Faustovirus - Faustovirus

Faustovirus
Faustovirus.png
Rekonstrukce kryoelektronové mikroskopie faustoviru z EMD-8144[1]
Klasifikace virů
Skupina:
Skupina I (dsDNA )
Rodina:
Asfarviridae
Rod:
Faustovirus

Faustovirus je rod obří virus který infikuje améby spojené s lidmi. Virus byl poprvé izolován v roce 2015[2] a ukázalo se, že má průměr asi 0,2 mikrometru s dvouvláknovou DNA genom 466 kilobází předpovídalo, že kóduje 451 proteinů. Ačkoli je klasifikován jako nukleocytoplazmatický velký DNA virus (NCLDV), faustoviry sdílejí méně než čtvrtinu svých genů s jinými NCLDV; ~ 46% je však homologních s bakteriálními geny a zbytek je osiřelé geny (ORFanoušci).[3] Konkrétně gen kódující major kapsid protein (MCP) faustoviru se liší od proteinu jeho nejblíže příbuzného obrovského viru, asfivirus, stejně jako další NCLDV. V asfiviru je gen kódující MCP jeden genomový fragment o ~ 2000 základní páry (bp),[1] ve faustoviru je však MCP kódován 13 exony oddělenými 12 velkými introny.[4] Exony mají průměrnou délku 149 bp a introny mají průměrnou délku 1 273 bp.[4] Přítomnost intronů v genech faustoviru je pro viry velmi neobvyklá.[1]

Replikace

Strategie replikace faustoviru v amébě je podobná strategii replikace mimivirus. Replikační cyklus, který trvá 18 až 20 hodin, začíná tím, že améba pohltí jednotlivé virové částice procesem známým jako fagocytóza. Po přibližně 2 až 4 hodinách po infekci jsou virové částice internalizovány pomocí fagocytických vakuol a jsou detekovány hostitelem. Zatímco se částice objevují v blízkosti jádra hostitele, neexistují žádné důkazy o tom, že se virus nachází uvnitř jádro nebo má interakci s jadernou membránou.[2] Podobně jako mimivirus, ve kterém je vytvořen kanál pro průchod částicových proteinů a DNA, částice faustoviru vyprázdňují své vnitřní oddíly do améby cytoplazma. U obou virů vede fúze k fáze zatmění ve kterém se obsah částic stane neviditelným uvnitř cytoplazmy hostitele. Fáze zatmění faustoviru je však delší než mimivirus a probíhá 4 až 6 hodin po infekci.[2] Charakterizovaná ztrátou sférického tvaru a zmenšením povrchové plochy prochází hostitelská buňka améby reorganizací, takže 8 až 10 hodin po infekci jsou v oblasti tvořící koblihovitý tvar nové částice. Tato oblast je virální továrna; je odlišný od jádra a je obklopen mitochondrie. Mezi 12 a 18 hodin po infekci zabírá virová továrna celou cytoplazmu, která je zcela naplněna novými virovými částicemi. 18 až 20 hodin po infekci se virové částice uvolňují buňkou lýza.[2]

Patogenita

Faustovirus ovlivňuje améby spojené s lidským prostředím Vermamoeba vermiformis; tato konkrétní améba byla nalezena v nemocničních vodovodních sítích, pitné vodě, vzorcích lidské stolice a kontaktních čočkách keratitida pacientů, takže může být možným nosičem virů.[5] Faustoviry byly nalezeny v odpadních vodách z různých zeměpisných oblastí, jako je Senegal, Francie, Libanon a Saúdská Arábie.[2][6] Izolované kmeny viru byly zjištěny u hlodavců, skotu, febrilní a zdraví lidé a studniční voda a řeky. Ačkoli byl faustovirus nalezen u lidí, není známo, zda má na člověka patogenní účinek; k určení způsobu infekce a následků infekce, pokud existují, je zapotřebí dalšího výzkumu.[6]


Reference

  1. ^ A b C Klose T, Reteno DG, Benamar S, Hollerbach A, Colson P, La Scola B, Rossmann MG (31. května 2016). "Struktura faustoviru, velkého viru dsDNA". Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (22): 6206–11. doi:10.1073 / pnas.1523999113. PMC  4896704. PMID  27185929.
  2. ^ A b C d E Reteno DG, Benamar S, Khalil JB, Andreani J, Armstrong N, Klose T, Rossmann M, Colson P, Raoult D, La Scola B (červenec 2015). „Faustovirus, nová linie obrovských virů infikujících améby související s asfarvirem“. J Virol. 89 (13): 6585–94. doi:10.1128 / JVI.00115-15. PMC  4468488. PMID  25878099.
  3. ^ Chatterjee A, Sicheritz-Pontén T, Yadav R, Kondabagil K (březen 2019). „Genomické a metagenomické podpisy obřích virů jsou všudypřítomné ve vzorcích vody z odpadních vod, vnitrozemských jezer, čistíren odpadních vod a zásobování komunální vodou v indickém Bombaji“. Vědecké zprávy. 9 (1): 3690. doi:10.1038 / s41598-019-40171-r. PMC  6403294. PMID  30842490.
  4. ^ A b Cherif Louazani A, Baptiste E, Levasseur A, Colson P, La Scola B (23. října 2018). „Transkriptomová analýza faustoviru E12 odhaluje komplexní sestřih v genu kapsidy“. Hranice v mikrobiologii. 9: 2534. doi:10.3389 / fmicb.2018.02534. PMC  6247863. PMID  30487777.
  5. ^ Rolland C, Andreani J, Louazani A, Aherfi S, Francis R, Rodrigues R, Silva LS, Sahmi D, Mougari S, Chelkha N, Bekliz M, Silva L, Assis F, Dornas F, Khalil J, Pagnier I, Desnues C , Levasseur A, Colson P, Abrahão J, La Scola B (30. března 2019). „Objev a další studie o virech Gian při infekci IHU Mediterranee, která změnila vnímání virosféry“. Viry. 11 (4): 312. doi:10,3390 / v11040312. PMC  6520786. PMID  30935049.
  6. ^ A b Temmam S, Monteil-Bouchard S, Sambou M, Adbadie-Ladrix M, Azza S, Deloquement P, Bou Khalil J, Baudoin P, Jardot P, Robert C, La Scola B, Mediannikov O, Raoult D, Desnues C (16. prosince 2015). „Asfarvirus podobný faustoviru u hematofágních kousajících komárů a jejich hostitelů obratlovců“. Hranice v mikrobiologii. 6: 1406. doi:10.3389 / fmicb.2015.01406. PMC  4679923. PMID  26733117.