Virus hepatitidy B PRE 1151–1410 - Hepatitis B virus PRE 1151–1410
| Virus hepatitidy B PRE 1151–1410 | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence viru hepatitidy B PRE 1151–1410 | |
| Identifikátory | |
| Rfam | RF02816 |
| Další údaje | |
| Domény | Viry |
| JÍT | GO termín musí začínat GO:,GO termín musí začínat GO: |
| TAK | SO: 0005836 |
| PDB struktur | PDBe |
Virus hepatitidy B PRE 1151–1410 (HBV post-transkripční regulační prvek, nukleotidy 1151–1410) je součástí HBV PRE o délce 500 párů bází, která byla navržena jako žloutenka typu B virus (HBV) RNA exportní prvek.[1][2][3] Tato funkce je však kontroverzní a v rámci PRE byly předpovězeny nové regulační prvky.[4] PRE 1151–1410 zvyšuje jaderný export intronless transkriptů a potlačuje sestřihový mechanismus ve srovnatelné míře jako u full-length PRE. Proto bylo navrženo, aby se jednalo o základní prvek HBV PRE.[4] PRE1151–1410 obsahuje 3 známé regulační prvky: PRE SL-alfa (nukleotidy 1292–1321),[5] vazebné místo pro lidský La protein (nukleotid 1275–1291),[6] SRE-1 (nukleotidy 1252–1348).[7]
Viz také
Reference
- ^ Panjaworayan N, Roessner SK, Firth AE, Brown CM (prosinec 2007). „HBVRegDB: anotace, srovnání, detekce a vizualizace regulačních prvků v sekvencích viru hepatitidy B“. Virology Journal. 4: 136. doi:10.1186 / 1743-422X-4-136. PMC 2235840. PMID 18086305.
- ^ Huang J, Liang TJ (prosinec 1993). „Nový genetický prvek viru hepatitidy B (HBV) s vlastnostmi podobnými prvku Rev response, který je nezbytný pro expresi genových produktů HBV“. Molekulární a buněčná biologie. 13 (12): 7476–7486. doi:10,1128 / mcb.13.12.7476. PMC 364819. PMID 8246965.
- ^ Huang ZM, Yen TS (květen 1994). „Prvek RNA viru hepatitidy B, který usnadňuje akumulaci transkriptů povrchových genů v cytoplazmě“. Journal of Virology. 68 (5): 3193–3199. doi:10.1128 / JVI.68.5.3193-3199.1994. PMC 236810. PMID 8151782.
- ^ A b Visootsat A, Payungporn S, T-Thienprasert NP (prosinec 2015). „Konzervovaný strukturní prvek RNA v posttranskripčním regulačním prvku viru hepatitidy B zvyšuje jaderný export intronless transkriptů a potlačuje sestřihový mechanismus“. Zprávy o molekulární biologii. 42 (12): 1603–1614. doi:10.1007 / s11033-015-3928-0. PMID 26514143.
- ^ Panjaworayan N, Payungporn S, Poovorawan Y, Brown CM (září 2010). „Identifikace účinného cílového místa siRNA a funkčních regulačních prvků v posttranskripčním regulačním prvku viru hepatitidy B“. Virology Journal. 7: 216. doi:10.1186 / 1743-422X-7-216. PMC 2945954. PMID 20822550.
- ^ Ehlers I, Horke S, Reumann K, Rang A, Grosse F, Will H, Heise T (říjen 2004). „Funkční charakterizace interakce mezi lidskou RNA La a virem hepatitidy B“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (42): 43437–43447. doi:10,1074 / jbc.M402227200. PMID 15302879.
- ^ Heise T, Sommer G, Reumann K, Meyer I, Will H, Schaal H (2006). „Virus hepatitidy B PRE obsahuje sestřihový regulační prvek“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (1): 353–363. doi:10.1093 / nar / gkj440. PMC 1331995. PMID 16410615.
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |