073 / pnas.0401882101. ISSN  0027-8424. PMC  509173. PMID  15273285.
  12. ^ Minami; et al. (2009-06-16). „Měření času v těle metodou krevní metabolomiky“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (24): 9890–9895. doi:10.1073 / pnas.0900617106. ISSN  1091-6490. PMC  2689311. PMID  19487679.
  13. ^ Kasukawa; et al. (2012-09-11). „Časový rozvrh metabolitů lidské krve označuje čas v těle“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 109 (37): 15036–15041. doi:10.1073 / pnas.1207768109. ISSN  1091-6490. PMC  3443163. PMID  22927403.
  14. ^ Narumi; et al. (2016-06-14). „Absolutní kvantifikace založená na hmotnostní spektrometrii odhaluje rytmické variace proteinů myších cirkadiánních hodin“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 113 (24): E3461–3467. doi:10.1073 / pnas.1603799113. ISSN  1091-6490. PMC  4914154. PMID  27247408.
  15. ^ Tatsuki; et al. (2016-04-06). „Zapojení Ca (2 +) - závislá hyperpolarizace v době spánku u savců“. Neuron. 90 (1): 70–85. doi:10.1016 / j.neuron.2016.02.032. ISSN  1097-4199. PMID  26996081.
  16. ^ A b C Sunagawa; et al. (2016-01-26). „Savčí reverzní genetika bez křížení odhaluje Nr3a jako gen s krátkým spánkem“. Zprávy buněk. 14 (3): 662–677. doi:10.1016 / j.celrep.2015.12.052. ISSN  2211-1247. PMID  26774482.
  17. ^ Tatsuki; et al. (Květen 2017). "Hypotéza hyperpolarizace závislá na Ca2 + pro spánek savců". Neurovědecký výzkum. 118: 48–55. doi:10.1016 / j.neures.2017.03.012. ISSN  1872-8111. PMID  28433628. S2CID  4242696.
  18. ^ Óda; et al. (Červen 2017). „Rychlé a pomalé mechanismy hyperpolarizace závislé na Ca2 + spojují membránový potenciál a homeostázu spánku“. Aktuální názor v neurobiologii. 44: 212–221. doi:10.1016 / j.conb.2017.05.007. ISSN  1873-6882. PMID  28575719. S2CID  2089309.
  19. ^ Shi; et al. (Leden 2018). „Hyperpolarizační cesty závislé na Ca2 + v homeostáze spánku a duševních poruchách“. BioEssays. 40 (1): 1700105. doi:10.1002 / bies.201700105. ISSN  1521-1878. PMID  29205420.
  20. ^ Niwa; et al. (2018-08-28). „Muskarinové acetylcholinové receptory Chrm1 a Chrm3 jsou nezbytné pro REM spánek“. Zprávy buněk. 24 (9): 2231–2 247.e7. doi:10.1016 / j.celrep.2018.07.082. ISSN  2211-1247. PMID  30157420.
  21. ^ Susaki; et al. (2014-04-24). „Zobrazování celého mozku s rozlišením jedné buňky pomocí chemických koktejlů a výpočetní analýzy“. Buňka. 157 (3): 726–739. doi:10.1016 / j.cell.2014.03.042. ISSN  1097-4172. PMID  24746791.
  22. ^ Tainaka; et al. (06.11.2014). „Zobrazování celého těla s rozlišením jedné buňky odbarvováním tkání“. Buňka. 159 (4): 911–924. doi:10.1016 / j.cell.2014.10.034. ISSN  1097-4172. PMID  25417165.
  23. ^ Susaki; et al. (Listopad 2015). „Pokročilé protokoly CUBIC pro čištění a zobrazování celého mozku a celého těla“ (PDF). Přírodní protokoly. 10 (11): 1709–1727. doi:10.1038 / nprot.2015.085. ISSN  1750-2799. PMID  26448360. S2CID  205466332.
  24. ^ A b Susaki; et al. (2016-01-21). „Techniky čištění a zobrazování celého těla a celého orgánu s rozlišením jedné buňky: Směrem k biologii systémů na úrovni organismu u savců“. Cell Chemical Biology. 23 (1): 137–157. doi:10.1016 / j.chembiol.2015.11.009. ISSN  2451-9448. PMID  26933741.
  25. ^ Tainaka; et al. (06.10.2016). „Chemické principy protokolů čištění a barvení tkání pro profilování buněk celého těla“. Roční přehled buněčné a vývojové biologie. 32: 713–741. doi:10.1146 / annurev-cellbio-111315-125001. ISSN  1530-8995. PMID  27298088. S2CID  16012176.
  26. ^ A b Kubota; et al. (2017-07-05). „Profilování metastáz rakoviny celého těla s rozlišením jedné buňky“. Zprávy buněk. 20 (1): 236–250. doi:10.1016 / j.celrep.2017.06.010. ISSN  2211-1247. PMID  28683317.
  27. ^ Nojima; et al. (2017-08-24). "CUBIC patologie: trojrozměrné zobrazování pro patologickou diagnózu". Vědecké zprávy. 7 (1): 9269. doi:10.1038 / s41598-017-09117-0. ISSN  2045-2322. PMC  5571108. PMID  28839164.
  28. ^ Murakami; et al. (Duben 2018). „Trojrozměrný atlas celého mozku s rozlišením jedné buňky s využitím expanzní mikroskopie CUBIC-X a čištění tkáně“. Přírodní neurovědy. 21 (4): 625–637. doi:10.1038 / s41593-018-0109-1. ISSN  1546-1726. PMID  29507408. S2CID  4381325.
  29. ^ Tainaka; et al. (2018-08-21). „Chemická krajina pro čištění tkání na základě hydrofilních reagencií“. Zprávy buněk. 24 (8): 2196–2210.e9. doi:10.1016 / j.celrep.2018.07.056. ISSN  2211-1247. PMID  30134179.
  30. ^ Susaki; et al. (2017). „Genetika savců nové generace směrem k biologii systémů na úrovni organismu“. Biologie a aplikace systémů NPJ. 3: 15. doi:10.1038 / s41540-017-0015-2. ISSN  2056-7189. PMC  5459797. PMID  28649442.
  31. ^ Óda; et al. (2017-01-05). „Knockout-Rescue Embryonální kmenová buňka odvozená myš odhaluje kontrolu cirkadiánního období podle kvality a množství CRY1“. Molekulární buňka. 65 (1): 176–190. doi:10.1016 / j.molcel.2016.11.022. ISSN  1097-4164. PMID  28017587.
  32. ^ Ukai; et al. (Prosinec 2017). "Produkce knock-in myší v jedné generaci z embryonálních kmenových buněk". Přírodní protokoly. 12 (12): 2513–2530. doi:10.1038 / nprot.2017.110. ISSN  1750-2799. PMID  29189772.

externí odkazy