Haploskupina C-B477 - Haplogroup C-B477

Haploskupina C-B477
Možné místo původu	Sahul police
Předek	(Prarodič)C1
Potomci	C1b2a-M38; C1b2b-M347
Definování mutací	B477
Nejvyšší frekvence	Papuánští lidé, Domorodí Australani, Melanésie, Polynéští lidé

Haploskupina C-B477, také známý jako Haploskupina C1b2, je Y-chromozom haploskupina. Je to jedna ze dvou hlavních větví Haploskupina C1b, jeden z potomků Haploskupina C1.

Je distribuován ve vysoké frekvenci v Domorodí Australani, Papuánští lidé, Melanésie a Polynéští lidé.

Podskupiny

C1b2 （C-B477）
- C1b2a （C-M38）Papuánští lidé a další Oceáni
- C1b2b （C-M347）Domorodí Australani^[1]

Frekvence

C-M38

Lani 100%,^[2]
Dani 92%,^[2]
Cookovy ostrovy 78%^[3]-82%,^[2]
Samoa 62%^[3]-72%,^[4]
Tahiti 64%,^[4]
Sumba 57%,^[4]
Maori 43%,^[5]
Tonga 34%,^[3]^[4]
Futuna 30%,^[3]
Maewo 23%,^[4]
Ostrovy Maluku 15%^[2]-28%,^[4]
Fidži 22%,^[3]
Asmat lidé 20%,^[2]
Pobřežní Nová Guinea 14%^[4]-23%,^[2]
Flores 17%,^[4]
Tuvalu 17%,^[3]
Tolai 12.5%^[2]-21%,^[3]
Malé Sunda ostrovy 16%,^[2]
Ostrovy admirality 16%,^[3]
Západní Sulawesi 12.5%^[4]

C-M347

Domorodí Australani 60.2%^[6]-68.7%^[7]

Historie migrace

Migrace haploskupiny C (Y-DNA)

Haploskupina B-477 se ujala Jižní trasa po Z Afriky přes Indický subkontinent na Sahul police.^[8] C-M38 se narodil 49 600 let předtím, než se objevil kolem Nová Guinea.^[9]

Reference

^ Hudjashov, G; Kivisild, T; Underhill, PA; et al. (Květen 2007). ""(Květen 2007). „Odhalení prehistorického osídlení Austrálie analýzou chromozomu Y a mtDNA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 104 (21): 8726–30. doi:10.1073 / pnas.0702928104. PMC 1885570. PMID 17496137.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h Kayser, M; Brauer, S; Weiss, G; et al. (Únor 2003). ""(Únor 2003). „Redukovaný Y-chromozom, ale nikoli mitochondriální DNA, diverzita v lidských populacích ze Západní Nové Guineje“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 72 (2): 281–302. doi:10.1086/346065. PMC 379223. PMID 12532283.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h Kayser, M; Choi, Y; van Oven, M; et al. (Červenec 2008). ""(Červenec 2008). „Dopad austronéské expanze: důkazy z diverzity mtDNA a Y chromozomů v Admirality Islands of Melanesia“. Mol. Biol. Evol. 25 (7): 1362–74. doi:10.1093 / molbev / msn078. PMID 18390477.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ Cox, MP; Redd, AJ; Karafet, TM; et al. (Říjen 2007). "Polynéský motiv na chromozomu Y: struktura populace ve vzdálené Oceánii". Hučení. Biol. 79 (5): 525–35. doi:10.1353 / náboj. 2008.0004. hdl:1808/13585. PMID 18478968. S2CID 4834817.
^ Underhill PA, Passarino G, Lin AA a kol. (Duben 2001). „Maorské počátky, haplotypy chromozomů Y a důsledky pro historii člověka v Pacifiku“. Hučení. Mutat. 17 (4): 271–80. doi:10,1002 / humu.23. PMID 11295824. S2CID 7199607.
^ Hudjashov, G .; Kivisild, T .; Underhill, P. A .; Endicott, P .; Sanchez, J. J .; Lin, A. A .; Shen, P .; Oefner, P .; Renfrew, C .; Villems, R .; Forster, P. (2007). „Odhalení prehistorického osídlení Austrálie analýzou chromozomu Y a mtDNA“. Sborník Národní akademie věd. 104 (21): 8726–30. Bibcode:2007PNAS..104,8726H. doi:10.1073 / pnas.0702928104. PMC 1885570. PMID 17496137.
^ Kayser, M; Brauer, Silke; Weiss, Gunter; Schiefenhövel, Wulf; Underhill, Peter; Shen, Peidong; Oefner, Peter; Tommaseo-Ponzetta, Mila; Stoneking, Mark (2003). „Snížený Y-chromozom, ale nikoli mitochondriální DNA, rozmanitost lidských populací ze Západní Nové Guineje“. American Journal of Human Genetics. 72 (2): 281–302. doi:10.1086/346065. PMC 379223. PMID 12532283.
^ 崎谷満『DNA ・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史』（勉誠出版 2009 年） (v japonštině)
^ Scheinfeldt, L .; Friedlaender, F; Friedlaender, J; Latham, K; Koki, G; Karafet, T; Hammer, M; Lorenz, J (2006). „Neočekávaná variace chromozomů NRY v Melanesii na Severním ostrově“. Molekulární biologie a evoluce. 23 (8): 1628–41. doi:10.1093 / molbev / msl028. PMID 16754639.

Fylogenetický strom člověka Haploskupiny Y-chromozomové DNA ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-chromozomální Adam "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

Já

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

T

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

P ^{[χ 12]}

NE

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Poznámky pod čarou

^ Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). „Vidět dřevo pro stromy: minimální referenční fylogeneze pro lidský chromozom Y“. Lidská mutace. 35 (2): 187–91. doi:10,1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haploskupina Tree 2015. (Datum přístupu: 1. února 2015.)
^ Haploskupina A0-T je také známá jako A-L1085 (a dříve jako A0'1'2'3'4).
^ Haploskupina A1 je také známá jako A1'2'3'4.
^ Haploskupina LT (L298 / P326) je také známá jako Haploskupina K1.
^ V letech 2002 až 2008 Haploskupina T-M184 byla známá jako „Haplogroup K2“. Od té doby bylo toto jméno znovu přiřazeno K-M526, sourozenec Haplogroup LT.
^ Haploskupina K2a (M2308) a její primární subklade K-M2313 byly v roce 2016 odděleny od Haploskupiny NO (F549). (Toto následovalo po vydání: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL a kol. (2016). „Interpunkční výbuchy v lidské mužské demografii odvozeny z 1 244 celosvětových sekvencí Y-chromozomu. Genetika přírody. 48 (6): 593–9. doi:10.1038 / ng.3559. PMC 4884158. PMID 27111036. V minulosti byly s názvem „K2a“ identifikovány také jiné haploskupiny, včetně NO (M214) a K2e.
^ Haploskupina K2b (M1221 / P331 / PF5911) je také známá jako Haplogroup MPS.
^ Haploskupina K2e (K-M147) byla dříve známá jako „Haploskupina X“ a „K2a“ (ale je sourozeneckou subklade současné K2a).
^ K-M2313 *, který dosud nemá fylogenetický název, byl dokumentován u dvou žijících jedinců, kteří mají etnické vazby na Indii a jihovýchodní Asii. Navíc, K-Y28299, který se jeví jako primární větev K-M2313, byl nalezen u tří žijících jedinců z Indie. Viz: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, „K-M2335“, a; PhyloTree, 2017, „Podrobnosti o značkách Y-SNP zahrnutých do minimálního stromu Y“ (Datum přístupu na tyto stránky: 9. prosince 2017)
^ Haploskupina K2b1 (P397 / P399) je také známá jako Haploskupina MS, ale má širší a složitější vnitřní strukturu.
^ Haploskupina P (P295) je také známá jako K2b2.
^ Haploskupina S je od roku 2017 známá také jako K2b1a. (Dříve byl název Haplogroup S přiřazen K2b1a4.)
^ Haploskupina M je od roku 2017 známá také jako K2b1b. (Dříve byl název Haplogroup M přiřazen K2b1d.)

Tento článek týkající se bioinformatiky je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Hudjashov, G; Kivisild, T; Underhill, PA; et al. (Květen 2007). ""(Květen 2007). „Odhalení prehistorického osídlení Austrálie analýzou chromozomu Y a mtDNA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 104 (21): 8726–30. doi:10.1073 / pnas.0702928104. PMC 1885570. PMID 17496137.

[Kayser2003-2] A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h Kayser, M; Brauer, S; Weiss, G; et al. (Únor 2003). ""(Únor 2003). „Redukovaný Y-chromozom, ale nikoli mitochondriální DNA, diverzita v lidských populacích ze Západní Nové Guineje“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 72 (2): 281–302. doi:10.1086/346065. PMC 379223. PMID 12532283.

[Kayser2008-3] A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h Kayser, M; Choi, Y; van Oven, M; et al. (Červenec 2008). ""(Červenec 2008). „Dopad austronéské expanze: důkazy z diverzity mtDNA a Y chromozomů v Admirality Islands of Melanesia“. Mol. Biol. Evol. 25 (7): 1362–74. doi:10.1093 / molbev / msn078. PMID 18390477.

[Cox2007-4] A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ Cox, MP; Redd, AJ; Karafet, TM; et al. (Říjen 2007). "Polynéský motiv na chromozomu Y: struktura populace ve vzdálené Oceánii". Hučení. Biol. 79 (5): 525–35. doi:10.1353 / náboj. 2008.0004. hdl:1808/13585. PMID 18478968. S2CID 4834817.

[Underhill2001-5] Underhill PA, Passarino G, Lin AA a kol. (Duben 2001). „Maorské počátky, haplotypy chromozomů Y a důsledky pro historii člověka v Pacifiku“. Hučení. Mutat. 17 (4): 271–80. doi:10,1002 / humu.23. PMID 11295824. S2CID 7199607.

[6] Hudjashov, G .; Kivisild, T .; Underhill, P. A .; Endicott, P .; Sanchez, J. J .; Lin, A. A .; Shen, P .; Oefner, P .; Renfrew, C .; Villems, R .; Forster, P. (2007). „Odhalení prehistorického osídlení Austrálie analýzou chromozomu Y a mtDNA“. Sborník Národní akademie věd. 104 (21): 8726–30. Bibcode:2007PNAS..104,8726H. doi:10.1073 / pnas.0702928104. PMC 1885570. PMID 17496137.

[7] Kayser, M; Brauer, Silke; Weiss, Gunter; Schiefenhövel, Wulf; Underhill, Peter; Shen, Peidong; Oefner, Peter; Tommaseo-Ponzetta, Mila; Stoneking, Mark (2003). „Snížený Y-chromozom, ale nikoli mitochondriální DNA, rozmanitost lidských populací ze Západní Nové Guineje“. American Journal of Human Genetics. 72 (2): 281–302. doi:10.1086/346065. PMC 379223. PMID 12532283.

[8] 崎谷満『DNA ・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史』（勉誠出版 2009 年） (v japonštině)

[Scheinfeldt2006-9] Scheinfeldt, L .; Friedlaender, F; Friedlaender, J; Latham, K; Koki, G; Karafet, T; Hammer, M; Lorenz, J (2006). „Neočekávaná variace chromozomů NRY v Melanesii na Severním ostrově“. Molekulární biologie a evoluce. 23 (8): 1628–41. doi:10.1093 / molbev / msl028. PMID 16754639.

[vanOven2014-10] Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). „Vidět dřevo pro stromy: minimální referenční fylogeneze pro lidský chromozom Y“. Lidská mutace. 35 (2): 187–91. doi:10,1002 / humu.22468. PMID 24166809.

[ISOGG2015-11] International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haploskupina Tree 2015. (Datum přístupu: 1. února 2015.)

[A0-T-12] Haploskupina A0-T je také známá jako A-L1085 (a dříve jako A0'1'2'3'4).

[A1-13] Haploskupina A1 je také známá jako A1'2'3'4.

[LT-14] Haploskupina LT (L298 / P326) je také známá jako Haploskupina K1.

[K2-15] V letech 2002 až 2008 Haploskupina T-M184 byla známá jako „Haplogroup K2“. Od té doby bylo toto jméno znovu přiřazeno K-M526, sourozenec Haplogroup LT.

[K2a-16] Haploskupina K2a (M2308) a její primární subklade K-M2313 byly v roce 2016 odděleny od Haploskupiny NO (F549). (Toto následovalo po vydání: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL a kol. (2016). „Interpunkční výbuchy v lidské mužské demografii odvozeny z 1 244 celosvětových sekvencí Y-chromozomu. Genetika přírody. 48 (6): 593–9. doi:10.1038 / ng.3559. PMC 4884158. PMID 27111036. V minulosti byly s názvem „K2a“ identifikovány také jiné haploskupiny, včetně NO (M214) a K2e.

[K2b-17] Haploskupina K2b (M1221 / P331 / PF5911) je také známá jako Haplogroup MPS.

[K2e-18] Haploskupina K2e (K-M147) byla dříve známá jako „Haploskupina X“ a „K2a“ (ale je sourozeneckou subklade současné K2a).

[K-M2313-19] K-M2313 *, který dosud nemá fylogenetický název, byl dokumentován u dvou žijících jedinců, kteří mají etnické vazby na Indii a jihovýchodní Asii. Navíc, K-Y28299, který se jeví jako primární větev K-M2313, byl nalezen u tří žijících jedinců z Indie. Viz: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, „K-M2335“, a; PhyloTree, 2017, „Podrobnosti o značkách Y-SNP zahrnutých do minimálního stromu Y“ (Datum přístupu na tyto stránky: 9. prosince 2017)

[K2b1-20] Haploskupina K2b1 (P397 / P399) je také známá jako Haploskupina MS, ale má širší a složitější vnitřní strukturu.

[P-21] Haploskupina P (P295) je také známá jako K2b2.

[S-22] Haploskupina S je od roku 2017 známá také jako K2b1a. (Dříve byl název Haplogroup S přiřazen K2b1a4.)

[M-23] Haploskupina M je od roku 2017 známá také jako K2b1b. (Dříve byl název Haplogroup M přiřazen K2b1d.)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[χ 1]

[χ 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]

[χ 14]