Databáze lidského genomu GDB - GDB Human Genome Database
Obsah | |
---|---|
Typy dat zajat | Genetická mapovací data |
Organismy | Homo sapiens |
Kontakt | |
Výzkumné centrum | |
Primární citace | PMID 2041809 |
Datum vydání | 1989 |
The Databáze lidského genomu GDB byla komunitou vybraná sbírka lidí genomický data. Byla to databáze klíčů v Projekt lidského genomu[1][2] a byl v provozu od roku 1989 do roku 2008.
Dějiny
V roce 1989 Howard Hughes Medical Institute poskytl finanční prostředky na zřízení centrálního úložiště pro člověka genetické mapování data. Tento projekt nakonec vyústil v vytvoření GDB Human Genome DataBase v září 1990.[3][4] Za účelem zajištění vysokého stupně kvality byly záznamy v GDB podrobeny procesu kurace odborníky na lidskou genetiku, včetně Výbor pro genovou nomenklaturu HUGO.[5]
Založeno pod vedením Petera Pearsona a Dicka Luciera,[6] GDB obdržela finanční podporu od Americké ministerstvo energetiky a Národní institut zdraví.[3] Nachází se na Lékařská fakulta Johns Hopkins University GDB se stal zdrojem vysoce kvalitních mapových dat, která byla zpřístupněna jak online, tak prostřednictvím řady tištěných publikací.[Citace je zapotřebí ] Projekt byl mezinárodně podporován EU, Japonskem a dalšími zeměmi.
GDB měl ve své době několik ředitelů. Peter Pearson, David T. Kingsbury, Stantley Letovsky, Peter Li a A. Jamie Cuticchia.[Citace je zapotřebí ]
V roce 1998 změna zaměření projektu lidského genomu přesměrovala finanční prostředky amerického ministerstva energetiky, které byly dříve k dispozici pro GDB.[7] Ten stejný rok však A. Jamie Cuticchia získala financování z kanadských veřejných a soukromých zdrojů, aby mohla pokračovat v činnosti GDB. Zatímco data curation pokračovala v Johns Hopkins, centrální operace GDB byly přesunuty do The Hospital for Sick Children (HSC) v Torontu v Ontariu v Kanadě.[8] V listopadu 2001 vypustila HSC Cuticchia kvůli sporu o název domény webové stránky GDB.[7]
V roce 2003 RTI International se stal novým hostitelem pro GDB, kde byl nadále udržován jako veřejný zdroj;[9] GDB byla uzavřena v roce 2008 poté, co se kontrola nad projektem vrátila Johns Hopkins.[10]
Reference
- ^ „Zprávy o lidském genomu, září – prosinec 1995: 7 (3-4): 15“. web.ornl.gov.
- ^ Guyer, M. S .; Collins, F. S. (21. listopadu 1995). „Jak je na tom Projekt lidského genomu a co jsme se zatím naučili?“. Sborník Národní akademie věd. 92 (24): 10841–10848. doi:10.1073 / pnas.92.24.10841.
- ^ A b Cuticchia, A.Jamie; Fasman, Kenneth H .; Kingsbury, David T .; Robbins, Robert J .; Pearson, Peter L. (1993). „Databáze lidského genomu GDB TM anno 1993“. Výzkum nukleových kyselin. 21 (13): 3003–3006. doi:10.1093 / nar / 21.13.3003. PMC 309725.
- ^ Cuticchia, A.J. (27. prosince 1999). "Budoucí vize databáze lidského genomu GDB". Lidská mutace. 15 (1): 62–67. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200001) 15: 1 <62 :: AID-HUMU13> 3.0.CO; 2-R. PMID 10612824.
- ^ Letovsky, S. (1. ledna 1998). „GDB: databáze lidského genomu“. Výzkum nukleových kyselin. 26 (1): 94–99. doi:10.1093 / nar / 26.1.94.
- ^ Pearson, P.L. (25. dubna 1991). „Databáze genomu (GDB) - repozitář mapování lidského genu“. Výzkum nukleových kyselin. 19 (doplněk): 2237–2239. doi:10.1093 / nar / 19.suppl.2237. PMC 331357.
- ^ A b Bonetta, Laura (listopad 2001). „Pytláctví nechává genovou databázi zmítat“. Příroda. 414 (6862): 384–384. doi:10.1038/35106703.
- ^ „Human Genome News Vol.10, No.1-2, February 1999“. web.ornl.gov. Citováno 3. září 2020.
- ^ Seewald, A.K. (2004). „Hodnocení pro BioMinT: vyšetřování výkonu, místní vyhledávání a rozpoznávání homonymie“. Sborník ze sympozia o průzkumu znalostí v informatice o přírodních vědách (KELSI 2004).
- ^ Galperin, M. Y .; Cochrane, G. R. (1. ledna 2009). „Výroční vydání databáze Nucleic Acids Research a online kolekce databází molekulární biologie NAR v roce 2009“. Výzkum nukleových kyselin. 37 (Databáze): D1 – D4. doi:10.1093 / nar / gkn942.
externí odkazy
- https://web.archive.org/web/19970605132915/http://www.gdb.org/ archivovaná verze webu GDB (1997)