HIST2H2BE - HIST2H2BE

H2BC21
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4NFT
Identifikátory
Aliasy	H2BC21, GL105, H2B, H2B.1, H2BFQ, H2BGL105, H2BQ, histonová skupina 2, H2be, histonová skupina 2 H2B člen rodiny e, H2B seskupený histon 21, HIST2H2BE, H2BE
Externí ID	OMIM: 601831 HomoloGene: 128426 Genové karty: H2BC21
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	149,886,652 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita heterodimerizace proteinu; • Vazba DNA;
Buněčná složka	• chromozóm; • extracelulární exosom; • nukleoplazma; • nukleosom; • buněčné jádro; • extracelulární; • cytosol;
Biologický proces	• shromáždění nukleosomů; • vrozená imunitní odpověď na sliznici; • obranná reakce na bakterii; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8349
	n / a
	ENSG00000184678
	n / a
	Q16778
	n / a
	NM_003528
	n / a
	NP_003519
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Histon H2B typ 2-E je protein že u lidí je kódován HIST2H2BE gen.^[3]^[4]^[5]

Histony jsou základní jaderné proteiny, které jsou odpovědné za strukturu nukleosomů chromozomálních vláken u eukaryot. Dvě molekuly každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3 a H4) tvoří oktamer, kolem kterého je přibližně 146 bp DNA zabaleno do opakujících se jednotek, nazývaných nukleosomy. Linkonový histon, H1, interaguje s linkerovou DNA mezi nukleosomy a funguje při zhutňování chromatinu do struktur vyššího řádu. Tento gen kóduje člena rodiny histonových H2B a generuje dva transkripty pomocí konzervovaného zakončovacího motivu kmenové smyčky a polyA adičního motivu.^[5]

Rakovina

Gen HIST2H2BE byl detekován progresivně downregulovaný v Lidsky papillomavirus -pozitivní neoplastické keratinocyty odvozeno z děložního čípku preneoplastické léze na různých úrovních malignity.^[6] Z tohoto důvodu je tento gen pravděpodobně spojen s tumorigenezí a může být potenciálním prognostickým markerem pro děložní děložní hrdlo. preneoplastické léze postup.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184678 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Collart D, Romain PL, Huebner K, Pockwinse S, Pilapil S, Cannizzaro LA, Lian JB, Croce CM, Stein JL, Stein GS (leden 1993). „Gen varianty lidského histonu H2B.1, umístěný na chromozomu 1, využívá alternativní 3 'konec zpracování“. J Cell Biochem. 50 (4): 374–85. doi:10.1002 / jcb.240500406. PMID 1469070.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST2H2BE histon cluster 2, H2be“.
^ ^A ^b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). "Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů". J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID 25205602.

Další čtení

Collart D, Ramsey-Ewing A, Bortell R a kol. (1991). „Izolace a charakterizace cDNA z lidského genu histonu H2B, který je recipročně exprimován ve vztahu k replikačně závislým genům histonu H2B během diferenciace buněk HL60.“. Biochemie. 30 (6): 1610–7. doi:10.1021 / bi00220a024. PMID 1993178.
Jackson S, Brooks W, Jackson V (1994). "Dynamika interakcí histonů H2A, H2B a H3, H4 s torzně namáhanou DNA". Biochemie. 33 (18): 5392–403. doi:10.1021 / bi00184a006. PMID 8180162.
Frohm M, Gunne H, Bergman AC a kol. (1996). „Biochemická a antibakteriální analýza lidských ran a puchýřků“. Eur. J. Biochem. 237 (1): 86–92. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0086n.x. PMID 8620898.
Rodriguez P, Munroe D, Prawitt D a kol. (1997). „Funkční charakterizace lidského nukleosomového montážního proteinu-2 (NAP1L4) naznačuje roli jako histonový chaperon“. Genomika. 44 (3): 253–65. doi:10.1006 / geno.1997.4868. PMID 9325046.
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Zhang Y, Sun ZW, Iratni R a kol. (1998). „SAP30, nový protein konzervovaný mezi člověkem a kvasinkami, je součástí komplexu histon-deacetylázy“. Mol. Buňka. 1 (7): 1021–31. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80102-1. PMID 9651585.
Lorain S, Quivy JP, Monier-Gavelle F a kol. (1998). „Jádrové histony a HIRIP3, nový protein vázající se na histon, přímo interagují s proteiny HIRA s opakováním proteinu HIRA“. Mol. Buňka. Biol. 18 (9): 5546–56. doi:10.1128 / MCB.18.9.5546. PMC 109139. PMID 9710638.
Khan IU, Wallin R, Gupta RS, Kammer GM (1998). "Fosforylace proteinkinázy A katalyzovaná chaperonem proteinu 60 tepelného šoku reguluje jeho připojení k histonu 2B v plazmatické membráně T lymfocytů". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (18): 10425–30. doi:10.1073 / pnas.95.18.10425. PMC 27910. PMID 9724719.
Becker W, Weber Y, Wetzel K a kol. (1998). „Sekvenční charakteristiky, subcelulární lokalizace a substrátová specificita kináz souvisejících s DYRK, nová rodina proteinových kináz dvojí specificity“. J. Biol. Chem. 273 (40): 25893–902. doi:10.1074 / jbc.273.40.25893. PMID 9748265.
Allen MP, Zeng C, Schneider K a kol. (1999). „Signalizace genu specifického pro růst 6 (Gas6) / adheze související s kinázou (Ark) podporuje přežití neuronů uvolňujících gonadotropin prostřednictvím extracelulární signálně regulované kinázy (ERK) a Akt“. Mol. Endokrinol. 13 (2): 191–201. doi:10.1210 / me.13.2.191. PMID 9973250.
Piredda L, Farrace MG, Lo Bello M a kol. (1999). „Identifikace„ tkáňových “proteinů vázajících transglutaminázu v nervových buňkách spáchaných na apoptózu“. FASEB J.. 13 (2): 355–64. doi:10.1096 / fasebj.13.2.355. PMID 9973324.
Carrier F, Georgel PT, Pourquier P a kol. (1999). „Gadd45, stresový protein reagující na p53, upravuje dostupnost DNA na poškozeném chromatinu“. Mol. Buňka. Biol. 19 (3): 1673–85. doi:10.1128 / MCB.19.3.1673. PMC 83961. PMID 10022855.
Kawasaki H, Schiltz L, Chiu R a kol. (2000). „ATF-2 má vnitřní aktivitu histon-acetyltransferázy, která je modulována fosforylací“. Příroda. 405 (6783): 195–200. doi:10.1038/35012097. PMID 10821277.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Baake M, Doenecke D, Albig W (2001). "Charakterizace jaderných lokalizačních signálů čtyř histonů lidského jádra". J. Cell. Biochem. 81 (2): 333–46. doi:10.1002 / 1097-4644 (20010501) 81: 2 <333 :: AID-JCB1048> 3.0.CO; 2-D. PMID 11241673.
Chadwick BP, Willard HF (2001). „Nový chromatinový protein, který je vzdáleně příbuzný histonu H2a, je z neaktivního X chromozomu značně vyloučen“. J. Cell Biol. 152 (2): 375–84. doi:10.1083 / jcb.152.2.375. PMC 2199617. PMID 11266453.
Freire J, Covelo G, Sarandeses C a kol. (2001). "Identifikace nukleárních importů a regulačních proteinů buněčného cyklu, které se vážou na prothymosin alfa". Biochem. Cell Biol. 79 (2): 123–31. doi:10.1139 / bcb-79-2-123. PMID 11310559.
Nemergut ME, Mizzen CA, Stukenberg T a kol. (2001). "Chromatinové dokování a zvýšení aktivity výměny RCC1 histony H2A a H2B". Věda. 292 (5521): 1540–3. doi:10.1126 / science.292.5521.1540. PMID 11375490.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q16778 (Histon H2B typ 2-E) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184678 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1469070-3] Collart D, Romain PL, Huebner K, Pockwinse S, Pilapil S, Cannizzaro LA, Lian JB, Croce CM, Stein JL, Stein GS (leden 1993). „Gen varianty lidského histonu H2B.1, umístěný na chromozomu 1, využívá alternativní 3 'konec zpracování“. J Cell Biochem. 50 (4): 374–85. doi:10.1002 / jcb.240500406. PMID 1469070.

[pmid12408966-4] Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: HIST2H2BE histon cluster 2, H2be“.

[Rotondo_2015-6] A ^b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). "Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů". J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID 25205602.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]