Haploskupina Q-M120 - Haplogroup Q-M120

Haploskupina Q-M120
Možná doba vzniku15 400 ybp
Možné místo původuAsie
PředekQ1a1a (F746 / NWT01)
Definování mutacíM120 a M265 (AKA N14)

Haploskupina Q-M120, také známý jako Q1a1a1, je Haploskupina Y-DNA. Je to jediná primární větev haploskupiny Q1a1a (F746 / NWT01). Počet řádků je nejběžnější mezi moderními populacemi na severovýchodě Eurasie.

Rozdělení

Q-M120 má potomky v moderní populaci po celé východní Eurasii.

Severní a Jižní Amerika

Jeden ze vzorků 1K Genomes, HG01944, z Peruánců v Limě v Peru patří do Q-M120.[1][2] Q-M120 je další větev pod Q-F746. To je nejlépe známé jako východoasijská větev Q. To je zajímavé; pokud to není výsledkem postkoloniální příměsi, bude to označovat čtvrtou nebo pátou linii Q v Americe. Pobočka Q-M120 včetně tohoto vzorku má vypočítanou TMRCA 5 000 až 7 000 let,[1] což znamená, že to může být výsledek pozdějšího předkolumbovského přistěhovalectví ze severní nebo východní Asie.

Asie

Q-M120 je přítomen ve východní Asii a může vysledovat jeho původ východní Asie.[3][4] Bylo zjištěno s nízkou frekvencí ve vzorcích Han Číňan,[3][4] Dungans,[5] Hmong Daw v Laosu,[6] japonský,[7] Dörwöd Kalmyks,[8] Korejci,[5] Mongolové,[9][10] Tibeťané,[4][11][12] Ujgurové,[13] a vietnamština.[1][2] Bylo také nalezeno mezi Bhútánci,[14] Murut lidé v Brunej,[15] a Ázerbájdžánci.[1] Sengupta et al. (2006) uvedli nález Q-M120 ve vzorku HGDP pákistánské populace Hazaras,[16] ale Bayesiánský strom na doplňkovém obrázku 12 Lippolda et al. (2014) naznačuje, že tito jedinci HGDP pákistánští Hazara by s větší pravděpodobností měli patřit do Q-L275 a že tři členové HGDP Naxi vzorek a jeden člen HGDP Han místo toho by měl vzorek patřit k Q-M120.[17] Di Cristofaro et al. (2013) testovali stejný vzorek pákistánských Hazarasů a uvedli, že patří do následujících haploskupin Y-DNA: 1/25 C-PK2 / M386 (xM407, M532), 9/25 C-M401, 1/25 I-M223 , 1/25 J-M530, 2/25 O-M122 (xM134), 1/25 Q-M242 (xM120, M25, M346, M378), 1/25 Q-M378, 1/25 R-M124, 8 / 25 R-M478 / M73.[10]

PopulacePapírNProcentoTestováno SNP
Dungan (Kyrgyzstán)Wells 2001[5]3/40~7.5%M120
Han (Henan)Ne 2000[4]2/28~7.1%M120
Han (Anhui)Ne 2000[4]1/22~4.6%M120
Severní HanNe 2000[4]1/22~4.5%M120
Kinh
(Ho Či Minovo Město )		Poznik 2016[2]2/46~4.3%M120
Han (Šanghaj)Ne 2000[4]1/30~3.3%M120
Han (Shandong)Ne 2000[4]1/32~3.1%M120
KoreaWells 2001[5]1/45~2.2%M120
Tibetan-LhasaNe 2000[4]1/46~2.2%M120
TibetGayden 2007[11]2/156~1.3%M120
Han (Shanxi )Zhong 2010[13]1/56~1.8%M120
Ujgurština (Xinjiang)Zhong 2010[13]1/71~1.4%M120
Ujgurština (Xinjiang)Zhong 2010[13]1/50~2.0%M120
Han (Jiangsu )Ne 2000[4]1/55~1.8%M120
MongolskoDi Cristofaro 2013[10]2/160~1.25%M120
JaponskoNonaka 2007[7]1/263~0.38%M120

Evropa

Doposud nebyl Q-M120 v evropských populacích detekován.

Přidružené SNP

Haploskupina Q-M120 je definována přítomností M120 Polymorfismus jednoho nukleotidu (SNP) a také M265 (AKA N14) SNP.

Fylogenetický strom

Toto je Thomas Krahn z Centra pro genomický výzkum Návrh stromu pro haploskupinu Q-M120.

  • Q-MEH2 MEH2, L472, L528
    • Q-M120 M120, N14 / M265
Mapa globální distribuce Q1a-F1096

Viz také

Subclady Y-DNA Q-M242

Páteřní strom Y-DNA

Fylogenetický strom člověka Haploskupiny Y-chromozomové DNA [χ 1][χ 2]
"Y-chromozomální Adam "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
GHIJK
IJKH
IJK.
Já   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     T    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]P  [χ 12]
NE  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NÓQR

Reference

  1. ^ A b C d Plná haploskupina YTree v6.03.05 dne 20. července 2018. Přístup k 20. červenci 2018.
  2. ^ A b C G. David Poznik, Yali Xue, Fernando L. Mendez, et al. (2016), „Interpunkční výbuchy v lidské mužské demografii byly odvozeny z 1 244 celosvětových sekvencí Y-chromozomu.“ Genetika přírody 2016 červen; 48 (6): 593–599. doi: 10,1038 / ng.3559.
  3. ^ A b Wen B; Li H; Lu D; et al. (Září 2004). „Genetické důkazy podporují demickou difúzi kultury Han“. Příroda. 431 (7006): 302–5. Bibcode:2004 Natur.431..302W. doi:10.1038 / nature02878. PMID  15372031. S2CID  4301581. Doplňková tabulka 2: Distribuce haploskupin NRY v populacích Han
  4. ^ A b C d E F G h i j Su, Bing; Xiao, Chunjie; Deka, Ranjan; Seielstad, Mark T .; Kangwanpong, Daoroong; Xiao, Junhua; Lu, Daru; Underhill, Peter; Cavalli-Sforza, Luca (2000). „Haplotypy chromozomů Y odhalují prehistorické migrace do Himalájí“. Genetika člověka. 107 (6): 582–90. doi:10,1007 / s004390000406. PMID  11153912. S2CID  36788262.
  5. ^ A b C d Wells RS; Yuldasheva N; Ruzibakiev R; et al. (Srpen 2001). „Euroasijské srdce: kontinentální pohled na diverzitu chromozomů Y“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (18): 10244–9. Bibcode:2001PNAS ... 9810244W. doi:10.1073 / pnas.171305098. PMC  56946. PMID  11526236. Tabulka 1: Frekvence haplotypu Y-chromozomu u 49 euroasijských populací, seřazené podle geografické oblasti
  6. ^ Cai X, Qin Z, Wen B, Xu S, Wang Y, et al. (2011), „Migrace člověka přes úzká místa z jihovýchodní Asie do východní Asie během posledního glaciálního maxima odhaleného chromozomy Y“. PLOS ONE 6 (8): e24282. doi: 10,1371 / journal.pone.0024282
  7. ^ A b Nonaka, I .; Minaguchi, K .; Takezaki, N. (2007). „Y-chromozomální binární haploskupiny v japonské populaci a jejich vztah k 16 Y-STR polymorfismům“. Annals of Human Genetics. 71 (4): 480–95. doi:10.1111 / j.1469-1809.2006.00343.x. hdl:10130/491. PMID  17274803. S2CID  1041367.
  8. ^ Boris Malyarchuk, Miroslava Derenko, Galina Denisova, Sanj Khoyt, Marcin Woźniak, Tomasz Grzybowski a Ilya Zakharov, „diverzita Y-chromozomů u Kalmyků na etnické i kmenové úrovni.“ Journal of Human Genetics (2013) 58, 804–811; doi: 10.1038 / jhg.2013.108
  9. ^ Battaglia V, Grugni V, Perego UA, Angerhofer N, Gomez-Palmieri JE, et al. (2013), „The First Peopling of South America: New Evidence from Y-Chromosome Haplogroup Q.“ PLOS ONE 8 (8): e71390. doi: 10,1371 / journal.pone.0071390
  10. ^ A b C Di Cristofaro J, Pennarun E, Mazières S, Myres NM, Lin AA, et al. (2013) „Afghan Hindu Kush: Where Euroasian Sub-Continent Gene Flows Converge.“ PLOS ONE 8 (10): e76748. doi: 10,1371 / journal.pone.0076748
  11. ^ A b Gayden T; Cadenas AM; Regueiro M; et al. (Květen 2007). „Himálaj jako směrová bariéra toku plynu“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 80 (5): 884–94. doi:10.1086/516757. PMC  1852741. PMID  17436243.
  12. ^ Wang C-C, Wang L-X, Shrestha R, Zhang M, Huang X-Y, et al. (2014), „Genetická struktura Qiangic populací pobývajících v západním sichuanském koridoru.“ PLOS ONE 9 (8): e103772. doi: 10,1371 / journal.pone.0103772
  13. ^ A b C d Zhong, H .; Shi, H .; Qi, X.-B .; Duan, Z.-Y .; Tan, P.-P .; Jin, L .; Su, B .; Ma, R. Z. (2010). „Rozšířené vyšetřování chromozomů Y naznačuje postglaciální migraci moderních lidí do východní Asie severní cestou“. Molekulární biologie a evoluce. 28 (1): 717–27. doi:10,1093 / molbev / msq247. PMID  20837606.
  14. ^ Pille Hallast, Chiara Batini, Daniel Zadik, et al.„Strom Y chromozomu praskne do listu: 13 000 vysoce spolehlivých SNP pokrývajících většinu známých subtypů.“ Molekulární biologie a evoluce Publikace Advance Access 2. prosince 2014. doi: 10,1093 / molbev / msu327
  15. ^ Monika Karmin, Lauri Saag, Mário Vicente, et al. (2015), „Nedávné zúžení rozmanitosti chromozomů Y se shoduje s globální změnou kultury.“ Výzkum genomu 25: 1–8. Vydal Cold Spring Harbor Laboratory Press; ISSN 1088-9051 / 15; www.genome.org.
  16. ^ Sengupta, Sanghamitra; Zhivotovsky, Lev A .; King, Roy; Mehdi, S.Q .; Edmonds, Christopher A .; Chow, Cheryl-Emiliane T .; Lin, Alice A .; Mitra, Mitashree; Sil, Samir K. (2006). „Polarita a dočasnost distribucí Y-chromozomů s vysokým rozlišením v Indii identifikuje jak domorodé, tak exogenní expanze a odhaluje menší genetický vliv středoasijských pastevců“. American Journal of Human Genetics. 78 (2): 202–21. doi:10.1086/499411. PMC  1380230. PMID  16400607.
  17. ^ Sebastian Lippold, Hongyang Xu, Albert Ko, Mingkun Li, Gabriel Renaud, Anne Butthof, Roland Schröder a Mark Stoneking, „Demografické historie lidského otce a matky: pohledy z Y chromozomů a sekvencí mtDNA s vysokým rozlišením.“ Investigativní genetika 2014, 5:13. http://www.investigativegenetics.com/content/5/1/13

externí odkazy