Fibrobacter succinogenes - Fibrobacter succinogenes

Fibrobakterie
Vědecká klasifikace
Doména:
Bakterie
Kmen:
Fibrobakterie
Třída:
Fibrobakterie
Objednat:
Fibrobacterales
Rodina:
Fibrobacteraceae
Rod:
Fibrobacter
Druh:
F. succinogenes
Binomické jméno
Fibrobacter succinogenes
(Hungate, 1950) Montgomery a kol., 1988
Poddruh
Synonyma
  • Bacteroides succinogenes Hungate, 1950
  • Ruminobacter succinogenes (Hungate, 1950) Prevot, 1966

Fibrobacter succinogenes je celulolytikum bakterie druhy rodu Fibrobacter. Je přítomen v bachor skotu. Beta glukany jsou jeho substrátem volby v bachoru a mezi jeho produkty po trávení patří mravenčan, octan a sukcinát. Fibrobacter succinogenes tvoří charakteristické rozsáhlé rýhy v krystalický celulóza, a je také poměrně snadno oddělena od svého substrátu během přípravy vzorku.[1]

Úzký vztah Fibrobacter succinogenes na Bacteroidetes a Chlorobi phyla

Fylogenetické studie založené na proteinových sekvencích RpoC a Gyrase B to naznačují Fibrobacter succinogenes úzce souvisí s druhem z kmene Bacteroidetes a Chlorobi.[2] Fibrobacter succinogenes a druhy z těchto dvou dalších kmenů se také větví ve stejné poloze na základě konzervovaných signálních indelů v řadě důležitých proteinů.[3] A konečně a co je nejdůležitější, srovnávací genomové studie identifikovaly dva konzervované signální indexy (inzert 5-7 aminokyselin v proteinu RpoC a inzerce aminokyseliny 13-16 v serin hydroxymethyltransferáza ) a jeden podpisový protein (PG00081), který jedinečně sdílí Fibrobacter succinogenes a všechny druhy z Bacteroidetes a Chlorobi phyla.[4] Všechny tyto výsledky poskytují přesvědčivý důkaz Fibrobacter succinogenes sdílel (a) společného předka s Bacteroidetes a Chlorobi druhy bez všech ostatních bakterií a tyto druhy by měly být uznány jako součást jediné Superphylum „FCB“.[2][4]

Viz také

Reference

  1. ^ Palmquist, D.L. (1995). "Stravitelnost bavlněných vláken a celých olejnatých semen bachorovými mikroorganismy". Věda a technologie pro krmení zvířat. 56 (3–4): 231–42. doi:10.1016/0377-8401(95)00830-6.
  2. ^ A b Gupta RS (2008). "Fylogeneze a charakteristiky signálních sekvencí Fibrobacteres, Chlorobi a Bacteroidetes". Kritické recenze v mikrobiologii. 30 (2): 123–43. doi:10.1080/10408410490435133. PMID  15239383.
  3. ^ Griffiths E, Gupta RS (září 2001). „Použití signálních sekvencí v různých proteinech k určení relativního pořadí větvení bakteriálních dělení: důkazy, že se Fibrobacter odchýlil ve stejnou dobu jako Chlamydia a divize Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides.“. Mikrobiologie. 147 (Pt 9): 2611–22. doi:10.1099/00221287-147-9-2611. PMID  11535801.
  4. ^ A b Gupta RS, Lorenzini E (květen 2007). „Fylogeneze a molekulární podpisy (konzervované proteiny a indely), které jsou specifické pro druhy Bacteroidetes a Chlorobi“. BMC Evoluční biologie. 7: 71. doi:10.1186/1471-2148-7-71. PMC  1887533. PMID  17488508.

externí odkazy