Hiroki Ueda - Hiroki Ueda
Hiroki Ueda | |
---|---|
narozený | 1975 |
Alma mater | Tokijská univerzita |
Vědecká kariéra | |
Pole | Biologie |
Instituce | Tokijská univerzita Centrum kvantitativní biologie RIKEN Kjótská univerzita Osaka University Tohoku University |
Hiroki R. Ueda (上 田 泰 己, Ueda Hiroki) je japonský profesor biologie na Tokijská univerzita a Centrum kvantitativní biologie RIKEN. On je známý pro jeho studia na cirkadiánní hodiny.
Kariéra
Hiroki R. Ueda se narodil v roce Fukuoka, Japonsko, v roce 1975. Vystudoval lékařskou fakultu Tokijská univerzita v roce 2000 a doktorát získal v roce 2004 na stejné univerzitě.[1] Byl jmenován vedoucím týmu v Centrum RIKEN pro Vývojová biologie (CDB) od roku 2003 a v roce 2009 byl povýšen na vedoucího projektu v RIKEN CDB,[2] a v roce 2011 se stane ředitelem skupiny v RIKEN Kvantitativní biologické centrum (QBiC). V roce 2013 se stal profesorem na Graduate School of Medicine na Tokijské univerzitě.[3] V současné době je jmenován vedoucím týmu v RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research (BDR), přidruženým profesorem na Graduate School of Information Science and Technology a vrchní vyšetřovatel v IRCN (International Research Center for Neurointelligence) na Tokijské univerzitě, pozvaný profesor v Osaka University a hostujícím profesorem v Tokushima univerzity.
Výzkum
Má odborné znalosti v systémové biologii a zaměřuje se na chronobiologii vyšetřováním cirkadiánních hodin savců a cyklů spánku / bdění. Stanovil základní strukturu transkripčního obvodu savčích cirkadiánních hodin a identifikoval několik motivů se zpožděnou negativní zpětnou vazbou.[4][5][6][7] Zaměřil se také na dlouhodobé a nevyřešené otázky v chronobiologii a zjistil, že chování singularity (tj. Časové zastavení cirkadiánních hodin) je způsobeno desynchronizací více buněčných cirkadiánních oscilátorů,[8] a že teplotně necitlivé biochemické reakce jsou základem teplotní kompenzace savčích cirkadiánních hodin.[9][10] Vynalezl také metody molekulárního rozvrhu pro detekci cirkadiánního času těla měřením momentových informací cirkadiánních hodin.[11][12][13][14] U cyklů spánku / bdění zjistil, že základem spánkové homeostázy jsou dráhy hyperpolarizace závislé na Ca2 + a CaMKII,[15][16][17][18][19] a že muskarinové receptory, M1 a M3, jako základní geny pro REM spánek.[20] Pro urychlení těchto studií také vynalezl metody čištění a zobrazování celého mozku a celého těla zvané CUBIC,[21][22][23][24][25][26][27][28][29] stejně jako genetika savců nové generace[30] jako je Triple-CRISPR,[16] ES-myši[31][32] a metody SSS[16] pro jednokrokovou produkci a analýzu KO a KI myší bez křížení.[24][26]
Ocenění
Získal ocenění, včetně Tokyo Techno Forum 21, zlatou medaili (Tokyo Techno Forum 21, 2005), Young Investigator Awards (DALŠÍ, 2006) a IBM Science Award (IBM, 2009), Young Investigator Promotion Awards (Japonská společnost pro chronobiologii, 2007). Získal také cenu Tsukahara (Brain Science Foundation, 2012), Japan Innovator Awards (Nikkei Business Publications Inc. 2004), Cena Teiichi Yamazaki (Foundation for Promotion of Material Science and Technology of Japan, 2015), Innovator of the Year (2017) and The Ichimura Prize for Science for Excellent Achievement (Ichimura Foundation for New Technology, 2018).
Reference
- ^ "Hiroki Ueda". Neuroinformatika. Citováno 2017-10-28.
- ^ "Hiroki Ueda". Uzel. Společnost biologů. Citováno 2017-10-28.
- ^ „Série seminářů CSCB:„ Směrem k systémům na úrovni organismů a syntetické biologii. “Dr. Hiroki Ueda“. Citováno 2017-10-28.
- ^ Ueda; et al. (01.08.2002). "Prvek odezvy na transkripční faktor pro genovou expresi během cirkadiánní noci". Příroda. 418 (6897): 534–539. doi:10.1038 / nature00906. ISSN 0028-0836. PMID 12152080. S2CID 4406987.
- ^ Ueda; et al. (Únor 2005). "Identifikace transkripčních obvodů na úrovni systému, které jsou základem pro cirkadiánní hodiny savců". Genetika přírody. 37 (2): 187–192. doi:10.1038 / ng1504. ISSN 1061-4036. PMID 15665827. S2CID 18112337.
- ^ Ukai-Tadenuma; et al. (Říjen 2008). "Důkaz syntézy transkripční logiky savčích cirkadiánních hodin". Přírodní buněčná biologie. 10 (10): 1154–1163. doi:10.1038 / ncb1775. ISSN 1476-4679. PMID 18806789. S2CID 9528397.
- ^ Ukai-Tadenuma; et al. (2011-01-21). „Pro funkci cirkadiánních hodin je vyžadováno zpoždění při potlačování zpětné vazby kryptochromem 1“ (PDF). Buňka. 144 (2): 268–281. doi:10.1016 / j.cell.2010.12.019. ISSN 1097-4172. PMID 21236481. S2CID 8159963.
- ^ Ukai; et al. (Listopad 2007). "Melanopsin-dependentní foto-rušení odhaluje desynchronizaci, která je základem singularity cirkadiánních hodin savců". Přírodní buněčná biologie. 9 (11): 1327–1334. doi:10.1038 / ncb1653. ISSN 1465-7392. PMID 17952058. S2CID 12385169.
- ^ Isojima; et al. (2009-09-15). „Fosforylace závislá na CKIepsilon / delta je teplotně necitlivý proces určující období v cirkadiánních hodinách savců“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (37): 15744–15749. doi:10.1073 / pnas.0908733106. ISSN 1091-6490. PMC 2736905. PMID 19805222.
- ^ Shinohara; et al. (07.09.2017). „Teplotně citlivý substrát a vazba produktu jsou základem teplotně kompenzované fosforylace v hodinách“. Molekulární buňka. 67 (5): 783–798.e20. doi:10.1016 / j.molcel.2017.08.009. ISSN 1097-4164. PMID 28886336.
- ^ Ueda; et al. (03.08.2004). „Metody molekulárního rozvrhu pro detekci poruch tělesného času a rytmu z profilů exprese v celém genomu v jednom časovém bodě“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (31): 11227–11232. doi:10.1073 / pnas.0401882101. ISSN 0027-8424. PMC 509173. PMID 15273285.
- ^ Minami; et al. (2009-06-16). „Měření času v těle metodou krevní metabolomiky“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (24): 9890–9895. doi:10.1073 / pnas.0900617106. ISSN 1091-6490. PMC 2689311. PMID 19487679.
- ^ Kasukawa; et al. (2012-09-11). „Časový rozvrh metabolitů lidské krve označuje čas v těle“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 109 (37): 15036–15041. doi:10.1073 / pnas.1207768109. ISSN 1091-6490. PMC 3443163. PMID 22927403.
- ^ Narumi; et al. (2016-06-14). „Absolutní kvantifikace založená na hmotnostní spektrometrii odhaluje rytmické variace proteinů myších cirkadiánních hodin“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 113 (24): E3461–3467. doi:10.1073 / pnas.1603799113. ISSN 1091-6490. PMC 4914154. PMID 27247408.
- ^ Tatsuki; et al. (2016-04-06). „Zapojení Ca (2 +) - závislá hyperpolarizace v době spánku u savců“. Neuron. 90 (1): 70–85. doi:10.1016 / j.neuron.2016.02.032. ISSN 1097-4199. PMID 26996081.
- ^ A b C Sunagawa; et al. (2016-01-26). „Savčí reverzní genetika bez křížení odhaluje Nr3a jako gen s krátkým spánkem“. Zprávy buněk. 14 (3): 662–677. doi:10.1016 / j.celrep.2015.12.052. ISSN 2211-1247. PMID 26774482.
- ^ Tatsuki; et al. (Květen 2017). "Hypotéza hyperpolarizace závislá na Ca2 + pro spánek savců". Neurovědecký výzkum. 118: 48–55. doi:10.1016 / j.neures.2017.03.012. ISSN 1872-8111. PMID 28433628. S2CID 4242696.
- ^ Óda; et al. (Červen 2017). „Rychlé a pomalé mechanismy hyperpolarizace závislé na Ca2 + spojují membránový potenciál a homeostázu spánku“. Aktuální názor v neurobiologii. 44: 212–221. doi:10.1016 / j.conb.2017.05.007. ISSN 1873-6882. PMID 28575719. S2CID 2089309.
- ^ Shi; et al. (Leden 2018). „Hyperpolarizační cesty závislé na Ca2 + v homeostáze spánku a duševních poruchách“. BioEssays. 40 (1): 1700105. doi:10.1002 / bies.201700105. ISSN 1521-1878. PMID 29205420.
- ^ Niwa; et al. (2018-08-28). „Muskarinové acetylcholinové receptory Chrm1 a Chrm3 jsou nezbytné pro REM spánek“. Zprávy buněk. 24 (9): 2231–2 247.e7. doi:10.1016 / j.celrep.2018.07.082. ISSN 2211-1247. PMID 30157420.
- ^ Susaki; et al. (2014-04-24). „Zobrazování celého mozku s rozlišením jedné buňky pomocí chemických koktejlů a výpočetní analýzy“. Buňka. 157 (3): 726–739. doi:10.1016 / j.cell.2014.03.042. ISSN 1097-4172. PMID 24746791.
- ^ Tainaka; et al. (06.11.2014). „Zobrazování celého těla s rozlišením jedné buňky odbarvováním tkání“. Buňka. 159 (4): 911–924. doi:10.1016 / j.cell.2014.10.034. ISSN 1097-4172. PMID 25417165.
- ^ Susaki; et al. (Listopad 2015). „Pokročilé protokoly CUBIC pro čištění a zobrazování celého mozku a celého těla“ (PDF). Přírodní protokoly. 10 (11): 1709–1727. doi:10.1038 / nprot.2015.085. ISSN 1750-2799. PMID 26448360. S2CID 205466332.
- ^ A b Susaki; et al. (2016-01-21). „Techniky čištění a zobrazování celého těla a celého orgánu s rozlišením jedné buňky: Směrem k biologii systémů na úrovni organismu u savců“. Cell Chemical Biology. 23 (1): 137–157. doi:10.1016 / j.chembiol.2015.11.009. ISSN 2451-9448. PMID 26933741.
- ^ Tainaka; et al. (06.10.2016). „Chemické principy protokolů čištění a barvení tkání pro profilování buněk celého těla“. Roční přehled buněčné a vývojové biologie. 32: 713–741. doi:10.1146 / annurev-cellbio-111315-125001. ISSN 1530-8995. PMID 27298088. S2CID 16012176.
- ^ A b Kubota; et al. (2017-07-05). „Profilování metastáz rakoviny celého těla s rozlišením jedné buňky“. Zprávy buněk. 20 (1): 236–250. doi:10.1016 / j.celrep.2017.06.010. ISSN 2211-1247. PMID 28683317.
- ^ Nojima; et al. (2017-08-24). "CUBIC patologie: trojrozměrné zobrazování pro patologickou diagnózu". Vědecké zprávy. 7 (1): 9269. doi:10.1038 / s41598-017-09117-0. ISSN 2045-2322. PMC 5571108. PMID 28839164.
- ^ Murakami; et al. (Duben 2018). „Trojrozměrný atlas celého mozku s rozlišením jedné buňky s využitím expanzní mikroskopie CUBIC-X a čištění tkáně“. Přírodní neurovědy. 21 (4): 625–637. doi:10.1038 / s41593-018-0109-1. ISSN 1546-1726. PMID 29507408. S2CID 4381325.
- ^ Tainaka; et al. (2018-08-21). „Chemická krajina pro čištění tkání na základě hydrofilních reagencií“. Zprávy buněk. 24 (8): 2196–2210.e9. doi:10.1016 / j.celrep.2018.07.056. ISSN 2211-1247. PMID 30134179.
- ^ Susaki; et al. (2017). „Genetika savců nové generace směrem k biologii systémů na úrovni organismu“. Biologie a aplikace systémů NPJ. 3: 15. doi:10.1038 / s41540-017-0015-2. ISSN 2056-7189. PMC 5459797. PMID 28649442.
- ^ Óda; et al. (2017-01-05). „Knockout-Rescue Embryonální kmenová buňka odvozená myš odhaluje kontrolu cirkadiánního období podle kvality a množství CRY1“. Molekulární buňka. 65 (1): 176–190. doi:10.1016 / j.molcel.2016.11.022. ISSN 1097-4164. PMID 28017587.
- ^ Ukai; et al. (Prosinec 2017). "Produkce knock-in myší v jedné generaci z embryonálních kmenových buněk". Přírodní protokoly. 12 (12): 2513–2530. doi:10.1038 / nprot.2017.110. ISSN 1750-2799. PMID 29189772.
externí odkazy
- Hiroki Ueda publikace indexované podle Google Scholar