Globodera ellingtonae - Globodera ellingtonae

Globodera ellingtonae
Vědecká klasifikace
Království:
Animalia
Kmen:
Nematoda
Třída:
Secernentea
Objednat:
Tylenchida
Rodina:
Hederoderidae
Rod:
Globodera
Druh:
G. ellingtonae
Binomické jméno
Globodera ellingtonae

Globodera ellingtonae je jedním z háďátek bramborových cyst a v USA byl nedávno uznán jako nový druh. To vyvolalo karanténu polí, kde byla izolována, aby se zabránilo šíření tohoto hlístice na další pole.[1]

Historie a význam

Globodera ellingtonae byl izolován v roce 2008 z pole poblíž Powell Butte v Oregonu a ze dvou polí v Idahu. Po podrobném morfologickém a molekulárním srovnání s G. pallida a G. rostochiensis, G. ellintonae byl popsán jako nový druh.[2]

Aby se zabránilo šíření tohoto nového druhu, byla zavedena karanténní omezení. Omezení určují, jak je půda využívána, aby se půda nepřemisťovala pomocí zemědělských strojů nebo strojů na zpracování půdy na nová místa.[1]

Rozdělení

Idaho a Oregon, USA[2]

Dějiny

V roce 2008 byla z Oregonu a Idaho izolována nová a odlišná cystotvorná háďátka bramborová. Napadená půda byla shromážděna z výzkumné farmy poblíž Powell Butte v Oregonu a ze dvou polí pěstitelů v Idahu. Pole v Powell Butt mělo historii oříznutí, která zahrnovala brambory, pšenici a další plodiny. Má také historii problémů s plevelem.[2]

Izoláty byly charakterizovány jak morfologicky, tak molekulárně. K provedení morfologické charakterizace byly cysty odebrány ze vzorků půdy, mladiství byli vylíhnuti z cyst a vzorky byly fixovány, měřeny a fotografovány Stantarem a kol.[2] Po dokončení všech fyzikálních měření mladistvých a cyst se nové druhy hlístic lišily od G. pallida a G. rostochiensis kvůli zúžení na ocasech J2, vzoru hřebenů na cystách a počtu hřebenů mezi vulvou a anální oblastí, délce styletu a spikulách.[3]

Molekulární charakterizace byla provedena několika molekulárními metodami, které zahrnují sekvenčně specifické multiplexní PCR, PCR-RFLP sekvencí ITS1 a - rDNA. DNA byla purifikována, amplifikována a produkty PCR klonovány.[2]

Izoláty použité pro molekulární srovnání jsou uvedeny a sestávají z izolátů shromážděných po celém světě. Nová populace hlístic byla srovnávána s G. rostochiensis, G. pallida, G. tabacum, a G. mexicanaAnalýza SVÉ Sekvence rDNA ukazují, že Globodera populace izolovaná z Oregonu a Idaho je v jiné skupině než G. rostochiensis a G. pallida. The Globodera sp. spadal do stejné skupiny jako G. ellingtonae izoláty z Antofagasta Chile. Kvůli nedostatku morfologických měření izolátů z Jižní Ameriky, které by se hodily k molekulárním výsledkům izolátů z USA, chybí taxonomická charakterizace tohoto srovnání.[2]

V roce 2017 byla genomová sekvence pro G. ellingtonae byl publikován.[4]

Regulační omezení

Kvůli karanténním omezením uloženým na jakýkoli nový patogen G. ellingtonae, byl omezen na pole v Oregonu a na dvě pěstitelská pole v Idaho. G. ellingtonae je omezeným patogenem kvůli jeho počátečnímu zavedení do USA. Zavlečené patogeny podléhají přísným regulačním podmínkám, které zabraňují šíření hlístice na nová pole. APHIS vzorkoval 300 000 dalších polí v Idaho a 100 000 polí v jiných státech a žádné další G. ellingtonae byly nalezeny cysty.[3]

Životní cyklus

[5]

Globodera druhy jsou stěhovavé poloendoparazity.[6] Hlístice začíná jako vejce a vylíhne do 2. stupně pro mladistvé. Samice se přesouvají ke kořenům a vytvářejí místo krmení, zatímco samci se nekrmí. Když jsou pohlavně dospělí po 4. líni, samci oplodňují samici, což má za následek vajíčka a vývoj cysty.[5] V závislosti na teplotě je životní cyklus dokončen za 38 až 48 dní. Cysty mohou zůstat životaschopné po dobu 30 let.[1]

Vztah hostitelských parazitů

[6]

  • Brambor
  • Klokan Apple
  • Evropská hořce sladká
  • Tomato - rajče, rajče rybízu
  • Blín
  • Jimson weed (Ďáblova trubka)
  • Husí noha
  • Východní černý lilek
  • Společný Snapdragon
  • Quinoa
  • Malovaný jazyk
  • Šťovík dřevěný
  • Morelle
  • Pepino
  • Lilek
  • Koňská kopřiva
  • Sunberry

Řízení

Z důvodu regulovaného stavu G. ellingtonae země, kde byl hlístice nalezen, je v karanténě, aby se zabránilo dalšímu šíření.[1]

Vědci se dívají na pasti plodiny jako lepkavý hnízdo, Solanum sisymbriifolium v Evropě. Pasti plodiny produkují sloučeniny násadových vajec, které způsobují líhnutí vajec, ale nedělají dobré hostitele a mladiství nejsou schopni zřídit místo krmení. To má za následek pokles inokula vajíčka v půdě.[1]

Dalším způsobem, jak využít tento výzkum, je syntetická produkce sloučenin produkovaných pastí. Bylo identifikováno až 10 různých sloučenin, které přispívají k faktoru líhnutí vajec. Pokud lze tyto sloučeniny produkovat a dodávat na zamořená pole, přispělo by to k vyčerpání vajíček hlístic cyst.[1]

Reference

  1. ^ A b C d E F [1]
  2. ^ A b C d E F Skantar, A.M., Handoo, Z. A., Zasada, I.A., Inghram, R.E., Carta, L.K. a Chitwood, D.J. 2011. Morfologická a molekulární charakterizace Globodera populace z Oregonu a Idaho. Phytopathology 101: 480-491.
  3. ^ A b Handoo, Z.A., Carta, L.K., Skantar, A.M., Chitwood, D.J. 2012. Popis Globodera ellingtonae n. sp. (Nematoda: Heteroderidae) z Oregonu. J. Nematology 44: 40-57.
  4. ^ Phillips, W.S., * a kol. * 2017. Návrh genomu * Globodera ellingtonae *, Journal of Nematology 49 (2) 127-128.
  5. ^ A b [2]
  6. ^ A b [3]