Hepacivirus A - Hepacivirus A

Hepacivirus A
Klasifikace virů
(bez hodnocení):	Virus
Oblast:	Riboviria
Království:	Orthornavirae
Kmen:	Kitrinoviricota
Třída:	Flasuviricetes
Objednat:	Amarillovirales
Rodina:	Flaviviridae
Rod:	Hepacivirus
Druh:	Hepacivirus A
Synonyma
	Psí hepacivirus; Hepacivirus bez primátů;

Hepacivirus Anebo Psí hepacivirus, je jednořetězcový RNA virus pozitivního smyslu rodu Hepacivirus.^[2] Způsobuje plicní infekce u psů.

Dějiny

Virus byl izolován v roce 2011 z počtu psů trpících respiračními infekcemi.

Genom

Od roku 2012 dosud nebyl genom plně sekvenován. Dostupná sekvence je asi 6500 nukleotidy v délce. Předpokládá se, že má polyprotein které lze štěpit na 10 menších proteinů. Tady je 'kluzká sekvence „- A.₅NNA₅ - v genomu, který může kódovat naprogramovaný shifthift. Kóduje dva obalové proteiny (E1 a E2) a také cystein a serin proteázy.

Celkově G + C obsah je 50,7%.

Vývoj

Zdá se, že se virus vyvinul z Virus hepatitidy C. před 500 až 1 000 lety.

Reference

^ Smith, Donald B .; et al. (23. června 2016). "Vytvořte 13 nových druhů rodu Hepacivirus a přejmenujte 1 druh (rodinu Flaviviridae)" (PDF). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). p. 3. Citováno 13. března 2019. Všechny ostatní druhy jsou pojmenovány podle data zveřejnění úplné kódující sekvence, s výjimkou Hepacivirus B který zahrnuje GBV-B (poskytuje nezapomenutelný odkaz) a Hepacivirus A (psí hepacivirus / ne-primátový hepacivirus).
^ Kapoor A, Simmonds P, Gerold G, Qaisar N, Jain K, Henriquez JA, Firth C, Hirschberg DL, Rice CM, Shields S, Lipkin WI (2011). "Charakterizace psího homologu viru hepatitidy C". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 108 (28): 11608–13. Bibcode:2011PNAS..10811608K. doi:10.1073 / pnas.1101794108. PMC 3136326. PMID 21610165.

[2016.010a,bS-1] Smith, Donald B .; et al. (23. června 2016). "Vytvořte 13 nových druhů rodu Hepacivirus a přejmenujte 1 druh (rodinu Flaviviridae)" (PDF). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). p. 3. Citováno 13. března 2019. Všechny ostatní druhy jsou pojmenovány podle data zveřejnění úplné kódující sekvence, s výjimkou Hepacivirus B který zahrnuje GBV-B (poskytuje nezapomenutelný odkaz) a Hepacivirus A (psí hepacivirus / ne-primátový hepacivirus).

[Kapoor2011-2] Kapoor A, Simmonds P, Gerold G, Qaisar N, Jain K, Henriquez JA, Firth C, Hirschberg DL, Rice CM, Shields S, Lipkin WI (2011). "Charakterizace psího homologu viru hepatitidy C". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 108 (28): 11608–13. Bibcode:2011PNAS..10811608K. doi:10.1073 / pnas.1101794108. PMC 3136326. PMID 21610165.

[1]

[2]