Haploskupina Q-L54 - Haplogroup Q-L54

Haploskupina Q-L54
Možné místo původu	Eurasie
Předek	Q-L53
Potomci	Q-L330, Q-M3, Q-M971, Q-Z780, Q-L804
Definování mutací	L54

Haploskupina Q-L54 je subclade Y-DNA haploskupina Q-L53. Q1a3a-L54 je definován přítomností L54 Polymorfismus jednoho nukleotidu (SNP).

Rozdělení

Q-L54 má potomky v západní a střední Evropě, v severní a východní Asii a v Americe. Zahrnuje dvě hlavní předkolumbovské otcovské linie v Severní a Jižní Americe: Q-M3 a Q-M971. Kluk Anzick-1, který žil před 12 600 lety a byl nalezen ve státě Montana, má Y-chromozom, který odkazuje na haploskupinu Q-M971 (Q-L54 * (xM3)).^[1]^[2]^[3] Potomci Q-L54 zahrnují také dvě euroasijské otcovské linie, středoasijskou linii Q-L330 a skandinávskou Q-L804. ^[4] Q-L804 je skandinávský a TMRCA je jen něco málo přes 3000 let.^[5]Haploskupina Q ‐ L54 je dominantní ve dvou severosibiřských populacích, v Kets a Selkups s frekvencí 97,7%, respektive 66,7%.^[6]

Přidružené SNP

Q-L54 je v současné době definován samotným L54 SNP.

Podskupiny

Aktuální stav polygentního stromu pro Q-L54 publikovali pinotti et. al v článku Y chromozomové sekvence odhalují krátké Beringianovo zastavení, rychlou expanzi a ranou populační strukturu původních amerických zakladatelů. Kalibrovaná fylogeneze Y haploskupiny Q-L54.^[7]

L54
- Q-L330
- Q-MPB001 (18,9 kya)
  - Q-CTS1780
  - Q-M930
    - Q-L804
    - Q-M3 (15,0 kya)
      - Q-Y4308
      - Q-M848 (14,9 kya)

Verze polygentického stromu pro haploskupinu Q-L54 z roku 2013, kterou vytvořil Thomas Krahn v Genomic Research Center: Navržený strom.

L54
- M3, L341.2
  - M19
  - M194
  - M199, P106, P292
  - STRÁNKY 104, STRÁNKY 126
  - STRÁNKY 131
  - L663
  - SA01
  - L766, L767
  - L883, L884, L885, L886, L887
  - L888, L889, L890, L891
- L804, L805
  - L807
- Z780
  - L191
  - L400, L401
- L456
- L568, L569, L570, L571
  - L567
  - L619.1
- L330, L334
  - L329, L332, L333

Viz také

Haploskupina lidského Y chromozomu DNA

Y-DNA Q-M242 Subclades

Páteřní strom Y-DNA

Fylogenetický strom člověka Haploskupiny Y-chromozomové DNA ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-chromozomální Adam "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

Já

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

T

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

P ^{[χ 12]}

NE

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Poznámky pod čarou

^ Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). „Vidět dřevo pro stromy: minimální referenční fylogeneze pro lidský chromozom Y“. Lidská mutace. 35 (2): 187–91. doi:10,1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haploskupina Tree 2015. (Datum přístupu: 1. února 2015.)
^ Haploskupina A0-T je také známá jako A-L1085 (a dříve jako A0'1'2'3'4).
^ Haploskupina A1 je také známá jako A1'2'3'4.
^ Haploskupina LT (L298 / P326) je také známá jako Haploskupina K1.
^ V letech 2002 až 2008 Haploskupina T-M184 byla známá jako „Haplogroup K2“. Od té doby bylo toto jméno znovu přiřazeno K-M526, sourozenec Haplogroup LT.
^ Haploskupina K2a (M2308) a její primární subklade K-M2313 byly v roce 2016 odděleny od Haploskupiny NO (F549). (Toto následovalo po vydání: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL a kol. (2016). „Interpunkční výbuchy v lidské mužské demografii byly odvozeny z 1 244 celosvětových sekvencí Y-chromozomu“. Genetika přírody. 48 (6): 593–9. doi:10.1038 / ng.3559. PMC 4884158. PMID 27111036. V minulosti byly s názvem „K2a“ identifikovány také jiné haploskupiny, včetně NO (M214) a K2e.
^ Haploskupina K2b (M1221 / P331 / PF5911) je také známá jako Haplogroup MPS.
^ Haploskupina K2e (K-M147) byla dříve známá jako „Haploskupina X“ a „K2a“ (ale je sourozeneckou subklade současné K2a).
^ K-M2313 *, který dosud nemá fylogenetický název, byl dokumentován u dvou žijících jedinců, kteří mají etnické vazby na Indii a jihovýchodní Asii. Navíc, K-Y28299, který se jeví jako primární větev K-M2313, byl nalezen u tří žijících jedinců z Indie. Viz: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, „K-M2335“, a; PhyloTree, 2017, „Podrobnosti o značkách Y-SNP zahrnutých do minimálního stromu Y“ (Datum přístupu na tyto stránky: 9. prosince 2017)
^ Haploskupina K2b1 (P397 / P399) je také známá jako Haploskupina MS, ale má širší a složitější vnitřní strukturu.
^ Haploskupina P (P295) je také známá jako K2b2.
^ Haploskupina S je od roku 2017 známá také jako K2b1a. (Dříve byl název Haplogroup S přiřazen K2b1a4.)
^ Haploskupina M je od roku 2017 známá také jako K2b1b. (Dříve byl název Haplogroup M přiřazen K2b1d.)

Reference

^ M. Rasmussen a kol. Genom člověka z pozdního pleistocénu z pohřebiště Clovis v západní Montaně // Příroda. 2014. V. 506. S. 225–229.
^ Jennifer A. Raff a Deborah A. Bolnick. Paleogenomika: Genetické kořeny prvních Američanů // Příroda. 2014. V. 506. S. 162–163.
^ Kivisild, Toomas (04.03.2017). „Studium variací chromozomu Y člověkem prostřednictvím starověké DNA“. Genetika člověka. Springer Nature. 136 (5): 529–546. doi:10.1007 / s00439-017-1773-z. ISSN 0340-6717. PMC 5418327. PMID 28260210.
^ Kivisild, Toomas (04.03.2017). „Studium variací lidského chromozomu Y prostřednictvím starověké DNA“. Genetika člověka. Springer Nature. 136 (5): 529–546. doi:10.1007 / s00439-017-1773-z. ISSN 0340-6717. PMC 5418327. PMID 28260210.
^ https://yfull.com/tree/Q-L804/
^ Karafet, Tatiana M .; Osipová, Ludmila P .; Savina, Olga V .; Hallmark, Brian; Hammer, Michael F. (2018). „Sibiřská genetická rozmanitost odhaluje složitý původ samojedicky mluvících populací“. American Journal of Human Biology. Wiley. 30 (6): e23194. doi:10.1002 / ajhb.23194. ISSN 1042-0533. PMID 30408262.
^ Pinotti, Thomaz; Bergström, Anders; Geppert, Maria; Bawn, Matt; Ohasi, Dominique; Shi, Wentao; Lacerda, Daniela R .; Solli, Arne; Norstedt, Jakob; Reed, Kate; Dawtry, Kim; González-Andrade, Fabricio; Paz-y-Miño, Cesar; Revollo, Susana; Cuellar, Cinthia; Jota, Marilza S .; Santos, José E .; Ayub, Qasim; Kivisild, Toomas; Sandoval, José R .; Fujita, Ricardo; Xue, Yali; Roewer, Lutz; Santos, Fabrício R .; Tyler-Smith, Chris (2018). „Y Chromosome Sequences Reveal a Short Beringian Standstill, Rapid Expansion, and early Population structure of Native American Founders“. Aktuální biologie. Elsevier BV. 29 (1): 149–157.e3. doi:10.1016 / j.cub.2018.11.029. ISSN 0960-9822. PMID 30581024.

externí odkazy

Projekt Y-DNA Haplogroup Q

[vanOven2014-8] Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). „Vidět dřevo pro stromy: minimální referenční fylogeneze pro lidský chromozom Y“. Lidská mutace. 35 (2): 187–91. doi:10,1002 / humu.22468. PMID 24166809.

[ISOGG2015-9] International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haploskupina Tree 2015. (Datum přístupu: 1. února 2015.)

[A0-T-10] Haploskupina A0-T je také známá jako A-L1085 (a dříve jako A0'1'2'3'4).

[A1-11] Haploskupina A1 je také známá jako A1'2'3'4.

[LT-12] Haploskupina LT (L298 / P326) je také známá jako Haploskupina K1.

[K2-13] V letech 2002 až 2008 Haploskupina T-M184 byla známá jako „Haplogroup K2“. Od té doby bylo toto jméno znovu přiřazeno K-M526, sourozenec Haplogroup LT.

[K2a-14] Haploskupina K2a (M2308) a její primární subklade K-M2313 byly v roce 2016 odděleny od Haploskupiny NO (F549). (Toto následovalo po vydání: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL a kol. (2016). „Interpunkční výbuchy v lidské mužské demografii byly odvozeny z 1 244 celosvětových sekvencí Y-chromozomu“. Genetika přírody. 48 (6): 593–9. doi:10.1038 / ng.3559. PMC 4884158. PMID 27111036. V minulosti byly s názvem „K2a“ identifikovány také jiné haploskupiny, včetně NO (M214) a K2e.

[K2b-15] Haploskupina K2b (M1221 / P331 / PF5911) je také známá jako Haplogroup MPS.

[K2e-16] Haploskupina K2e (K-M147) byla dříve známá jako „Haploskupina X“ a „K2a“ (ale je sourozeneckou subklade současné K2a).

[K-M2313-17] K-M2313 *, který dosud nemá fylogenetický název, byl dokumentován u dvou žijících jedinců, kteří mají etnické vazby na Indii a jihovýchodní Asii. Navíc, K-Y28299, který se jeví jako primární větev K-M2313, byl nalezen u tří žijících jedinců z Indie. Viz: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, „K-M2335“, a; PhyloTree, 2017, „Podrobnosti o značkách Y-SNP zahrnutých do minimálního stromu Y“ (Datum přístupu na tyto stránky: 9. prosince 2017)

[K2b1-18] Haploskupina K2b1 (P397 / P399) je také známá jako Haploskupina MS, ale má širší a složitější vnitřní strukturu.

[P-19] Haploskupina P (P295) je také známá jako K2b2.

[S-20] Haploskupina S je od roku 2017 známá také jako K2b1a. (Dříve byl název Haplogroup S přiřazen K2b1a4.)

[M-21] Haploskupina M je od roku 2017 známá také jako K2b1b. (Dříve byl název Haplogroup M přiřazen K2b1d.)

[1] M. Rasmussen a kol. Genom člověka z pozdního pleistocénu z pohřebiště Clovis v západní Montaně // Příroda. 2014. V. 506. S. 225–229.

[2] Jennifer A. Raff a Deborah A. Bolnick. Paleogenomika: Genetické kořeny prvních Američanů // Příroda. 2014. V. 506. S. 162–163.

[Kivisild_pp._529–546-3] Kivisild, Toomas (04.03.2017). „Studium variací chromozomu Y člověkem prostřednictvím starověké DNA“. Genetika člověka. Springer Nature. 136 (5): 529–546. doi:10.1007 / s00439-017-1773-z. ISSN 0340-6717. PMC 5418327. PMID 28260210.

[Kivisild2017-4] Kivisild, Toomas (04.03.2017). „Studium variací lidského chromozomu Y prostřednictvím starověké DNA“. Genetika člověka. Springer Nature. 136 (5): 529–546. doi:10.1007 / s00439-017-1773-z. ISSN 0340-6717. PMC 5418327. PMID 28260210.

[5] ttps://yfull.com/tree/Q-L804/

[Karafet_Osipova_Savina_Hallmark_2018_p=e23194-6] Karafet, Tatiana M .; Osipová, Ludmila P .; Savina, Olga V .; Hallmark, Brian; Hammer, Michael F. (2018). „Sibiřská genetická rozmanitost odhaluje složitý původ samojedicky mluvících populací“. American Journal of Human Biology. Wiley. 30 (6): e23194. doi:10.1002 / ajhb.23194. ISSN 1042-0533. PMID 30408262.

[Pinotti_Tyler-Smith_2018-7] Pinotti, Thomaz; Bergström, Anders; Geppert, Maria; Bawn, Matt; Ohasi, Dominique; Shi, Wentao; Lacerda, Daniela R .; Solli, Arne; Norstedt, Jakob; Reed, Kate; Dawtry, Kim; González-Andrade, Fabricio; Paz-y-Miño, Cesar; Revollo, Susana; Cuellar, Cinthia; Jota, Marilza S .; Santos, José E .; Ayub, Qasim; Kivisild, Toomas; Sandoval, José R .; Fujita, Ricardo; Xue, Yali; Roewer, Lutz; Santos, Fabrício R .; Tyler-Smith, Chris (2018). „Y Chromosome Sequences Reveal a Short Beringian Standstill, Rapid Expansion, and early Population structure of Native American Founders“. Aktuální biologie. Elsevier BV. 29 (1): 149–157.e3. doi:10.1016 / j.cub.2018.11.029. ISSN 0960-9822. PMID 30581024.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[χ 1]

[χ 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]

[χ 14]