Haseman-Elstonova regrese - Haseman–Elston regression

v statistická genetika, Regrese Haseman – Elston (HE) je forma statistická regrese původně navrženo pro analýza vazby z kvantitativní znaky pro sib páry. Poprvé ji vyvinuli Joseph K. Haseman a Robert C. Elston v roce 1972.[1]. Mnohem dřívějším zdrojem implementace propojení sib-pair bylo v letech 1935 a 1938[2][3] navrhl Lionel S.Penrose, který je otcem laureáta Nobelovy ceny za teoretického fyzika Roger Penrose. V roce 2000 Elston a kol. navrhl „znovu navštívenou“ rozšířenou formu regrese Haseman – Elston.[4] Od té doby byla navržena další rozšíření „revidované“ formy HE regrese.[5][6][7] Ačkoli HE regrese "... se zdá být rezavou zbraní v genomika analýza zbrojnice GWAS éra. Je to proto, že HE regrese závisí na příbuznosti měřené na IBD ale ne identita podle státu (IBS) ... “, HE byl upraven pro asociační analýzu u nesouvisejících vzorků, jejichž příbuznost je měřena v IBS.[8]

Reference

  1. ^ Haseman, J. K .; Elston, R. C. (březen 1972). "Vyšetřování vazby mezi kvantitativním znakem a markerovým lokusem". Genetika chování. 2 (1): 3–19. doi:10.1007 / BF01066731. ISSN  0001-8244. PMID  4157472.
  2. ^ Penrose, L.S. (1935). "Detekce autosomální vazby v datech, která se skládají z dvojic bratrů a sester neurčeného původu". Annals of Eugenics. 6 (2): 133-8. doi:10.1111 / j.1469-1809.1935.tb02224.x. ISSN  1469-1809.
  3. ^ Penrose, L.S. (1938). "Genetická vazba v odstupňovaných lidských postavách". Annals of Eugenics. 8 (3): 233-7. doi:10.1111 / j.1469-1809.1938.tb02176.x. ISSN  1469-1809.
  4. ^ Elston, Robert C .; Buxbaum, Sarah; Jacobs, Kevin B .; Olson, Jane M. (2000). „Haseman a Elston se vrátili“. Genetická epidemiologie (francouzsky). 19 (1): 1–17. doi:10.1002 / 1098-2272 (200007) 19: 1 <1 :: AID-GEPI1> 3.0.CO; 2-E. ISSN  1098-2272. PMID  10861893.
  5. ^ Mirea, Lucia; Bull, Shelley B; Stafford, James (2003). „Porovnání regresních analýz Haseman – Elston pomocí jednorázových, souhrnných a podélných měření systolického krevního tlaku“. Genetika BMC. 4 (Suppl 1): S23. doi:10.1186 / 1471-2156-4-S1-S23. PMC  1866458. PMID  14975091.
  6. ^ Sham, P.C .; Purcell, S. (červen 2001). „Ekvivalence mezi analýzou propojení Haseman-Elston a Variance-Components pro páry Sib“. American Journal of Human Genetics. 68 (6): 1527–1532. doi:10.1086/320593. PMC  1226141. PMID  11353401.
  7. ^ Wang, Tao; Elston, Robert C. (červenec 2005). „Dvouúrovňová Haseman-Elstonova regrese pro obecnou analýzu rodokmenových dat“. Genetická epidemiologie. 29 (1): 12–22. doi:10.1002 / gepi.20075. ISSN  0741-0395. PMID  15838848.
  8. ^ Chen, Guo-Bo (2014-04-30). „Odhad dědičnosti komplexních znaků z asociačních studií v celém genomu pomocí Haseman-Elstonovy regrese založené na IBS“. Frontiers in Genetics. 5: 107. doi:10.3389 / fgene.2014.00107. ISSN  1664-8021. PMC  4012219. PMID  24817879.