Glauco Tocchini-Valentini - Glauco Tocchini-Valentini

Glauco P. Tocchini-Valentini je italský molekulární biolog. Od roku 2009 byl zvolen jako zahraniční spolupracovník Národní akademie věd, přidružený k Národní rada pro výzkum v Itálii (CNR).[1] Za čtyřicet a více let v molekulární biologii publikoval více než 140 článků o podobných tématech mutageneze, Molekuly RNA, struktura, funkce a evoluce, modely nemocí, neurodegenerativní choroby a kognitivní poruchy.[1] V současné době žije v Římě jako ředitel Ústavu buněčné biologie. Je také koordinátorem European Mouse Mutant Archive, známého také jako EMMA.[2] V současné době se aktivně zasazuje o rozvoj infrastruktury pro vědecké budovy v celé Evropě.

raný život a vzdělávání

Tocchini-Valentini absolvoval University Rome La Sapienza v roce 1959 se zajímal o výrobu speciálních fosfátů za účelem syntézy RNA. Sledoval své zájmy na Technologický institut v Karlsruhe v německém Karlsruhe, kde se stal radiobiologem v jejich Radiologickém ústavu.[3] Na konci svého studia pokračoval Tocchini-Valentini ve výuce na University of Chicago, kde publikoval řadu článků o asymetrické transkripci ve spolupráci s Francem Graziosi, Peterem Geiduschekem, Robertem Haselkornem a Samem Geisem. Po odchodu z University of Chicago v roce 1996 se vrátil do Itálie, kde je v současné době přidružen k Národní rada pro výzkum v Itálii.

Zájmy výzkumu

Raný výzkum Glauco Tocchini-Valentini se zaměřil na demonstraci genetické transkripce jako asymetrického procesu.[4] Jeho publikace o nálezech asymetrické syntézy RNA in vitro dospěli k závěru, že syntéza mRNA a rRNA je asymetrická, zatímco DNA poskytla symetrickou syntézu.[5] Odtamtud pomáhal při izolaci, charakterizaci a objevování několika enzymů zapojených do procesu transkripce, jako jsou DNA a RNA polymerázy, rDNA cistrony a Typell DNA topoizomeráza.[6][7][8] Hodně z jeho práce bylo charakterizováno použitím různých Xenopus laevis buněčné typy, včetně oocytů, neoplodněných vajíček a ledvinových buněk; charakteristiky těchto obojživelných buněk a jejich enzymů byly příbuzné savčím buňkám a jejich příslušným enzymům.[6]

Tocchini-Valentini také přispěl k současnému porozumění pravidlům enzym-substrát, vycházející z jeho publikace on RNáza P a endonukleáza z buněčných typů Xenopus laevis.[9][10] Charakterizoval tRNA endonukleázy Archea a našel tři formy endonukleázy tRNA.[11] Jeho současným výzkumným zaměřením je použití archaeal endonukleázy (MJ-EndA) k řízení sestřihu jak u živých myší, tak u myší linií.[12] Tato nově vznikající technologie, která může provádět jak cis-, tak trans-sestřih, umožňuje zavedení poruch na úrovni RNA, což umožňuje specifičtější cílení v mRNA i v jiných RNA.[12] V poslední době se jeho výzkum zaměřuje na zlepšení fenotypizačních dat pomocí „soft windowing“. které používají adaptivní okna času k zahrnutí určitých ovládacích prvků, což vede k lepší analýze malých variací v experimentech.[13] Podílí se také na projektu Deep Genome Project, který se zaměřuje na sekvenování všech analogických genů u myší jako lidí, aby lépe porozuměl modelům a mechanismům onemocnění.[14] Prostřednictvím screeningu fenotypů těchto myší byly identifikovány genetické složky metabolismu a sluchové dysfunkce.[15][16]

Patenty

Společnost Tocchini-Valentini podala několik patentů týkajících se štěpení a rekombinace RNA.[17] Následující dva byly schváleny Úřad pro patenty a ochranné známky Spojených států (USPTO): metoda štěpení RNA a metoda štěpení a rekombinace RNA.

V roce 2003 metoda štěpení RNA[18] nejprve vystaví cílovou molekulu (neobsahuje strukturu tRNA[19]) na eukaryotickou tRNA sestřihovou endonukleázu. To dává molekulu do konformace boule-spirála-boule,[20] a v této formaci dochází ke štěpení, což vede k produktům štěpení. K štěpné reakci může dojít obojí in vitro a in vivoa používá se hlavně k prokázání přítomnosti specifických RNA ve vzorcích. Použitím přenos fluorescenční rezonanční energie (FRET) může být cílová molekula značena a po štěpení oligonukleotidu by byla měřena fluorescence.

V pokračování tohoto předchozího patentu podal v roce 2004 následný patent, který byl schválen 20. srpna 2013.[21] Jak bylo popsáno výše, molekula RNA je štěpena v boule boule-šroubovice. Protože cílová molekula RNA a exogenní molekula RNA jsou ošetřeny správnou ligázou, tvoří se chiméry RNA.[22][23] To má za následek rekombinaci cílové RNA a exogenní RNA napříč strukturou boule-spirála-boule, takže tato metoda může být také použita pro rekombinaci molekul RNA, aby se změnila funkce RNA a tím i genová exprese.[24]

Ceny a vyznamenání

Tocchini-Valentini byl oceněn cenou San Giacomo Della Marca v roce 2007. Cena San Giacomo della Marca se uděluje vážené osobě pocházející z oblasti Marche.[25]

Reference

  1. ^ A b "Členský adresář". Národní akademie věd. Citováno 4. dubna 2020.
  2. ^ Tocchini-Valentini, Glauco (11. – 13. Listopadu 2014). „EMMA - INFRAFRONTIER - IMPC Monterotondo Mouse Clinic (MMC)“. Výroční zasedání IMPC, Barcelona. PLAKÁT.
  3. ^ Tocchini-Valentini, Glauco. Osobní dopis. https://www.lucacavallisforza.com/wp-content/uploads/2019/09/Memory-Glauco-Tocchini-Valentini.pdf
  4. ^ Geiduschek, E. Peter; Tocchini-Valentini, Glauco P .; Sarnat, Marlene T. (srpen 1964). „Asymetrická syntéza RNA in vitro: závislost kontinuity a konformace DNA“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 52 (2): 486–493. Bibcode:1964PNAS ... 52..486G. doi:10.1073 / pnas.52.2.486. ISSN  0027-8424. PMC  300303. PMID  14206614.
  5. ^ Colvill, A. J .; Kanner, L. C .; Tocchini-Valentini, G. P .; Sarnat, M. T .; Geiduschek, E. P. (květen 1965). "Asymetrická syntéza RNA in vitro: heterologní systémy DNA-enzymy; RNA polymeráza E. coli". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 53 (5): 1140–1147. Bibcode:1965PNAS ... 53.1140C. doi:10.1073 / pnas.53.5.1140. ISSN  0027-8424. PMC  301385. PMID  4958034.
  6. ^ A b Tatò, F .; Gandini, D. A .; Tocchini-Valentini, G. P. (září 1974). "Hlavní DNA polymerázy společné pro různé typy buněk Xenopus laevis". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 71 (9): 3706–3710. Bibcode:1974PNAS ... 71.3706T. doi:10.1073 / pnas.71.9.3706. ISSN  0027-8424. PMC  433845. PMID  4530330.
  7. ^ Mattoccia, E .; Baldi, M. I .; Carrara, G .; Fruscoloni, P .; Benedetti, P .; Tocchini-Valentini, G. P. (listopad 1979). "Separace transkripce RNA a aktivity zpracování z germinálních váčků X. laevis". Buňka. 18 (3): 643–648. doi:10.1016/0092-8674(79)90119-3. ISSN  0092-8674. PMID  519751. S2CID  42075603.
  8. ^ Crippa, M .; Tocchini-Valentini, G. P. (1970-06-27). "Výkon bakteriálního faktoru RNA polymerázy v obojživelném oocytu". Příroda. 226 (5252): 1243–1244. Bibcode:1970Natur.226.1243C. doi:10.1038 / 2261243a0. ISSN  0028-0836. PMID  4912321. S2CID  4251098.
  9. ^ Carrara, G .; Calandra, P .; Fruscoloni, P .; Tocchini-Valentini, G. P. (1995-03-28). „Dvě šroubovice plus linker: malý modelový substrát pro eukaryotickou RNázu P“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (7): 2627–2631. Bibcode:1995PNAS ... 92.2627C. doi:10.1073 / pnas.92.7.2627. ISSN  0027-8424. PMC  42271. PMID  7708695.
  10. ^ Doria, M .; Carrara, G .; Calandra, P .; Tocchini-Valentini, G. P. (1991-05-11). „Molekula RNA kopurifikuje s aktivitou RNázy P z oocytů Xenopus laevis“. Výzkum nukleových kyselin. 19 (9): 2315–2320. doi:10.1093 / nar / 19.9.2315. ISSN  0305-1048. PMC  329436. PMID  1710353.
  11. ^ Tocchini-Valentini, Giuseppe D .; Fruscoloni, Paolo; Tocchini-Valentini, Glauco P. (2005-06-21). „Struktura, funkce a evoluce tRNA endonukleáz Archea: příklad subfunkcionalizace“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (25): 8933–8938. Bibcode:2005PNAS..102,8933T. doi:10.1073 / pnas.0502350102. ISSN  0027-8424. PMC  1157037. PMID  15937113.
  12. ^ A b Putti, Sabrina; Calandra, Patrizia; Rossi, Nicoletta; Scarabino, Daniela; Deidda, Giancarlo; Tocchini-Valentini, Glauco P. (září 2013). "Vysoce účinná, in vivo optimalizovaná, archaální endonukleáza pro řízené sestřih RNA v buňkách savců". FASEB Journal. 27 (9): 3466–3477. doi:10.1096 / fj.13-231993. ISSN  1530-6860. PMID  23682120.
  13. ^ Haselimashhadi, Hamed; Mason, Jeremy C .; Munoz-Fuentes, Violeta; López-Gómez, Federico; Babalola, Kolawole; Acar, Elif F .; Kumar, Vivek; Bílá, Jacqui; Flenniken, Ann M .; King, Ruairidh; Straiton, Ewan (2020-03-01). „Soft windowing application to improve analysis of high-throughput fenotyping data“. Bioinformatika (Oxford, Anglie). 36 (5): 1492–1500. doi:10.1093 / bioinformatika / btz744. ISSN  1367-4811. PMC  7115897. PMID  31591642.
  14. ^ Lloyd, K. & Adams, David & Baynam, Gareth & Beaudet, Arthur & Bosch, Fatima & Boycott, Kym & Braun, Robert & Caulfield, Mark & ​​Cohn, Ronald & Dickinson, Mary & Dobbie, Michael & Flenniken, Ann & Flicek , Paul & Galande, Sanjeev & Gao, Xiang & Grobler, Anne & Heaney, Jason & Herault, Yann & Angelis, Martin & Brown, Steve. (2020). Projekt Deep Genome. Genome Biology. 21. 18. 10.1186 / s13059-020-1931-9.
  15. ^ Bowl, Michael R .; Simon, Michelle M .; Ingham, Neil J .; Greenaway, Simon; Santos, Luis; Cater, Heather; Taylor, Sarah; Mason, Jeremy; Kurbatova, Natalja; Pearson, Selina; Bower, Lynette R. (12. října 2017). „Rozsáhlá obrazovka ztráty sluchu odhaluje rozsáhlé neprozkoumané genetické prostředí sluchové dysfunkce“. Příroda komunikace. 8 (1): 886. Bibcode:2017NatCo ... 8..886B. doi:10.1038 / s41467-017-00595-4. ISSN  2041-1723. PMC  5638796. PMID  29026089.
  16. ^ Rozman, Jan; Rathkolb, Birgit; Oestereicher, Manuela A .; Schütt, Christine; Ravindranath, Aakash Chavan; Leuchtenberger, Stefanie; Sharma, Sapna; Kistler, Martin; Willershäuser, Monja; Brommage, Robert; Meehan, Terrence F. (18. ledna 2018). "Identifikace genetických prvků v metabolismu pomocí vysoce výkonného fenotypování myší". Příroda komunikace. 9 (1): 288. Bibcode:2018NatCo ... 9..288R. doi:10.1038 / s41467-017-01995-2. ISSN  2041-1723. PMC  5773596. PMID  29348434.
  17. ^ „Patenty vynálezce Glauco P. Tocchini-Valentini“. Spravedlnost. 20. srpna 2013. Citováno 18. dubna 2020.
  18. ^ Číslo publikace: 20040023239 Typ: Aplikace Podáno: 7. ledna 2003 Datum publikace: 5. února 2004 Vynálezci: Glauco P. Tocchini-Valentini (Řím), Giancarlo Deidda (Řím), Nicoletta Rossi (Řím), Maria Irene Baldi (Řím) , Paolo Fruscoloni (Řím) Číslo žádosti: 10296574
  19. ^ Bufardeci, E., Fabbri, S., Baldi, MI, Mattoccia, E. a Tocchini-Valentini, GP, „in vitro genetická analýza strukturních rysů pre-tRNA potřebných pro stanovení místa 3 'sestřihu v intronová excizní reakce, “EMBO J. 12: 46974704 (1993).
  20. ^ Gandini-Attardi, D., Margarit, I. a Tocchini-Valentini, GP, „Strukturální alterace v mutantních prekurzorech genu tRNALeu3 kvasinek, které se chovají jako defektní substráty vysoce purifikované sestřihové endoribonukleázy,“ EMBO J. 4: 3289-3297 (1985).
  21. ^ „Patent USA na metodu štěpení a rekombinace RNA (patent č. 8 512 945 vydaný 20. srpna 2013) - Justia Patents Search“. patents.justia.com. Citováno 2020-04-19.
  22. ^ Perkins, K. K., Furneaux, H. a Hurwitz, J., „Izolace a charakterizace RNA ligázy z buněk HeLa“ Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:684-688 (1985).
  23. ^ Mattoccia, E., Baldi, M. I., Gandini-Attardi, D., Ciafrè, S. a Tocchini-Valentini, G. P., „Výběr místa pomocí tRNA sestřihové endonukleázy Xenopus laevis, “buňka 55:731-738 (1988)
  24. ^ Číslo patentu: 8512945 Typ: Grant Podáno: 9. dubna 2004 Datum patentu: 20. srpna 2013 Číslo zveřejnění patentu: 20050043259 Vynálezci: Glauco P. Tocchini-Valentini (Řím), Giancarlo Deidda (Řím), Nicoletta Rossi (Řím) Primární Zkoušející: Číslo přihlášky Dana Shin: 10/821 777
  25. ^ Ferrazzoli, Marco (11. listopadu 2001). „Sarnano: a Glauco Tocchini Valentini il Premio San Giacomo della Marca“. Vivere Marche. Citováno 8. března, 2020.