Motiv GyrA RNA - GyrA RNA motif - Wikipedia
| gyrA RNA motiv | |
|---|---|
 Konsensuální sekundární struktura gyrA RNA | |
| Identifikátory | |
| Symbol | gyrA RNA |
| Rfam | RF01740 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Cis-regulační prvek |
| Domény | Pseudomonadales |
| PDB struktur | PDBe |
The gyrA RNA motiv je konzervovaný RNA struktura identifikována bioinformatika.[1] RNA jsou přítomny v mnoha druzích bakterií uvnitř objednat Pseudomonadales. Tato objednávka obsahuje rod Pseudomonas, který zahrnuje oportunistický lidský patogen Pseudomonas aeruginosa a Pseudomonas syringae, rostlinný patogen.
gyrA RNA se vždy nacházejí v předpokládaných 5 'nepřekládané oblasti z gyrA geny, které kódují a protein tvoří podjednotku a DNA gyráza. Odolnost vůči antibiotiku ciprofloxacin v Pseudomonas je často dosaženo prostřednictvím mutace v gyrA gen.[2] Díky svému umístění je gyrA Předpokládalo se, že motiv RNA je a cis-regulační prvek jednající proti proudu gyrA geny. Nicméně, gyrA byl dříve považován za gen, jehož úroveň exprese je konzistentní v široké škále růstových podmínek.[3]
Reference
- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J a kol. (Březen 2010). „Srovnávací genomika odhaluje 104 kandidátských strukturovaných RNA z bakterií, archea a jejich metagenomů“. Genome Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
- ^ Bonomo RA, Szabo D (září 2006). "Mechanismy multilékové rezistence u druhů Acinetobacter a Pseudomonas aeruginosa". Clin. Infikovat. Dis. 43 Suppl 2: S49–56. doi:10.1086/504477. PMID 16894515.
- ^ Vencato M, Tian F, Alfano JR a kol. (Listopad 2006). „Bioinformatická identifikace regulonu HrpL a efektorových proteinů sekrečního systému typu III Pseudomonas syringae pv. Phaseolicola 1448A“. Mol. Interakce rostlinných mikrobů. 19 (11): 1193–1206. doi:10.1094 / MPMI-19-1193. PMID 17073302.
externí odkazy
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |