Haploskupina Q-M25 - Haplogroup Q-M25

Haploskupina Q-M25
Možná doba vzniku	24 300 [95% CI 22 100 <-> 26 700] let před současností (YFull v6.02)
Koalescenční věk	16 400 [95% CI 14 900 <-> 18 000] let před současností (YFull v6.02)
Možné místo původu	Střední Asie
Předek	Q-F1096 (F1215)
Definování mutací	M25

Haploskupina Q-M25, také známý jako Q1a1b je subclade nebo větev člověka Y-DNA haploskupina Q-F1096 (Q1a1), což je naopak subclade of Q-MEH2 (Q1a ). V lidské genetice představuje každá haploskupina Y-DNA biologickou otcovskou linii zpět ke společnému společnému mužskému předkovi.

Rozdělení

Q-M25 má potomky v moderní populaci po celé Eurasii. Pouze jedna podrobná studie o Y-DNA na Turkmenu z Turkmenistán došlo.^[2] Haploskupina Q se nachází v menšinových turkmenských kmenech žijících v Afghánistánu v procentech asi 32%,^[3] a další studie zjistila, že 42,6% íránských Turkmenů má haploskupinu Q-M25 (také známou jako Q1a1b).^[4]

Severní a Jižní Amerika

Q-M25 nebyl detekován v předkolumbovských populacích v Americe.

Asie

Q-M25 byl detekován na severovýchodě od východní Asie, v Jížní Asie a napříč Střední Asie.^[5]^[6]^[7] I když je přítomen na nízkých frekvencích, může být jednou z nejrozšířenějších poboček Q-M242 v Asii.

Populace	Místo vzorkování	Papír	N	Procento	Testováno SNP
Turkmenština	Golestan, Írán	Grugni 2012^[4]	29/68	~42.6%	M25 a M143
Turkmenština	Jawzjan, Afghánistán	Di Cristofaro 2013^[3]	23/74	~31.1%	M25 a M346 / (srov.) Q1a3 (aktuálně Q1a2) = 2/74 (Q celkem = 33,8%)
Smíšený	Střední Asie & Sibiř	Underhill 2000^[6]	6/184	~3.26%	M25 a M143
Kalmyku		Malyarchuk 2011^[5]	1/60	~1.70%	M25
Han	Shanxi	Zhong 2010^[7]	1/56	~1.79%	M25
Ujgur	Sin-ťiang	Zhong 2010^[7]	1/71	~1.41%	M25
Ujgur	Sin-ťiang	Zhong 2010^[7]	1/50	~2.00%	M25
Uzbek	Jawzjan, Afghánistán	Di Cristofaro 2013^[3]	1/94	~1.06%	M25
Mongol	Mongolsko	Di Cristofaro 2013^[3]	1/160	~0.63%	M25

Západní Asie

Frekvence Q-M25 se velmi liší Západní Asie. Extrémní vrchol je vidět v Turkmenština z Golestan.^[4] V celém Íránu se pohybuje od více než 9 procent populace na severu po pouhá 2 až 3 procenta populace na jihu.^[8] Frekvence Q-M25 klesá pouze na asi 1 procento populace Libanon Muslimové a chybí tam nemuslimská populace.^[9] Jeho přítomnost v Marsh Arabové (související s Sumer ) Iráku naznačuje, že západoasijská historie Q-M25 přesahuje jednoho lokalizovaného nedávného zakladatele.^[10]

Populace	Místo vzorkování	Papír	N	Procento	Testováno SNP
Marsh Arabové		Al-Zahery 2011^[10]	1/143	~0.70%	M25 / (srov.) Q1b-M378 = 2,1%
Iráčané		Al-Zahery 2011^[10]	0/154	~0.00%	M25 / (srov.) Q1b-M378 = 1,9%
Íránci	Írán (sever)	Regueiro 2006^[8]	3/33	~9.09%	M25
Íránci	Mazandaran	Di Cristofaro 2013^[3]	1/13	~7.69%	M25
Íránci	Írán (jih)	Regueiro 2006^[8]	3/117	~2.56%	M25
Íránci	Esfahan	Di Cristofaro 2013^[3]	1/42	~2.38%	M25
Ázerbájdžán	Írán (Ázerbájdžán)	Grugni 2012^[4]	1/63	~1.60%	M25
Turkmeny	Golestan	Grugni 2012^[4]	29/68	~42.6%	M25
Libanonci (nemuslimové)	Libanon	Zalloua 2008^[9]	0/482	~0.00%	M25
Libanonci (muslimové)	Libanon	Zalloua 2008^[9]	4/432	~0.93%	M25

Evropa

Q-M25 je přítomen napříč moderními krocan^[11] a v východní Evropa.

Populace		Papír	N	Procento	Testováno SNP
Východní Anatolie		Cinnioglu 2004^[11]	1/82	~1.20%	M25

Přidružené SNP

Haploskupina Q-M25 je definována přítomností M25 Polymorfismus jednoho nukleotidu (SNP) a SNP M143, L714 a L716.

Fylogenetický strom

Toto je Thomas Krahn z konceptu stromu Genomic Research Center Navržený strom pro haploskupinu Q-M25.

Q-M25 M25, M143, L714, L716
- Q-L712 L712
  - Q-L713 L697.2, L713, L715, M365.3

Viz také

Haploskupina lidského Y chromozomu DNA

Y-DNA Q-M242 Subclades

Páteřní strom Y-DNA

Fylogenetický strom člověka Haploskupiny Y-chromozomové DNA ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-chromozomální Adam "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

Já

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

T

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

P ^{[χ 12]}

NE

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Poznámky pod čarou

^ Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). „Vidět dřevo pro stromy: minimální referenční fylogeneze pro lidský chromozom Y“. Lidská mutace. 35 (2): 187–91. doi:10,1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haploskupina Tree 2015. (Datum přístupu: 1. února 2015.)
^ Haploskupina A0-T je také známá jako A-L1085 (a dříve jako A0'1'2'3'4).
^ Haploskupina A1 je také známá jako A1'2'3'4.
^ Haploskupina LT (L298 / P326) je také známá jako Haploskupina K1.
^ V letech 2002 až 2008 Haploskupina T-M184 byla známá jako „Haplogroup K2“. Od té doby bylo toto jméno znovu přiřazeno K-M526, sourozenec Haplogroup LT.
^ Haploskupina K2a (M2308) a její primární subklade K-M2313 byly v roce 2016 odděleny od Haploskupiny NO (F549). (Toto následovalo po vydání: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL a kol. (2016). „Interpunkční výbuchy v lidské mužské demografii byly odvozeny z 1 244 celosvětových sekvencí Y-chromozomu“. Genetika přírody. 48 (6): 593–9. doi:10.1038 / ng.3559. PMC 4884158. PMID 27111036. V minulosti byly s názvem „K2a“ identifikovány také jiné haploskupiny, včetně NO (M214) a K2e.
^ Haploskupina K2b (M1221 / P331 / PF5911) je také známá jako Haplogroup MPS.
^ Haploskupina K2e (K-M147) byla dříve známá jako „Haploskupina X“ a „K2a“ (ale je sourozeneckou subklade současné K2a).
^ K-M2313 *, který dosud nemá fylogenetický název, byl dokumentován u dvou žijících jedinců, kteří mají etnické vazby na Indii a jihovýchodní Asii. Navíc, K-Y28299, který se jeví jako primární větev K-M2313, byl nalezen u tří žijících jedinců z Indie. Viz: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, „K-M2335“, a; PhyloTree, 2017, „Podrobnosti o značkách Y-SNP zahrnutých do minimálního stromu Y“ (Datum přístupu na tyto stránky: 9. prosince 2017)
^ Haploskupina K2b1 (P397 / P399) je také známá jako Haploskupina MS, ale má širší a složitější vnitřní strukturu.
^ Haploskupina P (P295) je také známá jako K2b2.
^ Haploskupina S je od roku 2017 známá také jako K2b1a. (Dříve byl název Haplogroup S přiřazen K2b1a4.)
^ Haploskupina M je od roku 2017 známá také jako K2b1b. (Dříve byl název Haplogroup M přiřazen K2b1d.)

Reference

^ ^A ^b Plný Haplogroup YTree v6.02 dne 2. dubna 2018
^ Wells, R. Spencer (18. srpna 2001). „Euroasijské srdce: kontinentální pohled na diverzitu chromozomů Y“. Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (18): Strana 2, tabulka 1. Bibcode:2001PNAS ... 9810244W. doi:10.1073 / pnas.171305098. PMC 56946. PMID 11526236.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F J D Cristofaro et al., 2013, „Afghan Hindu Kush: Where Euroasian Sub-Continent Gene Flows Converge“, http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0076748
^ ^A ^b ^C ^d ^E Grugni, Viola; Battaglia, Vincenza; Hooshiar Kashani, Baharak; Parolo, Silvia; Al-Zahery, Nadia; Achilli, Alessandro; Olivieri, Anna; Gandini, Francesca; et al. (2012). Kivisild, Toomas (ed.). „Starověké migrační události na Středním východě: nové stopy z variace Y-chromozomu moderních Íránců“. PLOS ONE. 7 (7): e41252. Bibcode:2012PLoSO ... 741252G. doi:10.1371 / journal.pone.0041252. PMC 3399854. PMID 22815981.
^ ^A ^b Malyarchuk, Boris; Derenko, Miroslava; Denisova, Galina; Maksimov, Arkady; Wozniak, Marcin; Grzybowski, Tomasz; Dambueva, Irina; Zakharov, Ilya (2011). "Starověké vazby mezi Sibiři a domorodými Američany odhalené subtypem Y chromozomové haploskupiny Q1a". Journal of Human Genetics. 56 (8): 583–8. doi:10.1038 / jhg.2011.64. PMID 21677663.
^ ^A ^b Underhill, Peter A .; Shen, Peidong; Lin, Alice A .; Jin, Li; Passarino, Giuseppe; Yang, Wei H .; Kauffman, Erin; Bonné-Tamir, Batsheva; et al. (2000). "Variace chromosomové sekvence Y a historie lidských populací". Genetika přírody. 26 (3): 358–61. doi:10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.
^ ^A ^b ^C ^d Zhong, H .; Shi, H .; Qi, X.-B .; Duan, Z.-Y .; Tan, P.-P .; Jin, L .; Su, B .; Ma, R. Z. (2010). „Rozšířené vyšetřování chromozomů Y naznačuje postglaciální migraci moderních lidí do 42,6 východní Asie severní cestou“. Molekulární biologie a evoluce. 28 (1): 717–27. doi:10,1093 / molbev / msq247. PMID 20837606.
^ ^A ^b ^C Regueiro M, Cadenas AM, Gayden T, Underhill PA, Herrera RJ (2006). „Iran: tricontinental nexus for Y-chromozome driven migration“. Hučení. Hered. 61 (3): 132–43. doi:10.1159/000093774. PMID 16770078. S2CID 7017701.
^ ^A ^b ^C Zalloua PA, Xue Y, Khalife J, Makhoul N, Debiane L, Platt DE, Royyuru AK, Herrera RJ a kol. (2008). „Y-chromozomální rozmanitost v Libanonu je strukturována nedávnými historickými událostmi“. American Journal of Human Genetics. 82 (4): 873–882. doi:10.1016 / j.ajhg.2008.01.020. PMC 2427286. PMID 18374297.
^ ^A ^b ^C Al-Zahery, Nadia; Pala, Maria; Battaglia, Vincenza; Grugni, Viola; Hamod, Mohammed A; Kashani, Baharak; Olivieri, Anna; Torroni, Antonio; Santachiara-Benerecetti, Augusta S; Semino, Ornella (2011). „Při hledání genetických stop Sumerů: průzkum variace chromozomu Y a mtDNA u iráckých maršanů“. BMC Evoluční biologie. 11: 288. doi:10.1186/1471-2148-11-288. PMC 3215667. PMID 21970613.
^ ^A ^b Cinnioğlu C, King R, Kivisild T a kol. (Leden 2004). "Vykopávání vrstev haplotypu Y-chromozomu v Anatolii". Hučení. Genet. 114 (2): 127–48. doi:10.1007 / s00439-003-1031-4. PMID 14586639. S2CID 10763736.

externí odkazy

Projekt Y-DNA Haplogroup Q

[vanOven2014-12] Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). „Vidět dřevo pro stromy: minimální referenční fylogeneze pro lidský chromozom Y“. Lidská mutace. 35 (2): 187–91. doi:10,1002 / humu.22468. PMID 24166809.

[ISOGG2015-13] International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haploskupina Tree 2015. (Datum přístupu: 1. února 2015.)

[A0-T-14] Haploskupina A0-T je také známá jako A-L1085 (a dříve jako A0'1'2'3'4).

[A1-15] Haploskupina A1 je také známá jako A1'2'3'4.

[LT-16] Haploskupina LT (L298 / P326) je také známá jako Haploskupina K1.

[K2-17] V letech 2002 až 2008 Haploskupina T-M184 byla známá jako „Haplogroup K2“. Od té doby bylo toto jméno znovu přiřazeno K-M526, sourozenec Haplogroup LT.

[K2a-18] Haploskupina K2a (M2308) a její primární subklade K-M2313 byly v roce 2016 odděleny od Haploskupiny NO (F549). (Toto následovalo po vydání: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL a kol. (2016). „Interpunkční výbuchy v lidské mužské demografii byly odvozeny z 1 244 celosvětových sekvencí Y-chromozomu“. Genetika přírody. 48 (6): 593–9. doi:10.1038 / ng.3559. PMC 4884158. PMID 27111036. V minulosti byly s názvem „K2a“ identifikovány také jiné haploskupiny, včetně NO (M214) a K2e.

[K2b-19] Haploskupina K2b (M1221 / P331 / PF5911) je také známá jako Haplogroup MPS.

[K2e-20] Haploskupina K2e (K-M147) byla dříve známá jako „Haploskupina X“ a „K2a“ (ale je sourozeneckou subklade současné K2a).

[K-M2313-21] K-M2313 *, který dosud nemá fylogenetický název, byl dokumentován u dvou žijících jedinců, kteří mají etnické vazby na Indii a jihovýchodní Asii. Navíc, K-Y28299, který se jeví jako primární větev K-M2313, byl nalezen u tří žijících jedinců z Indie. Viz: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, „K-M2335“, a; PhyloTree, 2017, „Podrobnosti o značkách Y-SNP zahrnutých do minimálního stromu Y“ (Datum přístupu na tyto stránky: 9. prosince 2017)

[K2b1-22] Haploskupina K2b1 (P397 / P399) je také známá jako Haploskupina MS, ale má širší a složitější vnitřní strukturu.

[P-23] Haploskupina P (P295) je také známá jako K2b2.

[S-24] Haploskupina S je od roku 2017 známá také jako K2b1a. (Dříve byl název Haplogroup S přiřazen K2b1a4.)

[M-25] Haploskupina M je od roku 2017 známá také jako K2b1b. (Dříve byl název Haplogroup M přiřazen K2b1d.)

[YFull-1] A ^b Plný Haplogroup YTree v6.02 dne 2. dubna 2018

[Wells2001-2] Wells, R. Spencer (18. srpna 2001). „Euroasijské srdce: kontinentální pohled na diverzitu chromozomů Y“. Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (18): Strana 2, tabulka 1. Bibcode:2001PNAS ... 9810244W. doi:10.1073 / pnas.171305098. PMC 56946. PMID 11526236.

[Cristofaro2013-3] A ^b ^C ^d ^E ^F J D Cristofaro et al., 2013, „Afghan Hindu Kush: Where Euroasian Sub-Continent Gene Flows Converge“, http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0076748

[Grugni2012-4] A ^b ^C ^d ^E Grugni, Viola; Battaglia, Vincenza; Hooshiar Kashani, Baharak; Parolo, Silvia; Al-Zahery, Nadia; Achilli, Alessandro; Olivieri, Anna; Gandini, Francesca; et al. (2012). Kivisild, Toomas (ed.). „Starověké migrační události na Středním východě: nové stopy z variace Y-chromozomu moderních Íránců“. PLOS ONE. 7 (7): e41252. Bibcode:2012PLoSO ... 741252G. doi:10.1371 / journal.pone.0041252. PMC 3399854. PMID 22815981.

[Malyarchuk2011-5] A ^b Malyarchuk, Boris; Derenko, Miroslava; Denisova, Galina; Maksimov, Arkady; Wozniak, Marcin; Grzybowski, Tomasz; Dambueva, Irina; Zakharov, Ilya (2011). "Starověké vazby mezi Sibiři a domorodými Američany odhalené subtypem Y chromozomové haploskupiny Q1a". Journal of Human Genetics. 56 (8): 583–8. doi:10.1038 / jhg.2011.64. PMID 21677663.

[Underhill2000-6] A ^b Underhill, Peter A .; Shen, Peidong; Lin, Alice A .; Jin, Li; Passarino, Giuseppe; Yang, Wei H .; Kauffman, Erin; Bonné-Tamir, Batsheva; et al. (2000). "Variace chromosomové sekvence Y a historie lidských populací". Genetika přírody. 26 (3): 358–61. doi:10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.

[Zhong2010-7] A ^b ^C ^d Zhong, H .; Shi, H .; Qi, X.-B .; Duan, Z.-Y .; Tan, P.-P .; Jin, L .; Su, B .; Ma, R. Z. (2010). „Rozšířené vyšetřování chromozomů Y naznačuje postglaciální migraci moderních lidí do 42,6 východní Asie severní cestou“. Molekulární biologie a evoluce. 28 (1): 717–27. doi:10,1093 / molbev / msq247. PMID 20837606.

[Regueiro2006-8] A ^b ^C Regueiro M, Cadenas AM, Gayden T, Underhill PA, Herrera RJ (2006). „Iran: tricontinental nexus for Y-chromozome driven migration“. Hučení. Hered. 61 (3): 132–43. doi:10.1159/000093774. PMID 16770078. S2CID 7017701.

[Zalloua2008-9] A ^b ^C Zalloua PA, Xue Y, Khalife J, Makhoul N, Debiane L, Platt DE, Royyuru AK, Herrera RJ a kol. (2008). „Y-chromozomální rozmanitost v Libanonu je strukturována nedávnými historickými událostmi“. American Journal of Human Genetics. 82 (4): 873–882. doi:10.1016 / j.ajhg.2008.01.020. PMC 2427286. PMID 18374297.

[Al-Zahary2011-10] A ^b ^C Al-Zahery, Nadia; Pala, Maria; Battaglia, Vincenza; Grugni, Viola; Hamod, Mohammed A; Kashani, Baharak; Olivieri, Anna; Torroni, Antonio; Santachiara-Benerecetti, Augusta S; Semino, Ornella (2011). „Při hledání genetických stop Sumerů: průzkum variace chromozomu Y a mtDNA u iráckých maršanů“. BMC Evoluční biologie. 11: 288. doi:10.1186/1471-2148-11-288. PMC 3215667. PMID 21970613.

[Cinnioglu2004-11] A ^b Cinnioğlu C, King R, Kivisild T a kol. (Leden 2004). "Vykopávání vrstev haplotypu Y-chromozomu v Anatolii". Hučení. Genet. 114 (2): 127–48. doi:10.1007 / s00439-003-1031-4. PMID 14586639. S2CID 10763736.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[χ 1]

[χ 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]

[χ 14]