Ff fágy - Ff phages - Wikipedia

Inovirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Monodnaviria
Království:Loebvirae
Kmen:Hofneiviricota
Třída:Faserviricetes
Objednat:Tubulavirales
Rodina:Inoviridae
Rod:Inovirus

The Ff fágy jsou vláknité fágy, které infikují Gramnegativní bakterie nesoucí F epizoda.[1] Tento termín se používá k označení úzce souvisejících[2] skupina fágů včetně f1, fd a Fágy M13. The Pokud1 a Ike fág[3] s touto skupinou také úzce souvisí.

Tyto fágy procházejí a nelytický životní cyklus, ve kterém infikované bakterie nejsou zabíjeny, ale kontinuálně uvolňují virové částice. To je na rozdíl od lytický a lysogenní cykly jiných fágů, kde je hostitel zabit při uvolnění virionů. Fágy Ff mají kruhový genom ssDNA zabalený v několika tisících kopií hlavního obalového proteinu, čímž se získá virová částice ve tvaru tyčinky, která je na obou koncích uzavřena dvěma různými sadami proteinů. Pouze jeden konec se váže na F pilus a může injikovat DNA do hostitelské buňky.

Životní cyklus

Adsorpce a infekce

Ff fágy vyžadují, aby hostitelská buňka byla Hfr nebo F +. Když se virion váže na sex pilus hostitele proteinem 3 na svém zesíleném konci, pilus se stáhne a virus se spojí s hostitelskou membránou. V tomto kroku je zapojeno několik hostitelských proteinů a genom viru se uvolňuje do bakteriální cytoplazmy.

Časný životní cyklus a údržba plazmidů

Jednořetězcová DNA viru je hostitelským mechanismem přeměněna na dvouřetězcovou DNA. Tato forma se nazývá replikativní forma (RF). Vlákno, které pochází z viru (VS), je označeno virovým proteinem p2 (pII).[4] Replikační stroj hostitelské DNA poté replikuje VS ve formě replikace v rotujícím kruhu prodloužením 3 'konce zářezu a vytlačením 5' konce jako jediného řetězce. P2 odřízne vlákno pokaždé, když jeho prodloužení dokončí celý kruh a liguje jednovláknovou kopii do kruhu.[4] Tyto kruhy ssDNA se převádějí na dsDNA jako původní virový genom a RF se hromadí v buňce. RF jsou transkribovány a virové proteiny se hromadí. RF jsou předávány na neurčito do dceřiných buněk jako plazmidy.

Balení DNA a uvolňování viru

Když se vytvoří dostatečné kopie RF a virového proteinu p5 (pV / g5p), dostanou se nové virové genomy ssDNA pomocí p5 interakcí se specifickou sekvencí na DNA, která se nazývá pakovací signál. Tím se zabrání jeho převodu na dsDNA. Interakce mezi DNA a p5 je slabá, s výjimkou balicího signálu. Komplex p5-DNA se váže na komplex virových a hostitelských proteinů na membráně. Když je DNA zbavena p5, je extrudována přes membránu a zabalena do spirálového pouzdra p8.

Viz také

Vláknitý bakteriofág

Reference

  1. ^ Rašple, já; E. Oberer (prosinec 1986). "Ff coliphages: strukturální a funkční vztahy". Mikrobiologické recenze. 50 (4): 401–427. ISSN  0146-0749. PMC  373080. PMID  3540571.
  2. ^ Rohwer, les; Rob Edwards (15. 8. 2002). „Fágový proteomický strom: taxonomie fága založená na genomu“. Journal of Bacteriology. 184 (16): 4529–4535. doi:10.1128 / JB.184.16.4529-4535.2002. ISSN  0021-9193. PMC  135240. PMID  12142423.
  3. ^ Peeters, Ben P.H .; Rik M. Peters; John G.G. Schoenmakers; Ruud N.H. Konings (05.01.1985). „Nukleotidová sekvence a genetická organizace genomu N-specifického vláknitého bakteriofága IKe: Srovnání s genomem F-specifických vláknitých fágů M13, fd a f1“. Journal of Molecular Biology. 181 (1): 27–39. doi:10.1016/0022-2836(85)90322-5. ISSN  0022-2836. PMID  3981635.
  4. ^ A b Peeters, Ben P. H; John G. G Schoenmakers; Ruud N.H Konings (1986-06-25). „Proteiny genu II vláknitých fágů IKe a FT (M13, Fd a Fl) nejsou během replikace virového řetězce funkčně zaměnitelné“. Výzkum nukleových kyselin. 14 (12): 5067–5080. doi:10.1093 / nar / 14.12.5067. ISSN  0305-1048. PMC  311511. PMID  3523440.